O objetivo deste trabalho foi identificar a microbiota e descrever o perfil de sensibilidade das bactérias aos antimicrobianos em cães com otite externa atendidos em serviço hospitalar médico veterinário. Para isso, foram analisadas 559 amostras otológicas de cães com sinais clínicos de otite externa submetidas à cultura e antibiograma. Houve crescimento de microrganismos em 93,6% (523/559) das amostras, sendo que em 88,5% (463/523) houve crescimento de bactérias, 5,7% (30/523) crescimento de leveduras e 5,7% (30/523) infecções mistas. Foram obtidas 702 cepas, sendo Staphylococcus spp. 55,1% (387/702), Pseudomonas spp. 11,8% (83/702) e Proteus mirabilis 9,8% (69/702) os agentes bacterianos mais isolados. Dentre as leveduras, Malassezia pachydermatis 10,3% (54/523) foi a mais freqüente. Em relação aos resultados do perfil de sensibilidade das bactérias aos antimicrobianos, observou-se que as bactérias Gram-positivas Staphylococcus spp. e Streptococcus spp. apresentaram maior sensibilidade a amoxicilina + ácido clavulânico, com 92,5% e 100% das cepas sensíveis. Já as bactérias Gram-negativas Pseudomonas spp., P. mirabilis e Escherichia coli, apresentaram sensibilidade superior a 90% a tobramicina. Dentre todos os agentes bacterianos, Pseudomonas spp. foi o que demonstrou as maiores taxas de resistência frente a amoxicilina + ácido clavulânico (6,2%), cefalexina (7,4%) e sulfametoxazol + trimetoprima (13,6%). Os resultados do presente estudo indicaram que a maior parte das otites externas em cães está relacionada com infecções bacterianas, demonstrando a importância da realização de cultura bacteriana associada aos testes de sensibilidade aos antimicrobianos para corretos diagnóstico e tratamento dessas infecções.