Germline mutations in BRCA1 and BRCA2 in epithelial ovarian cancer patients in Brazil

Abstract

BackgroundApproximately 8–15% epithelial ovarian cancer patients are BRCA1 or BRCA2 germline mutation carriers. Brazilian inhabitants may have peculiar genetic characteristics associated with ethnic diversity, and studies focusing on the entire BRCA1/BRCA2 gene sequencing in Brazilian ovarian cancer patients are still lacking. The aim of this study was to evaluate BRCA1/2 mutations, through entire gene sequencing, in a Brazilian population of women with epithelial ovarian cancer.MethodsIn a cross sectional study performed in one reference centre for cancer treatment in São Paulo, Brazil, 100 patients diagnosed with epithelial ovarian cancer unselected for family history of breast and/or ovarian cancer were included. The complete coding sequence of BRCA1/2 genes was evaluated through Next-Generation or capillary sequencing. Large deletions were investigated through Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA).ResultsNineteen pathogenic mutations (BRCA1: n = 17 and BRCA2: n = 2) featuring 14 different mutations, including two large deletions in BRCA1 (exon 1–2 deleted and exon 5–7 deleted) were identified. Three mutations were detected more than once (c.3331_3334delCAAG, c.5266dupC and c.4484G > T). Two novel frameshift mutations were identified, one in BRCA1 (c.961_962delTG) and one in BRCA2 (c.1963_1963delC). BRCA1/2 mutations were seen in 35.5% of the patients with first and/or second-degree relatives with breast and/or ovarian cancer. Nineteen variants of uncertain significance (VUS) were detected (BRCA1: n = 2 and BRCA2: n = 17), including five distinct missense variants (BRCA1: c.5348 T > C; BRCA2: c.2350A > G, c.3515C > T, c.7534C > T, and c.8351G > A).ConclusionsAmong epithelial ovarian cancer patients unselected for family history of cancer, 19% were BRCA1/2 germline mutation carriers. Almost ¾ of the BRCA mutations, including two large deletions, were detected only once. Our work emphasizes the need of entire gene sequencing and MLPA screening in Brazil.Electronic supplementary materialThe online version of this article (doi:10.1186/s12885-016-2966-x) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Análise de custo-efetividade de programa para diagnóstico de mutação germinativa em genes BRCA1/2 e de estratégias preventivas para pacientes com câncer de ovário e seus familiares de primeiro grau

“…(106) . (11) (11,106) .142 Tabela 37. Estudos prospectivos para probabilidade de adesão a estratégias preventivas em pacientes portadores de mutação germinativa em BRCA1/2 (18,(107)(108)(109)(110)(111)(112)(113)(114)(115) .…”

“…(breast cancer susceptibility gene 1) e BRCA2 (breast cancer susceptibility gene 2), é a mais frequente, estando presente em até 15 a 19% dos casos de câncer de ovário (10)(11)(12)(13)(14) .…”

“…O segundo grupo de publicações avaliou a adoção de estratégias cirúrgicas preventivas para indivíduos reconhecidamente portadores de mutação germinativa em genes BRCA1/2 (88,92,93 Os objetivos do projeto principal relacionam-se ao reconhecimento do perfil genético de pacientes diagnosticadas com câncer de ovário, ao desenvolvimento de questionário para detecção de fatores associados, à estimativa de risco para mutação em genes BRCA1/2 mediante aplicação de algoritmos de risco e à avaliação de custoefetividade de testes genéticos. Trata-se de um estudo transversal que incluiu amostra de cem pacientes portadoras de câncer de ovário em seguimento em um hospital público de ensino, independentemente de idade e história familiar de neoplasia maligna (11) . O tamanho da amostra não foi estimado previamente ao recrutamento de pacientes por se tratar de um estudo exploratório em que não havia expectativas confiáveis a respeito da prevalência de mutações nesta população nem da taxa de recusas.…”

“…Duas amostras foram avaliadas por ambas técnicas e os resultados demonstraram concordância entre si. O sequenciamento envolveu a totalidade dos genes BRCA1 e BRCA2 (11) .…”

“…A síndrome de câncer hereditário de mama e ovário relacionada à mutação germinativa nos genes BRCA1 (breast cancer susceptibility gene 1) e BRCA2 (breast cancer susceptibility gene 2) é importante causa de câncer de ovário, podendo estar presente em até 15 a 19% dos casos (10)(11)(12)(13)(14) . Em decorrência desta forte associação de risco, diversas sociedades profissionais preconizam o aconselhamento genético e a pesquisa de mutação germinativa para qualquer mulher que desenvolva a neoplasia (10) .…”