ΠΠΈΠΊΠΎΡΠΎΠΊΡΠΈΠ½Ρ Π½Π΅Π³Π°ΡΠΈΠ²Π½ΠΎ Π²Π»ΠΈΡΡΡ Π½Π° ΡΠΎΡΡΠ°Π² ΠΈ ΡΡΠ½ΠΊΡΠΈΠΈ ΠΊΠΈΡΠ΅ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±ΠΈΠΎΡΡ Ρ ΡΠ΅Π»ΡΡΠΊΠΎΡ
ΠΎΠ·ΡΠΉΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΡΠΈΡΡ ΠΈ, ΠΊΠ°ΠΊ ΡΠ»Π΅Π΄ΡΡΠ²ΠΈΠ΅, Π½Π° Π΅Π΅ Π·Π΄ΠΎΡΠΎΠ²ΡΠ΅. ΠΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΈΠ· ΡΡΡΠ°ΡΠ΅Π³ΠΈΠΉ Π²ΠΎΡΡΡΠ°Π½ΠΎΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΡ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±ΠΈΠΎΠΌΠ° ΠΈ Π±ΠΎΡΡΠ±Ρ Ρ ΠΌΠΈΠΊΠΎΡΠΎΠΊΡΠΈΠΊΠΎΠ·Π°ΠΌΠΈ ΡΡΠ°Π»ΠΎ Π²Π²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²ΠΎΠΊ Π² Π·Π°Π³ΡΡΠ·Π½Π΅Π½Π½ΡΠ΅ ΠΊΠΎΡΠΌΠ°. Π Π½Π°ΡΡΠΎΡΡΠ΅ΠΉ ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ΅ Π²ΠΏΠ΅ΡΠ²ΡΠ΅ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, ΡΡΠΎ ΠΊΠΎΡΠΌΠΎΠ²Π°Ρ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²ΠΊΠ° ΠΠ°ΡΠ»ΠΎΠ½ 2+ ΡΡΡΠ΅ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΠΎ ΡΠ»ΡΡΡΠ°Π΅Ρ ΡΡΡΡΠΊΡΡΡΡ ΠΈ ΠΌΠ΅ΡΠ°Π±ΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ ΠΏΠΎΡΠ΅Π½ΡΠΈΠ°Π» ΠΊΠΈΡΠ΅ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±ΠΈΠΎΠΌΠ° Ρ ΡΡΠΏΠ»ΡΡ-Π±ΡΠΎΠΉΠ»Π΅ΡΠΎΠ² ΠΏΡΠΈ ΡΠΊΡΠΏΠ΅ΡΠΈΠΌΠ΅Π½ΡΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΌ Π’-2 ΠΌΠΈΠΊΠΎΡΠΎΠΊΡΠΈΠΊΠΎΠ·Π΅. ΠΠ°ΡΠ΅ΠΉ ΡΠ΅Π»ΡΡ Π±ΡΠ»ΠΎ Π²ΡΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±ΠΈΠΎΡΡ Ρ
ΠΈΠΌΡΡΠ° ΠΈ Π΅Π΅ ΡΡΠ½ΠΊΡΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡΠ½Π°Ρ Π°Π½Π½ΠΎΡΠ°ΡΠΈΡ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ 14-ΡΡΡΠΎΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΠΎΠ·Π΄Π΅ΠΉΡΡΠ²ΠΈΡ Π’-2 ΡΠΎΠΊΡΠΈΠ½Π°, ΠΈΡΠΊΡΡΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΠΎ Π²Π½Π΅ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ ΠΊΠΎΡΠΌΠ°ΠΌΠΈ, ΠΈ ΠΏΠΎΠ΄ Π²Π»ΠΈΡΠ½ΠΈΠ΅ΠΌ ΠΊΠΎΡΠΌΠΎΠ²ΠΎΠΉ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²ΠΊΠΈ ΠΠ°ΡΠ»ΠΎΠ½ 2+, ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Π½ΡΠ΅ΠΌΠΎΠΉ ΠΎΡΠ΄Π΅Π»ΡΠ½ΠΎ ΠΈ Π² ΡΠΎΡΠ΅ΡΠ°Π½ΠΈΠΈ Ρ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΠΎΠ»ΠΈΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌ ΠΏΡΠ΅ΠΏΠ°ΡΠ°ΡΠΎΠΌ Axtra Pro Π½Π° ΡΠΎΠ½Π΅ ΡΠΊΡΠΏΠ΅ΡΠΈΠΌΠ΅Π½ΡΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠΈΠΊΠΎΡΠΎΠΊΡΠΈΠΊΠΎΠ·Π°. ΠΠΏΡΡΡ ΠΏΡΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΈ Π² 2021 Π³ΠΎΠ΄Ρ Π² Π²ΠΈΠ²Π°ΡΠΈΠΈ ΠΡΠ΅ΡΠΎΡΡΠΈΠΉΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ Π½Π°ΡΡΠ½ΠΎ-ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°ΡΠ΅Π»ΡΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΠΈ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ½ΡΡΠΈΡΡΡΠ° ΠΏΡΠΈΡΠ΅Π²ΠΎΠ΄ΡΡΠ²Π° Π½Π° ΡΡΠΏΠ»ΡΡΠ°Ρ
-Π±ΡΠΎΠΉΠ»Π΅ΡΠ°Ρ
