Evaluation of Esterase Polymorphisms in Mature Seeds of Radish (Raphanus Sativus L.) Accessions of Vir Collection

Rudakova, Angela; Рудаков, Сергей; Артемьева, А. М.; Курина, А. Б.; Kocherina, N. V.; Чесноков, Ю. В.

doi:10.18619/2072-9146-2017-5-3-8

Cited by 4 publications

(7 citation statements)

References 0 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Следовательно, наличие у этих образцов редко встречающихся эстеразных зон связано с особенностями их селекции или агробиологической принадлежностью, что согласуется с результатами других работ (15)(16)(17)39). Так, нами (15)(16)(17) впервые была показана возможность использования оценки полиморфизма изоферментных форм эстераз для установления генетического полиморфизма не только у редиса (Raphanus sativus L.) и линий удвоенных гаплоидов Brassica rapa L., но и у гексаплоидной яровой пшеницы (Triticum aestivum L.). Схожие результаты были получены и при изучении полиморфизма различных сортов пшеницы (Triticum L.) (39).…”

Section: результаты расчета гетерозиготности популяции и дисперсии геunclassified

“…Такими биохимическими генетическими маркерами могут быть неспецифичные эстеразы (НЭ) -комплекс ферментов, гидролизующих эфирные связи (ЕС 3.1.1.) (15)(16)(17). Известно, что в растениях эстеразный комплекс имеет внутривидовую специфичность, кроме того, этим ферментам свойственна тканевая специфичность (18)(19)(20).…”

unclassified

See 1 more Smart Citation

POLYMORPHISM OF ESTERASE ISOENZYMES OF RIPE SEEDS OF SAMPLES OF RADISH (Raphanus sativus L.)

Rudakova

2020

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

Существующие внутривидовые классификации делят образцы редьки посевной (Raphanus sativus L.), проявляющие широкое разнообразие морфологических признаков, по географическому принципу в зависимости от региона происхождения (Европа, Китай, Япония). Вместе с тем известно, что в растениях комплекс ферментов, гидролизующих эфирные связи (эстеразный комплекс), имеет внутривидовую и тканевую специфичность. Ранее образцы из коллекций генетических ресурсов редьки посевной никогда не оценивались на наличие изоферментных форм эстераз в зрелых семенах этой культуры. Установление общей изменчивости изоферментных систем и выявление их генетического контроля позволяют вскрывать тонкие механизмы взаимоотношения организма с окружающей средой и гомеостаза, что особенно важно при длительном хранении образцов в генетических коллекциях семян. Существенное значение имеет и разработка эффективных биохимических маркеров для экспресс-оценки коллекционного, а также генетически и селекционно значимого материала. Проведение подобного рода работ позволяет восполнить пробел, существующий в отношении образцов генетических ресурсов редьки посевной. В настоящей работе мы впервые исследовали изоферментные формы эстераз в зрелых семенах редьки посевной и на основе полученных данных построили дендрограммы, определяющие филогенетические отношения образцов из мировой коллекции ВИР и соответствующие их ботаническому, агробиологическому и географическому положению. Была установлена средняя гетерозиготность изоферментных форм эстераз в изученных образцах и их дисперсия, указывающие на достоверность полученных результатов. Цель работы-оценить полиморфизм эстераз в зрелых семенах редьки, его зависимость от происхождения и агробиологической принадлежности образцов, а также возможность использования эстераз в качестве биохимических маркеров разнообразия вида Raphanus sativus L. Из коллекции Всероссийского института генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова (ВИР) были отобраны 49 образцов редьки, принадлежащие к трем подвидам, разделенным по географическому принципу,-редька китайская, японская и европейская. Эстеразные изоферменты разделяли методом нативного электрофореза в полиакриламидном геле. Для обнаружения изоферментов гель отмывали в реактиве на неспецифическую эстеразу. Полученные зимограммы сканировали (Epson Expression 10000XL, «GE Healthcare», США). Определяли гетерозиготность популяции Hl по каждому локусу, среднюю (общую) гетерозиготность Hобщ., дисперсии гетерозиготности Var(Hl) по каждому локусу и дисперсию средней гетерозиготности внутри популяции Var(Hобщ.). Основными морфологическими и фенологическими маркерами для внутривидового деления R. sativus на разновидности и сортотипы были форма и окраска корнеплода и продолжительность вегетационного периода. По своему эстеразному составу все образцы подразделились на 7 зимотипов, отличающихся наличием или отсутствием тех или иных зон. Всего в эстеразном комплексе семян редьки было обнаружено 5 основных изоферментов с разной молекулярной массой, варьирующей от 45,3 кД до 35,0 кД. Все пять зон...

show abstract

Section: результаты расчета гетерозиготности популяции и дисперсии геunclassified

unclassified

POLYMORPHISM OF ESTERASE ISOENZYMES OF RIPE SEEDS OF SAMPLES OF RADISH (Raphanus sativus L.)

