Effects of Strain, Host, Time of Harvest, and Virus Concentration on Double-Stranded RNA Analysis of Citrus Tristeza Virus

Extracción y purificación de dsRNAs largos de plantas infectadas con virus y hongos; aplicación en la detección e identificación de virus

“…Satellite RNA viruses, satellite RNAs, and DI RNAs can attenuate or enhance the symptoms caused by their parent virus (Pathak and Nagy, 2009;Habili and Kaper, 1981). Some satellite viruses and RNAs associated with plant viruses accumulate relatively large quantities of dsRNA (Diaz-Ruiz and Dodds et al, 1984;Habili and Kaper, 1981;1987). In fungi, dsRNA satellites have been associated with several dsRNA viruses (Liu et al, 2015;Romanos et al, 1981), and satellite dsRNAs have been reported in Sclerotinia sclerotiorum (Liu et al, 2015).…”

“…Los virus ARN satélite, los ARN satélite y los ARN DIs pueden atenuar o aumentar los síntomas causados por su virus progenitor (Pathak y Nagy, 2009; Habili y Kaper, 1981). Algunos virus satélite y ARN asociados con fitovirus acumulan cantidades relativamente grandes de dsRNA (Diaz-Ruiz y Dodds et al, 1984;Habili y Kaper, 1981;Valverde y Dodds, 1986;1987). En los hongos, los satélites dsRNA se han asociado con diversos virus dsRNA (Liu et al, 2015;Romanos et al, 1981), y se han reportado dsRNAs satélite en Sclerotinia sclerotiorum (Liu et al, 2015).…”

“…This has been shown with various strains of Tobacco mosaic virus satellite (Valverde and Dodds, 1987). Moreover, gel electrophoretic profiles of viral dsRNA have been used to differentiate strains of Tomato mosaic virus , CMV (Valverde et al, 1990a), and CTV (Dodds et al, 1987). Nevertheless, in plants, members of the viral Torre, et al, 2014;Demler y Zoeten, 1989;Dodds, 1982;Falk et al, 1979;Okada et al, 2011;Valverde y Dodds, 1986;Valverde et al, 1995;Ward et al, 2009) y hongos (Azzam y Gonsalves, 1999;Deng y Boland, 2004;Kousik et al, 1994;Feldman et al 2012;Pecina et al, 2000;Shamoun et al, 2008).…”

“…Jordan and Dodds used TMV dsRNA to develop P32 endlabelled ssRNA probes and used them successfully in molecular hybridization experiments. Nonradioactive probes have also been prepared by direct labelling ssRNA using dsRNA as the et al, 1986), CMV (Valverde et al, 1990a), y CTV (Dodds et al, 1987). No obstante, en las plantas, los miembros de las familias virales Potyviridae y Luteoviridae generan bajas cantidades de RF y dsRNAs subgenómicos (Creamer and Falk, 1989;Dale et al, 1986;, lo cual hace que su detección mediante análisis electroforéticos resulte impráctica.…”

Epidemiología de Plum pox virus y Citrus tristeza virus en bloques de plantas de vivero. Métodos de control

“…Esta técnica está siendo evaluada para ser incorporada al nuevo protocolo internacional IPPC-FAO para la detección de CTV, siendo éste uno de los objetivos de esta Tesis Doctoral. Para la caracterización molecular de aislados de CTV se han utilizado varios procedimientos entre ellos: 1) el patrón de los dsRNA (Dodds et al, 1987;Moreno et al, 1990;Guerri et al, 1991;, 2) hibridación tomando como patrón ADNc o ARNc de varias regiones del ARNg de CTV (Rosner y Bar-Joseph, 1984;Rosner et al, 1986;Albiach-Martí et al, 2000;Narváez et al, 2000), 3) utilización de la técnica RFLP ("Restriction Fragment Length Polymorphism") para el análisis del gen que codifica la proteína de la cápsida (Gillings et al, 1993;Roy et al, 2003), 4) utilización de patrones de amplificación mediante RT-PCR con iniciadores de PCR específicos de diferentes genotipos de CTV (Hilf et al, 1999. Más recientemente se han publicado trabajos que proponen la técnica RT-PCR a tiempo real para distinguir aislados de CTV suaves de agresivos (Ruiz-Ruiz et al, 2009;Yokomi et al, 2010).…”