ΠΊΡΠΎΡΡΠ° Π‘ΠΌΠ΅Π½Π° 8 (Ρ 33-Π΄ΠΎ 47-ΡΡΡΠΎΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΠΎΠ·ΡΠ°ΡΡΠ°). ΠΠΎΡΠΌ ΠΊΠΎΠ½ΡΠ°ΠΌΠΈΠ½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Π’-2 ΡΠΎΠΊΡΠΈΠ½ΠΎΠΌ ΠΌΠ΅Ρ
Π°Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌ ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±ΠΎΠΌ. ΠΡΠΈΡΡ ΡΠ°Π·Π΄Π΅Π»ΠΈΠ»ΠΈ Π½Π° ΡΠ΅ΡΡΡΠ΅ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ ΠΏΠΎ 5 Π³ΠΎΠ». Π² ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠΉ: I Π³ΡΡΠΏΠΏΠ° (ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»Ρ) ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ°Π»Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π½ΠΎΠΉ ΡΠ°ΡΠΈΠΎΠ½ (ΠΠ ) Π±Π΅Π· Π²Π²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ Π’-2 ΡΠΎΠΊΡΠΈΠ½Π°, II Π³ΡΡΠΏΠΏΠ° -ΠΠ Ρ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π’-2 ΡΠΎΠΊΡΠΈΠ½Π° (200 ΠΌΠΊΠ³/ΠΊΠ³, 2-ΠΊΡΠ°ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΠΏΡΠ΅Π²ΡΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΠΠ), III -ΠΠ Ρ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π’-2 ΡΠΎΠΊΡΠΈΠ½Π° (200 ΠΌΠΊΠ³/ΠΊΠ³) ΠΈ ΠΊΠΎΡΠΌΠΎΠ²ΡΡ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²ΠΊΡ ΠΠ°ΡΠ»ΠΎΠ½ 2+, ΡΠΎΡΡΠΎΡΡΡΡ ΠΈΠ· ΡΠΎΡΠ±ΠΈΡΡΡΡΠ΅Π³ΠΎ ΠΌΠ°ΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»Π° Π΄ΠΈΠ°ΡΠΎΠΌΠΈΡΠ°, Π΄Π²ΡΡ
ΠΊΡΠ»ΡΡΡΡ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠΉ Bacillus spp., ΡΠΌΠ΅ΡΠΈ Π½Π°ΡΡΡΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ
ΡΡΠΈΡΠ½ΡΡ
ΠΌΠ°ΡΠ΅Π» ΡΠ²ΠΊΠ°Π»ΠΈΠΏΡΠ°, ΡΠ°Π±ΡΠ΅ΡΠ°, ΡΠ΅ΡΠ½ΠΎΠΊΠ° ΠΈ Π»ΠΈΠΌΠΎΠ½Π° (ΠΠΠ Β«ΠΠΠΠ’Π ΠΠ€Β», Π ΠΎΡΡΠΈΡ) (1 Π³/ΠΊΠ³ ΠΊΠΎΡΠΌΠ°), IV -ΠΠ Ρ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π’-2 ΡΠΎΠΊΡΠΈΠ½Π° (200 ΠΌΠΊΠ³/ΠΊΠ³), ΠΊΠΎΡΠΌΠΎΠ²ΡΡ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²ΠΊΡ ΠΠ°ΡΠ»ΠΎΠ½ 2+ (1 Π³/ΠΊΠ³ ΠΊΠΎΡΠΌΠ°) ΠΈ ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½ΡΠ½ΡΠΉ ΠΏΡΠ΅ΠΏΠ°ΡΠ°Ρ Ρ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΠΎΠ»ΠΈΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ Π°ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡΡΡ Axtra Pro (Β«DuPont de Nemours, Inc.Β», Π‘Π¨Π) (100 ΠΌΠ³/ΠΊΠ³ ΠΊΠΎΡΠΌΠ°). ΠΠΎΡΡΠ΅Π±Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠΎΡΠΌΠ° Π±ΡΠΎΠΉΠ»Π΅ΡΠ°ΠΌΠΈ ΡΠΎΡΡΠ°Π²Π»ΡΠ»ΠΎ Π² ΡΡΠ΅Π΄Π½Π΅ΠΌ 150 Π³/ΡΡΡ, ΡΠΎ Π΅ΡΡΡ ΠΏΡΠΈΡΡ ΠΎΠΏΡΡΠ½ΡΡ
Π³ΡΡΠΏΠΏ Π΅ΠΆΠ΅ΡΡΡΠΎΡΠ½ΠΎ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ°Π»ΠΈ Π’-2 ΡΠΎΠΊΡΠΈΠ½ Ρ ΠΊΠΎΡΠΌΠΎΠΌ Π² ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅ 30 ΠΌΠΊΠ³. Π ΠΊΠΎΠ½ΡΠ΅ ΡΠΊΡΠΏΠ΅ΡΠΈΠΌΠ΅Π½ΡΠ° ΠΏΡΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΈ ΠΎΡΠ±ΠΎΡ ΠΏΡΠΎΠ± Ρ
ΠΈΠΌΡΡΠ° ΡΠ»Π΅ΠΏΡΡ
ΠΎΡΡΠΎΡΡΠΊΠΎΠ² ΠΊΠΈΡΠ΅ΡΠ½ΠΈΠΊΠ° ΠΎΡ ΡΡΠ΅Ρ