Rudakova

2020

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…В итоге было бы крайне важно определить функции генов, влияющих на их проявление, молекулярно-генетические механизмы экспрессии и, наконец, охарактеризовать молекулярную изменчивость геномов внутри и за пределами вида. Интересно отметить, что схожие данные ранее нами были получены для пшеницы (29) и редиса (30), у которых также выявлен полиморфизм между образцами перспективного селекционного материала по спектрам изоферментных форм эстераз зрелых семян. Кроме того, эти результаты перекликаются с описанными при анализа эстеразно-липазного генного семейства у Arabidopsis thaliana (49) и Olea europaea (50).…”

Section: показатели гетерозиготности и ее дисперсии у линий картирующunclassified

“…В то же время в отсутствие других известных маркеров изоформ эстераз в перспективе для рутинного скрининга селекционного или иного генетического материала можно конвертировать AFLP маркеры, расположенные в пиках выявленных QTL, в SCAR или CAPS маркеры. Все это позволяет снять вопрос о надежности и воспроизводимости результатов при использовании маркеров, полученных с использованием определенного генетического материала, поскольку такой вопрос возникает очень часто, если не всегда (29)(30)(31). Различное положение локусов количественных признаков селекционного интереса в упомянутых популяциях DH30 и DH38 отмечено во многих исследованиях, что совершенно естественно, так как генетически популяции различны (31).…”

unclassified

QTL MAPPING OF ESTERASE ISOZYME FORMS IN Brassica rapa L. MATURE SEEDS

Rudakova¹

2019

s-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

С 1960-х годов изоферменты хорошо известны как одни из наиболее распространенных биохимических маркеров. Установление общей изменчивости изоферментных систем и выявление их генетического контроля сохраняют актуальность, позволяя вскрывать тонкие механизмы взаимоотношения организма с окружающей средой и гомеостаза и разрабатывать эффективные биохимические маркеры для экспресс-оценки генетически и селекционно значимого материала. В представленной работе нами впервые идентифицированы и картированы локусы хромосом, отвечающие за проявление активности 13 различных изоформ эстераз зрелых семян у Brassica rapa L. В исследовании использовали линии удвоенных гаплоидов двух картирующих популяций -DH30 и DH38. Все выявленные изоформы эстераз по электрофоретической подвижности подразделялись на три группы. Группа изоформ А1-А3 обладала большой молекулярной массой и малой электрофоретической подвижностью, группа изоформ В1-В7 характеризовалась средней молекулярной массой и проявляла среднюю электрофоретическую подвижность, группу С1-С3 составляли изоформы с малой молекулярной массой и, соответственно, наибольшей электрофоретической подвижностью. Каждая из родительских форм (как и каждая из исследованный линий картирующих популяций) имела уникальный электрофоретический спектр изоформ эстераз. На основании полученных электрофоретических данных для обеих популяций был проведен QTL-анализ и установлены локусы хромосом, определяющие проявление каждой изоформы эстеразы, выявленной у линий картирующих популяций DH30 и DH38. Использованный подход множественного интервального QTLкартирования (composite interval mapping) в сочетании с тестом пермутации (1000 повторений) при уровне статистической значимости p < 0,05 позволил идентифицировать и локализовать на хромосомах локусы (QTL, quantitative trait loci), определяющие проявление всех изоформ эстераз, идентифицированных методом гель-электрофореза. Исключение составили изоформы А1 для популяции DH38 и изоформы В7 для популяции DH30, для которых мы не получили результатов QTLанализа из-за малого объема исходных данных по этим изоформам у соответствующей картирующей популяции. Всего картировали 35 QTL изоформ эстераз в случае картирующей популяции DH30 и 39 QTL для популяции DH38. В результате проведенного QTL-анализа выявили молекулярные маркеры, генетически сцепленные с идентифицированными локусами, и рассчитали процент фенотипической изменчивости, определяемый каждым из выявленных QTL. По данным изоферментного анализа был проведен расчет гетерозиготности для обеих популяций в каждом локусе H l и общей гетерозиготности H общ. , а также дисперсии гетерозиготности Var(H l ) по одному локусу и дисперсии средней гетерозиготности внутри каждой из популяций Var(H общ. ). Выявленная гетерозиготность рассматривалась как средняя порция локусов с двумя различными аллелями в одном локусе у одной особи и могла быть определена как наблюдаемая гетерозиготность, характеризующая часть генов, по которым изучаемая популяция гетерозиготна. Показано, что в изученных популяциях линий удвоенных гаплоидов QT...

show abstract

unclassified

ПОЛИМОРФИЗМ ЭСТЕРАЗНЫХ ИЗОФЕРМЕНТОВ В ЗРЕЛЫХ СЕМЕНАХ РЕДЬКИ ПОСЕВНОЙ (Raphanus sativus L.)

Rudakova¹,

Moldova²

2020

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

Evaluation of Esterase Polymorphisms in Mature Seeds of Radish (Raphanus Sativus L.) Accessions of Vir Collection

Cited by 4 publications

References 0 publications

POLYMORPHISM OF ESTERASE ISOENZYMES OF RIPE SEEDS OF SAMPLES OF RADISH (Raphanus sativus L.)

POLYMORPHISM OF ESTERASE ISOENZYMES OF RIPE SEEDS OF SAMPLES OF RADISH (Raphanus sativus L.)

QTL MAPPING OF ESTERASE ISOZYME FORMS IN Brassica rapa L. MATURE SEEDS

ПОЛИМОРФИЗМ ЭСТЕРАЗНЫХ ИЗОФЕРМЕНТОВ В ЗРЕЛЫХ СЕМЕНАХ РЕДЬКИ ПОСЕВНОЙ (Raphanus sativus L.)

Contact Info

Product

Resources

About