Elucidation of a Conserved Proteomic Pattern of Breast Cancer Tissue and Metastatic Axillary Lymph Node

Abstract

RezumatObiectiv: Cancerul de sân este unul dintre cele mai devastatoare tipuri de cancer care afectează femeile. Pentru luarea deciziilor critice cu privire la soarta ţesutului mamar canceros, este necesară evaluarea implicării ganglionilor limfatici axilari (ALN). Cu toate acestea, o astfel de implicare ALN este dificil de prezis fără intervenţia chirurgicală. Prin urmare, un test uşor de predicţie care utilizează markeri de proteine poate fi o abordare dorită. În acest studiu, am efectuat o analiză completă a proteinomei pentru a descoperi modelul de exprimare a proteinelor legate de tumori în cancerul de sân primar. Metode şi Materiale: Proteinele au fost extrase din ţesuturile tumorale şi au fost supuse unei electroforeze în gel de poliacrilamidă în două dimensiuni (2D). Imaginile de gel rezultate au fost utilizate pentru compararea spoturilor inter-gel utilizând software-ul PDQuest Advance. Modelele obţinute au fost utilizate pentru diferenţierea tipurilor tumorale invazive de la cele neinvazive. Rezultate: 24 de pete de proteine conservate ale căror intensităţi au fost moderat reglementate înalt pe geluri. Aceste pete de proteine au fost folosite pentru a crea un model conservat 2D care acoperă un interval de pH de la 4 la 8. Concluzie: Punctele proteice care generează un model conservat între cancerul de sân primar şi ganglionul limfatic axilar au indicat că o abordare proteomică robustă şi foarte fiabilă, de exemplu 2DE, poate fi utilizată pentru a diferenţia forme metastatice de cancer de sân de la cele nemetastatice. Elucidation of a Conserved Proteomic Pattern of Breast Original ArticleCuvinte cheie: cancer de sân, axilar, ganglion limfatic, 2D, proteomică AbstractObjective: Breast cancer is one of the most devastating cancer types affecting women. For critical decision making regarding the fate of cancerous breast tissue, the assessment of axillary lymph node (ALN) involvement is required. However, such ALN involvement is difficult to predict without surgical intervention. Therefore, an easy predictive test using protein markers may be a desirable approach. In this study, we performed a whole proteome analysis to reveal the presence of a putative biomarker panel using primary breast tumor tissue. Materials and Methods: Proteins were extracted from tumor tissues and were subjected to two dimensional (2D) gel electrophoresis. The resulting gel images were used for inter-gel spot comparisons using PDQuest Advance software. The paterns thus obtained were used for differentiating invasive tumor types from non-invasive ones.Results: The analysis of 2D gel images revealed the presence of 24 conserved protein spots whose intensities were moderately regulated high on the gels. Those protein spots were used to create a conserved 2D pattern spanning a pH range of 4 to 8. Conclusion: Protein spots generating a preserved model among pattern between primary breast cancer and its axillary lymph node indicated that a robust and highly reliable proteomic approach, e.g., 2DE may be used to differentiate metastatic fo...