Differential gene expression in <i>Acidithiobacillus ferrooxidans</i> LR planktonic and attached cells in the presence of chalcopyrite

Henao, Diana Marcela Ossa; Vicentini, Renato; Rodrigues, Viviane Drumond; Bevilaqua, Denise; Ottoboni, Laura Maria Mariscal

doi:10.1002/jobm.201300871

Cited by 3 publications

(3 citation statements)

References 45 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Order By: Relevance

“…Although the concerning link between biofilm formation and increased antibiotic tolerance has been known for some time, , only recently have the benefits of some surface-attached communities become appreciated. Such beneficial roles include competitively excluding pathogen colonization, bioelectricity generation, and enhancing bioleaching. , Furthermore, recent microbiome research cataloging various beneficial relationships between bacterial biofilms and their human host has caused a paradigm shift from the desire to inhibit biofilm formation toward also designing biofilms for therapeutic purposes . One goal of synthetic biology is to program bacterial cell surfaces to perform customized functions under an exclusive set of environmental conditions such as binding a defined surface or remediating a toxic metal from an environment.…”

mentioning

confidence: 99%

Co-opting the Lap System of Pseudomonas fluorescens To Reversibly Customize Bacterial Cell Surfaces

2018

View full text Add to dashboard Cite

Initial attachment to a surface is a key and highly regulated step in biofilm formation. In this study, we present a platform for reversibly functionalizing bacterial cell surfaces, with an emphasis on designing biofilms. We engineered the Lap system of Pseudomonas fluorescens Pf0–1, which is normally used to regulate initial cell surface attachment, to display various protein cargo at the bacterial cell surface and control extracellular release of the cargo in response to changing levels of the second messenger c-di-GMP. To accomplish this goal, we fused the protein cargo between the N-terminal retention module and C-terminal secretion signal of LapA, and controlled surface localization of the cargo with natural signals known to stimulate or deplete c-di-GMP levels in P. fluorescens Pf0–1. We show this system can tolerate large cargo in excess of 500 amino acids, direct P. fluorescens Pf0–1 to surfaces it does not typically colonize, and program this microbe to sequester the toxic medal cadmium.

show abstract

mentioning

confidence: 99%

Co-opting the Lap System of Pseudomonas fluorescens To Reversibly Customize Bacterial Cell Surfaces

2018

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Although the concerning link between biofilm formation and increased antibiotic tolerance has been known for some time (1, 2), only recently have the benefits of some surface-attached communities become appreciated. Such beneficial roles include competitively excluding pathogen colonization (3), bioelectricity generation (4), and enhancing bioleaching (5, 6). Furthermore, recent microbiome research cataloging various beneficial relationships between bacterial biofilms and their human host has caused a for therapeutic purposes (7).…”

mentioning

confidence: 99%

Coopting the Lap system ofPseudomonas fluorescensto reversibly customize bacterial cell surfaces

Smith

Sondermann

O’Toole

2018

Preprint

View full text Add to dashboard Cite

Initialattachment to a surface is a key and highly regulated step in biofilm formation. In this study, we present a platform for reversibly functionalizing bacterial cell surfaces, with an emphasis on designing biofilms. We engineered the Lap system of Pseudomonas fluorescens Pf0-1, which is normally used to regulate initial cell surface attachment, to display various protein cargo at the bacterial cell surface and control extracellular release of the cargo in response to changing levels of the second messenger cdi-GMP. To accomplish this goal, we fused the protein cargo between the N-terminal retention module and C-terminal secretion signal of LapA, and controlled surface localization of the cargo with natural signals known to stimulate or deplete c-di-GMP levels in P. fluorescens Pf0-1. We show this system can tolerate large cargo in excess of 500 amino acids, direct P. fluorescens Pf0-1 to surfaces it does not typically colonize, and program this microbe to sequester the toxic medal cadmium.

show abstract

“…Estas proteínas estão relacionadas com a biossíntese da pilina tipo IV, a qual está envolvida com vários processos, tais como, mobilidade, sinalização e comunicação celular, além de transferência genética, entre outras (Craig et al, 2004;Ossa Henao et al, 2014). PilT é descrita como uma proteína relacionada à troca dos pili da bactéria, processo necessário para sua retração (Alm & Mattick, 1995;Mattick, 2002).…”

