How to Cite This ArticleAl-Farha AAB, Hemmatzadeh F, Tearle R, Jozani R, Hoare A, PetrovskI K: Comparison of culture and PCR for detection of field isolates of bovine milk mollicutes. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 26 (3): 337-342, 2020.
AbstractMycoplasma mastitis raises significant concerns in the dairy industry worldwide. The study objective was to develop an accurate and rapid screening method for identification of field isolates of Mycoplasma and Acholeplasma species and investigate relative merits of conventional microbial culture versus PCR-based method for detecting Mycoplasma and Acholeplasma species in bovine milk. A total of 368 milk samples collected at individual cow level from a single dairy farm in South Australia, 192 (52%) tested positive for mollicutes using a conventional culturebased method. DNA extracted directly from milk and used for amplification through specifically designed universal mollicutes PCR-based method. Of them, 269 (73%) tested positive. Sequencing results of 30 positive samples targeting the 16S rRNA gene, showed five different mollicutes species involved, including Acholeplasma laidlawii, Acholeplasma axanthum, Mycoplasma arginini, Mycoplasma bovirhinis, Mycoplasma bovis. According to these results, species-specific PCR was conducted on all samples. DNA amplifications using species-specific PCR yielded 256 (70%) positive mollicutes samples. The developed universal PCR demonstrated best concordance with species-specific PCR (Cohen's Kappa = 0.747±0.031). Co-infection by two or more of the above-mentioned mollicutes showed highest prevalence. It is recommended surveying mollicutes using the universal PCR used in this study. The PCR system used in this study showed significant rapidity and sensitivity compared to the conventional bacteriological culture method for screening Mycoplasma and Acholeplasma species in dairy herds.
ÖzMycoplasma mastitisleri dünya çapında süt endüstrisinde önemli sorunlara yol açmaktadır. Çalışmanın amacı, Mycoplasma ve Acholeplasma türlerinin saha izolatlarının tanımlanması için doğru ve hızlı bir tarama yöntemi geliştirmek ve inek sütünde Mycoplasma ve Acholeplasma türlerinin saptanması için PCR tabanlı yönteme karşı geleneksel mikrobiyal kültürün göreceli değerlerini araştırmaktı. Güney Avustralya'daki tek bir süt çiftliğinden toplanan toplam 368 bireysel süt örneğinden 192 (%52)'sinde geleneksel kültür bazlı yöntem ile molliküt varlığı pozitif bulundu. Doğrudan sütten ekstrakte edilen DNA, özel olarak tasarlanmış evrensel molliküt PCR bazlı yöntemle amplifikasyon için kullanıldı. Bu örneklerden 269'u (%73) pozitif bulundu. 16S rRNA genini hedefleyen 30 pozitif örneğin sekanslama sonuçlarına göre, Acholeplasma laidlawii, Acholeplasma axanthum, Mycoplasma arginini, Mycoplasma bovirhinis, Mycoplasma bovis olmak üzere beş farklı molliküt türü belirlendi. Bu sonuçlara göre, tüm numuneler üzerinde türe özgü PCR gerçekleştirilmiştir. Türe özgü PCR kullanılarak gerçekleştirilen DNA amplifikasyonları 256 (%70) örnekte molliküt pozitif sonuç verdi. Geliştirilen ev...