Genetic structure of Octopus minor around Chinese waters as indicated by nuclear DNA variations (Mollusca, Cephalopoda)

Abstract

Octopus minor is an economically important resource commonly found in Chinese coastal waters. The nuclear gene (RD and ODH) approach of investigation has not reported in this species. Rhodopsin (RD) and octopine dehydrogenase (ODH) genes were used to elaborate the genetic structure collected from eight localities ranging from the northern to the southern coast of China. In total, 118 individuals for the RD gene and 108 for the ODH were sequenced. Overall (RD and ODH) genes resulted in high (0.741±0.032; 0.805±0.038) haplotype and low nucleotide (0.01261±0.00165; 0.00747±0.00086) diversity. Molecular variance displayed higher values among the populations and lower values within the population where the fixation index FST denoted 0.880 and 0.584 in RD and ODH genes respectively. The Dongshan population clustered separately in a phylogenetic tree as in the haplotype networking assessment. The current data suggests that the Dongshan population needs separate management.

Estructura genética poblacional y filogeografía de Octopus mimus (Cephalopoda: Octopodidae) en el Pacífico oriental tropical determinada mediante loci microsatélites polimórficos

“…Estudios sobre la estimación de la estructura genética poblacional se han realizado en invertebrados marinos (Baird et al, 2012;Kaczmarczyk et al, 2012;Chabot et al, 2015;Riesgo et al, 2019;Yan et al, 2020), en cefalópodos (Pérez-Losada et al, 2002;Garoia et al, 2004;Zheng et al, 2009;Smith et al, 2015); en pulpos (Casu et al, 2002;Cabranes et al, 2007;Juárez et al, 2010;Larson et al, 2015;Gao et al, 2016;Muhammad et al, 2018). En estos estudios se reportaron niveles bajos y moderados de estructura genética.…”

“…microsatélites. Por el contrario, con marcadores nucleares,Domínguez-Contreras et al (2018) analizaron la estructura genética de tres especies que se distribuyen en el noroeste del Pacífico mexicano (O.Otros estudios enfocados en especies de pulpos han encontrado de moderada a alta diferenciación genética poblacional y sus valores son comparables con los obtenidos en el presente estudio Muhammad et al (2018). obtuvieron una alta estructura poblacional (FST = 0.880, P < 0.05) en O. minor con base en los marcadores mitocondriales rodopsina y octopina deshidrogenasa.…”