Ecología microbiana de minas de cobre de seis diferentes regiones geográficas

Abstract

El objetivo del trabajo fue comparar la estructura de las comunidades microbianas de minas de cobre de diferentes regiones geográficas con la finalidad de encontrar patrones en la composición de las comunidades y dilucidar su potencial metabólico. Los amplicones de las minas localizadas en Brasil, Canadá, China, Portugal, Reino Unido y Bulgaria se obtuvieron del Sequence Read Archive (SRA) del sitio web del National Center for Biotechnology Information (NCBI). El estudio bioinformático para la repartición taxonómica se realizó con la plataforma Qiime2. Se determinaron la abundancia relativa, la diversidad y su correlación con parámetros físicos y químicos usando R Studio. Posteriormente, se realizó la predicción funcional con PICRUSt2. Los resultados muestran que la mina de Reino Unido es donde se presenta el mayor número de clases y la mina de Bulgaria es la menos diversa. Gammaproteobacteria, Actinobacteria y Alphaproteobacteria son las clases más abundantes en todas las minas y cuentan con géneros que poseen características metabólicas relacionadas con la oxidación o reducción de metales. Las predicciones funcionales sugieren la presencia de genes relacionados con la reducción de metales pesados como cobre y mercurio. Las minas de cobre de diferentes regiones presentan un patrón similar de clases encontradas a pesar de que existen diferencias puntuales de clases bacterianas que atribuimos a la presión de las condiciones físicas y químicas.