Section: Cromatografia Líquida -Ms/ms E Análise Dos Dadosunclassified

Análise das bases moleculares da tolerância ao íon cloreto em bactérias acidófilas utilizadas em biolixiviação

Silva¹

View full text Add to dashboard Cite

Agradeço a Deus por me dar forças em todos os momentos, sejam eles felizes ou difíceis.À minha mãe e meu pai, pessoas tão esforçadas e que sempre acreditaram em mim.A meus irmãos, Patrícia e Douglas, sempre do meu lado. Paty, obrigado por tudo! À toda a minha família, por todo o apoio e por acreditar na minha vitória.À minha orientadora, Laura Ottoboni, pela paciência e carinho que não cabem nesse Universo. À Profa. Dra. Tatiana Teixeira Torres (USP) pela co-orientação no trabalho. À Dra. Silvia Regina Turcinelli, por ajudar a deixar minha tese melhor e pelo carinho.Aos meus amigos do Laboratório, Camila (Camila, obrigado por todas as conversas e ouvir todas as minhas frustrações, alegrias!!), minha afilhada Viviane, Bruna Rafaella (minha eterna Rafaedja), Letícia, Daniel... Obrigado! Aos meus amigos do coração, que me receberam e sempre se dispuseram a me ajudar: Fernanda Gadelha (pelos puxões de orelha, conselhos, carinho... eterno obrigado!), Rafael (apoio nas horas difíceis, companheirismo, maravilhoso!), Sérgio, Douglas, Ed, Wagner, Eduardo Peloso (meu irmão do coração!). Vocês foram minha força que me deixaram não cair nos tempos difíceis.Aos membros e suplentes da banca. Aos professores Prof. Dr. Ronei Jesus Poppi (UNICAMP), Prof. Dr. Gilberto Domont (UFRJ), Prof. Dr. Renato Vicentini e Lucas Canesin (CBMEG -UNICAMP) pela contribuição dada ao trabalho.A todos os meus amigos de Campinas e da UNICAMP, pela paciência e apoio.Aos colegas e funcionários do CBMEG e da Secretaria de Pós-Graduação (Tânia, Sandra, Gabriela, obrigado!).À FAPESP, pela bolsa de doutorado (2010/12476-1).À FAPESP/Vale, pelo apoio financeiro.Ao CBMEG e à Unicamp, pelo apoio institucional.A todos que, de uma forma ou de outra, contribuíram para o desenvolvimento deste trabalho. RESUMOAcidithiobacillus ferrooxidans é uma bactéria Gram-negativa, quimiolitotrófica e acidófila utilizada na biolixiviação de metais. Contudo, essa utilização é limitada em locais onde a água disponível para o processo contém sal, devido à sensibilidade da bactéria ao NaCl. Assim sendo, o conhecimento dos mecanismos moleculares acionados pelo estresse salino na bactéria é de grande interesse para indústria de biomineração. Desta forma, esse trabalho teve como objetivo a análise do estresse salino (NaCl) em células de A. ferrooxidans, por curtos (células salt-shock) ou longos (células salt-30) períodos de tempo. As células saltshock e salt-30 de A. ferrooxidans foram analisadas por espectroscopia RAMAN e os resultados mostraram mudanças na composição de vários componentes de membrana da bactéria, como proteínas, lipídeos e carboidratos. Foi observado que estas alterações ocorreram tanto nas células salt-shock quanto nas células salt-30, mostrando que as alterações causadas pelo sal em A. ferrooxidans ocorrem de imediato e após longos períodos de exposição. A análise do proteoma das células salt-30 de A. ferrooxidans mostrou uma expressão diferencial de proteínas relacionadas à membrana celularcomo proteínas estruturais e transportadoras de várias moléculas -como me...

show abstract

Differential gene expression in Acidithiobacillus ferrooxidans LR planktonic and attached cells in the presence of chalcopyrite

Cited by 3 publications

References 45 publications

Co-opting the Lap System of Pseudomonas fluorescens To Reversibly Customize Bacterial Cell Surfaces

Co-opting the Lap System of Pseudomonas fluorescens To Reversibly Customize Bacterial Cell Surfaces

Coopting the Lap system ofPseudomonas fluorescensto reversibly customize bacterial cell surfaces

Análise das bases moleculares da tolerância ao íon cloreto em bactérias acidófilas utilizadas em biolixiviação

Contact Info

Product

Resources

About