Enterovirus D68 in Viet Nam (2009-2015)

Abstract

We have demonstrated for the first time EV-D68 has been circulating at low levels in Viet Nam since 2008, associated with moderate acute respiratory infection in children. EV-D68 in Viet Nam is most closely related to Asian viruses, and clusters separately from recent US and European viruses that were suggested to be associated with acute flaccid paralysis.

Enterovirus infection in the Socialist Republic of Vietnam

“…Суммируя данные по идентификации энтеровирусов, опубликованные разными исследовательскими центрами [6,7,15,22,24,34], можно констатировать, что в период 1997-2016 гг. во Вьетнаме у больных с различными формами ЭВИ были выявлены неполиомиелитные вирусы 4 видов, не менее 36 типов: Enterovirus A: Коксаки А2 (CVA2), CVA4, CVA5, CVA6, CVA8, CVA10, CVA12, CVA14, CVA16, EV-A71, EV-A90; Enterovirus B: CVA9, Коксаки В1 (CVB1), CVB2, CVB3, CVB4, CVB5, ЕСНО3 (Е3), Е4, E5, Е6, Е7, Е9, Е11, Е12, Е13, Е16, Е18, Е19, Е24, Е25, Е27, Е30; Enterovirus С: CVA24, EV-C96; Enterovirus D: EV-D68.…”

“…У больных энтеровирусной экзантемой полости рта и конечностей наиболее часто были обнаружены вирусы EV-A71, CA16, CA6, CA10, реже -вирусы СА2, СА4, СА5 СА8, СА12 и другие вирусы вида Enterovirus A, редко -вирусы вида Enterovirus B [6,7,15,24]. У больных с заболеваниями центральной нервной системы (преимущественно менингиты и энцефалиты) вместе с энтеровирусом EV-A71 часто выявлялись энтеровирусы Е30, Е4 и другие представители вида Enterovirus B. У пациентов с респираторными формами ЭВИ чаще других энтеровирусов обнаруживался EV-D68 [7,22].…”

“…Внимание к этому возбудителю возросло, когда в 2014 г. в США увеличилось число случаев острых вялых параличей, предположительно этиологически связанных с этим вирусом [14,19]. В целях изучения циркуляции EV-D68 во Вьетнаме было исследовано 5863 образца от пациентов с респираторными и неврологическими заболеваниями, собранных в 2009-2015 гг., включая материал от 624 пациентов с положительным результатом тестирования на энтеровирусы и риновирусы [22]. EV-D68 был обнаружен у 21 лица, что составило 3,4% от числа пациентов с энтеровирусной или риновирусной инфекцией и 0,4% от всех обследованных.…”

“…При проведении филогенетического анализа было выявлено несколько генетических вариантов вьетнамских штаммов EV-D68, относящимся к генотипам В1 и А2, что свидетельствовало о нескольких заносах этого вируса на территорию страны. Все вьетнамские штаммы вируса EV-D68 имели близкое генетическое родство со штаммами из Азии и значительно отличались от вирусов этого типа, выделенных в США и Европе от больных с острыми вялыми параличами [22]. Результаты проведенного исследования указывали на то, что уровень циркуляции энтеровируса EV-D68 во Вьетнаме в указанный промежуток времени был невысок и, по-видимому, не повлиял на рост заболеваемости тяжелыми формами ЭВИ.…”

Enterovirus D68: molecular biological characteristics, features of infection

“…Число последовательностей VP1 EV-D68 из разных географических областей мира, включая Азию, Африку, Европу, Океанию и США, депонированых в GenBank, превышает в настоящее время две тысячи. EV-D68 -генетически вариабельный вирус со скоростью замещения нуклеотидов, подобной другим энтеровирусам и равной 6,2310 -3 или 5.12310 -3 замены на сайт в год в гене VP1 [19,24]. Мутации накапливаются в первую очередь в двух конкретных регионах гена VP1: петлях BC и DE [5].…”