La Infección Respiratoria Aguda (IRA) se encuentra dentro de las cinco primeras causas de morbilidad en primera infancia en el municipio de Suaza, Huila. Aunque se realizan acciones en salud pública encaminadas a la protección de la madre y el menor, no se presenta una disminución estadísticamente significativa en la incidencia de la patología. Con el fin de establecer los factores asociados a la presentación de la enfermedad, se realizó un estudio de casos y controles prospectivo entre marzo y abril de 2011. Los casos fueron niños menores de cinco años con diagnóstico de IRA según lo estipulado en el protocolo de vigilancia en salud pública para IRA y los criterios del CIE 10; los controles eran niños sin diagnóstico de IRA en el mismo grupo de edad, vecinos de los casos. Se estudiaron 176 menores de cinco años (88 casos y 88 controles), encontrándose mayor incidencia de la patología en la zona rural. No se hallaron factores de riesgo asociados a IRA y contrario a lo esperado, se presentaron como factores protectores: ingreso menor a un salario mínimo legal mensual (OR= 0,49; IC95 %: 0,24–0,97; ji = 4,24; p= 0,039), y bajo peso del niño al nacer (OR= 0,48; IC95 %:0,26– 0,87; ji = 5,87; p = 0,01). Aunque no se encontraron factores de riesgo para la presentación de la patología, no se puede asegurar que no existan, por esto se requieren nuevos estudios, donde se prolongue el tiempo de investigación y aumente el tamaño de muestra.