Distribution of mononucleotide repeats in bacterial chromosomes: A/T-tracts dominate on G/C-tracts

Abstract

В данной работе исследовано распределение мононуклеотидных треков разной длины в 342 хромосомах эубактерий и 69 хромосомах архей. Несмотря на то, что число анализируемых повторов проявляет зависимость от нуклеотидного состава, в 73 % случаев (301 хромосома, в том числе и в 90 хромосомах, обогащенных GC-парами) было обнаружено преобладание poly(dA) nи poly(dT) n-треков над poly(dG) n-и poly(dC) n-треками. В природных ДНК число А/Т-треков чаще всего в 2 раза выше, чем в случайных нуклеотидных последовательностях с аналогичным AT/GCсоставом и длиной. Обсуждаются возможные причины появления подобной асимметрии в распределениях.