ΠΏΡΠΈΡ ΠΈΠ· ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠΉ Π³ΡΡΠΏΠΏΡ. Π’ΠΎΡΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ ΠΠΠ ΠΈΠ· ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΡΠ΅ΠΌΡΡ
ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠΎΠ² Π²ΡΠ΄Π΅Π»ΡΠ»ΠΈ Ρ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π½Π°Π±ΠΎΡΠ° Β«Genomic DNA Purification KitΒ» (Β«Fermentas, Inc.Β», ΠΠΈΡΠ²Π°). ΠΠ°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅ΡΡΠ²ΠΎ ΡΠ»Π΅ΠΏΠΎΠΉ ΠΊΠΈΡΠΊΠΈ ΠΎΡΠ΅Π½ΠΈΠ²Π°Π»ΠΈ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ NGS-ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π½Π° ΠΏΠ»Π°ΡΡΠΎΡΠΌΠ΅ MiSeq (Β«Illumina, Inc.Β», Π‘Π¨Π) Ρ ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΠΏΡΠ°ΠΉΠΌΠ΅ΡΠΎΠ² Π΄Π»Ρ V3-V4 ΡΠ΅Π³ΠΈΠΎΠ½Π° Π³Π΅Π½Π° 16S ΡΠ ΠΠ. ΠΠΈΠΎΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
Π²ΡΠΏΠΎΠ»Π½ΡΠ»ΠΈ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΡ QIIME2 ver. 2020.8 (https://docs.qiime2.org/2020.8/). Π Π΅ΠΊΠΎΠ½ΡΡΡΡΠΊΡΠΈΡ ΠΈ ΠΏΡΠΎΠ³Π½ΠΎΠ·ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΡΡΠ½ΠΊΡΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠΎΠ΄Π΅ΡΠΆΠ°Π½ΠΈΡ ΠΌΠ΅ΡΠ°Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ°, ΡΠ΅ΠΌΠ΅ΠΉΡΡΠ² Π³Π΅Π½ΠΎΠ², ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΎΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π»ΡΠ»ΠΈ ΠΏΡΠΈ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΠΈ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠ° PICRUSt2 (v.2.3.0) (https://github.com/picrust/picrust2). ΠΠ»Ρ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° ΠΌΠ΅ΡΠ°Π±ΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΠΏΡΡΠ΅ΠΉ ΠΈ ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈΡΡ Π±Π°Π·ΠΎΠΉ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
MetaCyc (https://metacyc.org/). ΠΡΠΈ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΠΈ NGS-ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±ΠΈΠΎΠΌΠ° Π±ΡΠ»ΠΎ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, ΡΡΠΎ Π² ΠΊΠΈΡΠ΅ΡΠ½ΠΈΠΊΠ΅ Ρ Π±ΡΠΎΠΉΠ»Π΅ΡΠΎΠ² ΠΈΠ· II Π³ΡΡΠΏΠΏΡ ΠΏΡΠΎΠΈΡΡ
ΠΎΠ΄ΠΈΠ»ΠΈ ΡΠ΄Π²ΠΈΠ³ΠΈ Π² Π±ΠΈΠΎΡΠ°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΠΈ ΠΈ ΡΠΎΡΡΠ°Π²Π΅ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±ΠΈΠΎΠΌΠ° ΡΠΆΠ΅ Π½Π° ΡΡΠΎΠ²Π½Π΅ ΡΠΈΠ»ΡΠΌΠΎΠ²: ΠΎΠ±ΠΈΠ»ΠΈΠ΅ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠΉ ΡΡΠΏΠ΅ΡΡΠΈΠ»ΡΠΌΠ° Actinobacteriota ΠΈ ΡΠΈΠ»ΡΠΌΠ° Proteobacteria Π²ΠΎΠ·ΡΠ°ΡΡΠ°Π»ΠΎ ΡΠΎΠΎΡΠ²Π΅ΡΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΠΎ Π² 1,8 ΠΈ 3,5 ΡΠ°Π·Π° (Ρ ο£ 0,05), ΡΡΠΏΠ΅ΡΡΠΈΠ»ΡΠΌΠ° Desulfobacterota -Π½Π°ΠΏΡΠΎΡΠΈΠ², ΡΠ½ΠΈΠΆΠ°Π»ΠΎΡΡ Π² 2...