Diversidad genética de papas nativas (Solanum spp.) del distrito de Vilcashuamán, Ayacucho- Perú, mediante AFLP

Abstract

En este presente trabajo, la diversidad genética de 30 morfotipos de papas nativas de Vilcashuamán (Ayacucho) fue evaluada mediante la técnica de polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (AFLP). La extracción de ADN se realizó con el método de CTAB modificado, usando hojas frescas de plantas de cuatro semanas de cultivo en invernadero. Partiendo de 200 mg de tejido vegetal se logró obtener entre 300 a 500 ng/μL de ADN de buena calidad. La digestión enzimática del ADN se realizó utilizando EcoRI y MseI, y se emplearon 12 combinaciones de primers, de las cuales se eligieron las dos combinaciones más polimórficas (E13 – M49 y E38 – M49). El análisis estadístico se realizó con el programa NTSYs 2.10 usando el coeficiente de Simple Matching logrando obtener valores de PIC (índice de contenido polimórfico) de 0.45 y 0.40 para las combinaciones E38 – M49 y E13 – M49, respectivamente. En total se lograron identificar 68 bandas claramente diferenciables, de las cuales el 55.8% fueron bandas polimórficas. El análisis de agrupamiento según el algoritmo UPGMA originó un dendograma con un índice de correlación cofenética de r= 0.7; a un coeficiente de similitud de 0.6; se establecieron ocho grupos genéticos y a un coeficiente de 1 no se encontraron morfotipos duplicados. Los resultados obtenidos demuestran el alto poder informativo del AFLP y la alta variabilidad de las papas nativas estudiadas.

Genetic analysis of a potato (Solanum tuberosum L.) breeding collection for southern Colombia using Single Nucleotide Polymorphism (SNP) markers

“…Therefore, methodologies such as molecular markers, which are not affected by the environment, are currently used for the estimation of genetic variability in plant species because of their neutrality, Mendelian inheritance and ease of detection in any tissue and growth stage in plants [ 5 ]. In potatoes, different types of DNA markers have been widely implemented for genetic analysis, including random amplified polymorphic DNA (RAPD), microsatellites (SSR) [ 10 ], polymorphic length restriction fragments (RFLP) [ 11 ], and amplified fragment length polymorphism (AFLP) [ 12 ] but single nucleotide polymorphisms (SNP) are used most often [ 13 ].…”

Organic amendments and their effect on the properties of high Andean soils cultivated with native potato (Solanum goniocalyx Juz.et Buk.)

“…S. goniocalyx presenta una diversidad de variedades nativas entre las que se encuentran Amarilla Tumbay y Peruanita, variedades comerciales de característico color amarillo, pero con susceptibilidad a la Rancha y las heladas (CIP, 2006). La diversidad del cultivo se está perdiendo debido a la presencia de variedades mejoradas, el uso excesivo de agroquímicos y el cambio climático (Gamboa & Rojas, 2018). Las variedades nativas presentan rendimientos bajos por el ataque de enfermedades, plagas y rotaciones intensivas en parcelas pequeñas y de baja fertilidad del suelo, entre otros factores.…”