Enrichment of Cell‐Targeting and Population‐Specific Aptamers by Fluorescence‐Activated Cell Sorting

Raddatz, Marie-Sophie L.; Dolf, Andreas; Endl, Elmar; Knolle, Percy A.; Famulok, Michael; Mayer, Günter

doi:10.1002/anie.200800216

Cited by 163 publications

(120 citation statements)

References 21 publications

Supporting

Mentioning

110

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Thereby, DNA aptamers against Burkitt lymphoma cells were successfully selected. 21 However, using this technique, several important target specific aptamers, which were taken up in the cells during the selection, can also be eliminated. This is disadvantageous particularly in the early rounds of selection, since the target binding sequences are not enriched in a sufficient amount.…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

Microfluidic chip system for the selection and enrichment of cell binding aptamers

Stoll¹,

Kiessling

Stelzle

et al. 2015

Biomicrofluidics

View full text Add to dashboard Cite

Aptamers are promising cell targeting ligands for several applications such as for the diagnosis, therapy, and drug delivery. Especially, in the field of regenerative medicine, stem cell specific aptamers have an enormous potential. Using the combinatorial chemistry process SELEX (Systematic Evolution of Ligands by Exponential enrichment), aptamers are selected from a huge oligonucleotide library consisting of approximately 10 15 different oligonucleotides. Here, we developed a microfluidic chip system that can be used for the selection of cell specific aptamers. The major drawbacks of common cell-SELEX methods are the inefficient elimination of the unspecifically bound oligonucleotides from the cell surface and the unspecific binding/uptake of oligonucleotides by dead cells. To overcome these obstacles, a microfluidic device, which enables the simultaneous performance of dielectrophoresis and electrophoresis in the same device, was designed. Using this system, viable cells can be selectively assembled by dielectrophoresis between the electrodes and then incubated with the oligonucleotides. To reduce the rate of unspecifically bound sequences, electrophoretic fields can be applied in order to draw loosely bound oligonucleotides away from the cells. Furthermore, by increasing the flow rate in the chip during the iterative rounds of SELEX, the selection pressure can be improved and aptamers with higher affinities and specificities can be obtained. This new microfluidic device has a tremendous capability to improve the cell-SELEX procedure and to select highly specific aptamers. V C 2015 AIP Publishing LLC. [http://dx

show abstract

Section: Resultsmentioning

confidence: 99%

Microfluidic chip system for the selection and enrichment of cell binding aptamers

Stoll¹,

Kiessling

Stelzle

et al. 2015

Biomicrofluidics

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Ап-тамер представляет собой короткую олигонукле-отидную последовательность, которая связыва-ется с соответствующими лигандами с высоким сродством и специфичностью [23]. Аптамеры могут специфически связываться с пептидами, белками, лекарственными препаратами, органи-ческими и неорганическими молекулами и даже целыми клетками [24][25][26][27]. С помощью техноло-гии систематической эволюции лигандов экспо-ненциальным обогащением SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment) по-лучены аптамеры с высоким сродством к ЕРСs, которые после иммобилизации на полимерных дисках в экспериментах in vitro продемонстри-ровали эффективный захват ЕРСs, дифферен-циирующиеся в эндотелий-подобные клетки в течение 10 дней [28].…”

Section: эндотелизация In Situ с помощью захвата эн-дотелиальных прогunclassified

Surface Modification of Bare-Metal Stents for Preventing Restenosis (Part 2)

Лотков¹,

Матвеева²,

Антонова³

et al. 2017

Kompleks. probl. serdečno-sosud. zabol.

View full text Add to dashboard Cite

Резюме. Вторая часть обзора посвящена вариантам модификации металлических стентов для ускоре-ния эндотелизации in situ. Представлены разработки. направленные на захват эндотелиальных прогени-торных клеток из кровотока с помощью специфических антител. Описаны возможности улучшения адгезии и интеграции эндотелиальных клеток на поверхности за счет формирования сайтов клеточного распозна-вания и имитация структур внеклеточного матрикса. Проанализированы различные способы физической и химической модификации, способствующие созданию условий для скорейшего формирования функцио-нально состоятельного эндотелиального слоя на искусственных поверхностях. Определен круг проблем и ограничений в использовании каждого из методов.Ключевые слова: металлические стенты, рестеноз, модификация поверхности, эндотелизация. Here we review the modifications of the metal stents to enhance in situ endothelialization, particularly antibody-mediated adhesion of endothelial progenitor cells. We focus on the strategies employing cell adhesion molecules and extracellular matrix proteins. We also encompass other physical and chemical approaches for surface biofunctionalization with their advantages and shortcomings. SURFACE MODIFICATION OF BARE-METAL STENTS FOR PREVENTING RESTENOSISKeywords: bare-metal stents, restenosis, surface modification, endothelialization НИИ КПССЗ имеет большой опыт в разработке изделий для сердечно-сосудистой хирургии, в частности биопротезов кла-панов сердца и сосудов. С 2010 года под руководством академика РАН л. С. Барбараша начаты исследования по созданию био-резорбируемых сосудистых протезов малого диаметра. Основная цель -создание полимерных конструкций с бионаправленным действием, способных заменить отдельные структуры живого организма, в частности сердечно-сосудистой системы. Научная но-визна поставленной задачи заключается в использовании нового подхода создания органа непосредственно в организме пациента за счет биофункциональности и биорезорбируемости полимерных конструкций. доказана долгосрочная проходимость полимерных сосудистых графтов на основе поликапролактона и композиции полигидроксибутирата/валерата и поликапролактона. В экспери-ментах in vitro доказано, что ростовые факторы, инкорпорируемые в состав биодеградируемых графтов, сохраняют свою био-логическую активность. В долгосрочных экспериментах in vivo доказано, что сосудистый эндотелиальный фактор роста ускоряет эндотелизацию и улучшает проходимость биодеградируемых полимерных сосудистых графтов.Ключевые слова: биодеградируемые полимеры, сосудистый графт, ростовые факторы. DEVELOPMENT OF TISSUE ENGINEERED SMALL DIAMETER VASCULAR GRAFT FOR THE CARDIOVASCULAR SURGERY NEEDS L. V. ANTONOVA, YU. A. KUDRYAVTSEVA Federal State Budgetary Scientific Institution Research Institute for Complex Issues of Cardiovascular Diseases. Kemerovo, RussiaRICICd has large experience in the development of products for cardiovascular surgery, in particular, the bioprosthesis heart valves and blood vessels. Since 2010, under the leadership of the academician of RAS L. S. Bar...

show abstract

“…This method does not require prior knowledge of targets and would, in principle, generate nucleic acid aptamers for multiple targets simultaneously on the cell surface. Until now, nucleic acid aptamers specific to a number of cell lines, including a T-cell line (human acute lymphoblastic leukemia), B-cell line (human Burkitt lymphoma), and mouse liver hepatoma cell line, have been reported [Shangguan et al, 2006;Raddatz et al, 2008;Shangguan et al, 2008]. One problem with the conventional SELEX technique is that undesired sequences bind to the solid support such that the target becomes immobilized, causing negative selection to be performed.…”

Section: Cell-selexmentioning

confidence: 99%

“…Dead cells are known to strongly and independently absorb nucleic acid sequences, interfering with enrichment of the target aptamers. To solve this problem, a method using fluorescence-activated cell sorting (FACS) has been developed [Raddatz et al, 2008]. Use of FACS enables dead cells to be removed and active and inactive species to be separated at the same time.…”

Section: Cell-selexmentioning

confidence: 99%