Distribution of protein poly(ADP-ribosyl)ation systems across all domains of life

Perina, Dragutin; Mikoč, Andreja; Ahel, Josip; Ćetković, Helena; Žaja, Roko; Ahel, Ivan

doi:10.1016/j.dnarep.2014.05.003

Cited by 152 publications

(192 citation statements)

References 100 publications

Supporting

Mentioning

184

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Protein ADP-ribosylation is an abundant post-translational modification that regulates a variety of cellular pathways in both eukaryotes and prokaryotes (Barkauskaite et al, 2013b;D'Amours et al, 1999;Gibson and Kraus, 2012;Perina et al, 2014). In humans, a major protein family that produces ADPribosylation is poly(ADP-ribose) polymerases (PARPs), which consists of 17 members.…”

Section: Protein Adp-ribosylationmentioning

confidence: 99%

Structures and Mechanisms of Enzymes Employed in the Synthesis and Degradation of PARP-Dependent Protein ADP-Ribosylation

2015

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

The poly(ADP-ribose) polymerases (PARPs) are a major family of enzymes capable of modifying proteins by ADP-ribosylation. Due to the large size and diversity of this family, PARPs affect almost every aspect of cellular life and have fundamental roles in DNA repair, transcription, heat shock and cytoplasmic stress responses, cell division, protein degradation, and much more. In the past decade, our understanding of the PARP enzymatic mechanism and activation, as well as regulation of ADP-ribosylation signals by the readers and erasers of protein ADP-ribosylation, has been significantly advanced by the emergence of new structural data, reviewed herein, which allow for better understanding of the biological roles of this widespread post-translational modification.

show abstract

Section: Protein Adp-ribosylationmentioning

confidence: 99%

Structures and Mechanisms of Enzymes Employed in the Synthesis and Degradation of PARP-Dependent Protein ADP-Ribosylation

2015

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…MacroD2 is evolutionarily conserved in vertebrates (Fig. 1A) [5,7] and is considered to play a pivotal role in essential cellular processes.…”

mentioning

confidence: 99%

Biochemical and Morphological Characterization of a Neurodevelopmental Disorder-Related Mono-ADP-Ribosylhydrolase, MACRO Domain Containing 2

et al. 2018

View full text Add to dashboard Cite

MACRO Domain Containing 2 (MacroD2) is a neurodevelopmental disorder-related mono-ADP-ribosylhydrolase. Molecular features of this protein in neural tissues are largely unknown. In this study, we generated a specific antibody against MacroD2, and carried out expression and morphological analyses of the molecule during mouse brain development. In Western blotting, 2 MacroD2 isoforms with molecular masses of ∼70 and ∼75 kDa started to be expressed at embryonic day 16.5, reached the maximal level at postnatal day 8, and then gradually decreased through P30. In contrast, other isoforms with molecular masses of ∼110 and ∼140 kDa gradually increased during embryonic to postnatal development. In immunohistochemical analyses, MacroD2 was strongly detected in cortical neurons in layer II–V at P0 and P7, while the protein expression decreased significantly in the neurons at P30. Immunofluorescence analyses revealed that MacroD2 was mainly distributed in the soma and to a lesser extent in the axon and dendrite of immature primary cultured mouse hippocampal neurons. On the other hand, in the matured hippocampal neurons, while MacroD2 was detected in the soma, it displayed in dendrites a punctate distribution pattern with a partial colocalization with synaptic markers, synaptophysin, and PSD95. The obtained results indicate that MacroD2 is expressed and may have a physiological role in the central nervous system during brain development.

show abstract

“…Druga grupa obejmuje enzymy wykazujące tylko zdolność mono-ADPrybozylacji: PARP6, PARP7, PARP8, PARP10, PARP11, PARP12, PARP14, PARP15 i PARP16. Ostatnią grupę stanowią PARP9 i PARP13, do aktywności których wymagana jest obecność dinukleotydu nikotynoamidowego NAD + [19,26,27]. Połączenie mono-ADP-rybozylacji z metylacją czy też acetylacją histonów, może stanowić wskaźnik poziomu uszkodzenia DNA i wpływać na szlaki sygnałowe regulują-ce procesy proliferacji, apoptozy lub nekrozy czy zatrzymania cyklu komórkowego.…”

Section: Adp-rybozylacja Ubikwitynacja I Sumoilacja Histonówunclassified

Epigenetic modifications and gene expression in cancerogenesis

Poczęta¹,

Nowak²,

Bieg³

et al. 2018

Ann. Acad. Med. Siles.

View full text Add to dashboard Cite

ST R ES ZCZ E NI EModyfikacje epigenetyczne są zmianami regulującymi ekspresję genów. Spośród tych modyfikacji metylacja DNA w regionach promotorowych genów jest najlepiej poznaną zmianą. Za metylację DNA odpowiada rodzina metylotransferaz DNA. Proces ten jest odwracalny w wyniku reakcji demetylacji, w których pośrednią rolę odgrywają białka TET. Hipometylacja DNA oraz hipermetylacja regionów promotorowych genów bogatych w wyspy CpG należy do epigenetycznych mechanizmów powszechnie występujących w wielu typach nowotworów. Epigenetyczny mechanizm transformacji nowotworowej związany jest nie tylko ze zmianami w poziomie metylacji poszczególnych onkogenów czy też genów supresorowych, ale także z potranslacyjnymi modyfikacjami białek histonowych wymuszających zmiany w strukturze chromatyny. Określone modyfikacje, takie jak: metylacja, acetylacja, fosforylacja, ubikwitynacja, biotynylacja, ADP-rybozylacja oraz sumoilacja, mogą wpływać na kondensację chromatyny oraz na białka i kompleksy enzymatyczne decydujące o dostępności DNA, co z kolei wpływa na upakowanie, replikację, rekombinację, procesy naprawy oraz ekspresję DNA. W mechanizmach modulacji ekspresji genów zaangażowanych w procesy prowadzące do rozwoju nowotworów znaczącą rolę odgrywają dwa główne rodzaje małych interferencyjnych RNA siRNA oraz miRNA. Uzyskiwane dane z prowadzonych badań pokazują, że mechanizmy epigenetyczne uczestniczą w procesach prowadzących do rozwoju nowotworów, a poszukiwanie epigenetycznych biomarkerów może być przydatne w terapii nowotworów. S Ł O W A K L U C Z O W Ezmiany epigenetyczne, nowotwory, metylacja DNA, białka histonowe, mikroRNA, ekspresja genów

show abstract

Distribution of protein poly(ADP-ribosyl)ation systems across all domains of life

Cited by 152 publications

References 100 publications

Structures and Mechanisms of Enzymes Employed in the Synthesis and Degradation of PARP-Dependent Protein ADP-Ribosylation

Structures and Mechanisms of Enzymes Employed in the Synthesis and Degradation of PARP-Dependent Protein ADP-Ribosylation

Biochemical and Morphological Characterization of a Neurodevelopmental Disorder-Related Mono-ADP-Ribosylhydrolase, MACRO Domain Containing 2

Epigenetic modifications and gene expression in cancerogenesis

Contact Info

Product

Resources

About