Introducción: La colitis microscópica es una causa habitual de diarrea crónica no inflamatoria, más común en mujeres alrededor de los 55 años, cuyo diagnóstico se basa en el estudio de las muestras de biopsias de colonoscopia, con las variantes linfocítica o colágena. El objetivo del presente trabajo es establecer la prevalencia de la enfermedad en el Hospital Metropolitano e identificar los factores de riesgo asociados a la enfermedad. Métodos: Estudio observacional, transversal y retrospectivo. Se realizó una revisión de la historia clínica de todos los pacientes con diagnóstico de colitis y enteritis no especificadas con realización de colonoscopia en nuestra institución entre el 1 de enero de 2013 al 31 de diciembre del 2019. Resultados: La prevalencia de la colitis microscópica fue del 12.3% con un predominio de las colitis linfocitarias (11,0%). El 74,3% de los sujetos fueron del sexo femenino. Le edad media de los pacientes con colitis microscópica fue de 41 años y el número medio de diarreas de 4,9. La mayoría de los sujetos participantes tenían una obesidad por encima de los 30 kg/m2 (83,4%) sin embargo, esta condición no estuvo asociada con la colitis microscópica. Se evidenció diferencia estadística significativa en el número de diarreas entre pacientes con colitis microscópica y los sujetos con otros tipos de colitis. Se demostró que el tener más de 5 diarreas es un factor de riesgo (OR=7,79) teniendo las personas con más de 5 diarreas 7 veces más posibilidad de tener una colitis microscópica. Conclusiones: La prevalencia de colitis microscópica fue de 12,8%, con aparición más frecuente en mujeres. Se evidenció que más de 5 diarreas pudiera estar relacionado con la presencia de esta enfermedad.