Genetic diversity of extraintestinal Escherichia coli strains producers of β-lactamases TEM, SHV and CTX-M associated with health-care

Abstract

Millán: caracterización fenotípica y molecular de las cepas estudiadas, análisis bioinformático María Araque: diseño del estudio y discusión crítica Todas las autoras participaron en la escritura del manuscrito. Introducción. En Venezuela existen pocos reportes que describan las bases genéticas del potencial patogénico y filogenético de las cepas de Escherichia coli provenientes de hospitales. Objetivo. Determinar la diversidad genética de cepas extraintestinales de E. coli productoras de las betalactamasas TEM, SHV y CTX-M asociadas a la atención de salud. Materiales y métodos. Se estudió una colección de 12 cepas extraintestinales de E. coli con sensibilidad disminuida a las cefalosporinas de amplio espectro. La sensibilidad antimicrobiana se determinó por concentración inhibitoria mínima. La detección de los grupos filogenéticos, de los factores de virulencia y de los genes que codifican la resistencia antimicrobiana se hizo mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa y la relación clonal se estableció mediante reacción en cadena de la polimerasa de elementos palindrómicos extragénicos repetitivos (Repetitive Element Palindromic-PCR, rep-PCR). Diversidad genética de cepas extraintestinales deResultados. Todas las cepas analizadas presentaron resistencia a las cefalosporinas, y resistencia conjunta a quinolonas y aminoglucósidos. La distribución filogenética evidenció que los grupos A y B1 fueron los más frecuentes, seguidos por D y B2; en este último, se detectaron todos los factores de virulencia evaluados, y el gen más frecuente fue el fimH. En todas las cepas analizadas, se encontró bla CTX-M , con predominio de las bla CTX-M-8 , y en dos de estas cepas se evidenció la presencia simultánea de bla CTX-M-9 , variantes bla CTX-M-65 y bla CTX-M-147 . Conclusión. Las cepas estudiadas demostraron diversidad genética y albergaron diferentes genes de virulencia y betalactamasas de espectro extendido (BLEE) sin predominio de ningún filogrupo en particular. Este estudio constituye el primer reporte de la variante bla CTX-M-65 en Venezuela y de la variante bla CTX-M-147 en el mundo, en cepas no relacionadas genéticamente aisladas de hospitales, situación que merece atención y la racionalización del uso de los antimicrobianos.Palabras clave: Escherichia coli; infección hospitalaria; betalactamasas; filogenia; reacción en cadena de la polimerasa.doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v37i3.3324 Genetic diversity of extraintestinal Escherichia coli strains producers of beta-lactamases TEM, SHV and CTX-M associated with healthcareIntroduction: There are few reports from Venezuela describing the genetic basis that sustains the pathogenic potential and phylogenetics of Escherichia coli extraintestinal strains isolated in health care units. Objective: To establish the genetic diversity of extraintestinal E. coli strains producers of betalactamases TEM, SHV and CTX-M associated with healthcare. Materials and methods:We studied a collection of 12 strains of extraintestinal E. coli with diminished sensitivity ...

Distribución de grupos filogenéticos, factores de virulencia y susceptibilidad antimicrobiana en cepas de Escherichia coli uropatógena

“…En Venezuela son escasos los estudios que describen las bases genéticas que sustentan el potencial patogénico de los grupos filogenéticos de ECUP 12,14,15 . Por tal motivo, en este trabajo se relacionó la susceptibilidad antimicrobiana, distribución de los grupos filogenéticos y genes de virulencia en cepas de ECUP aisladas de pacientes adultos con ITU.…”