Development of the method for identification and genotyping of the bacteria Pasteurella multocida and Mannheimia haemolytica on the basis of the pcr and phylogenetic analysis of bacterial cultures isolated from cattle

Nefedchenko, A.V.; Shikov, A. N.; Глотов, А.Г.; Glotova, T.I.; Ternovoy, V. A.; Агафонов, А. П.; Сергеев, А. Н.; Donchenko, N. A.

doi:10.18821/0208-0613-2016-34-2-62-66

Cited by 3 publications

(1 citation statement)

References 8 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Бактериологические исследования проводили в соответствии с Руководством МЭБ (OIE) (Международное эпизоотическое бюро) (22). Бактерии выделяли на искусственных питательных средах -кровяном мясопептонном агаре (КМПА), агаре на основе мясного перевара по Хоттингеру с добавлением 10 % сыворотки крови лошади и типировали в ПЦР с использованием праймеров согласно описанию (23)(24)(25).…”

unclassified

DETECTION AND QUANTITATIVE ASSESSMENT OF VIRAL AND BACTERIAL PATHOGENS IN BOVINE RESPIRATORY DISEASES BY REAL-TIME-qPCR

Nefedchenko¹

2021

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

Респираторные болезни крупного рогатого скота (КРС) широко распространены во всех странах с развитым животноводством и наносят значительный экономический ущерб. Часто они являются результатом синергического взаимодействия нескольких вирусов и бактерий, преимущественно семейства Pasteurellaceae. Клинические признаки и патологоанатомические изменения внутренних органов зависят от наличия или отсутствия того или иного возбудителя. Массовые вспышки возникают при объединении животных из разных источников. Этиологическая структура таких вспышек достаточно изучена, однако данных, касающихся особенностей распределения бактерий и вирусов в органах респираторного тракта и их количественного определения, недостаточно. Нами представлены результаты изучения этиологической структуры вспышки респираторных болезней в условиях молочного комплекса после ввода КРС из-за рубежа, во время которой пало более 400 животных разных половозрастных групп. Исследовали пробы внутренних органов 58 павших животных разного возраста. При изучении этиологической структуры вспышки использовали стандартные бактериологические методы, вирусные агенты идентифицировали в ПЦР методом гель-электрофореза, а для количественной оценки всех обнаруженных инфекционных агентов применили ПЦР в режиме реального времени. Всего выявили 9 вирусов и бактерий, из которых респираторно-синцитиальный вирус КРС (BRSV, Bovine Respiratory Syncytial Virus, род Pneumovirus, семейство Paramyxoviridae) и бактерии семейства Pasteurellaceae играли ведущую этиологическую роль. С использованием количественной ПЦР определили концентрации вируса и бактерий Pasteurella multocida и Mannheimia haemolytica в органах респираторного тракта 13 телят разного возраста со сходными клиническими признаками, патологоанатомическими изменениями и присутствием в органах респираторного тракта трех возбудителей. Концентрация агентов составляла от 0,1±0,03 до 4,8±0,47 log10 геномных эквивалентов (ГЭ)/мл для BRSV, от 1,3±0,60 до 4,1±0,30 log10 ГЭ/мл для P. multocida и от 1,9±0,03 до 4,9±0,67 log10 ГЭ/мл для М. haemolytica. Концентрация и распространение возбудителей по органам у телят разных возрастов различались. BRSV выявили в более широком диапазоне органов дыхания как свободных от бактерий, так и колонизированных ими. В легких концентрация вируса была выше, чем в трахеальном и бронхиальном экссудате. P. multocida присутствовала только в верхних и средних долях легких у 2,5-4месячных телят в приблизительно равных концентрациях при острой форме бронхопневмонии. Степень колонизации легких этой бактерией повышалась с возрастом, и у телят в возрасте 6 мес ее численность достигала максимальных значений в верхних и средних долях легких, легочных лимфатических узлах и смывах со слизистых оболочек при хронической бронхопневмонии. M. haemolytica выявляли при острой форме бронхопневмонии у телят в возрасте 2,5 мес в минимальном количестве в средних долях легких, в максимальном -в трахеальном и бронхиальном экссудатах. Результаты показали, что вирус и бактерии размножаются в различных частях легких, не подавляя ...

show abstract

unclassified

DETECTION AND QUANTITATIVE ASSESSMENT OF VIRAL AND BACTERIAL PATHOGENS IN BOVINE RESPIRATORY DISEASES BY REAL-TIME-qPCR

Nefedchenko¹

2021

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Identification of serotypes of Mannheimia haemolytica and Pasteurella multocida from pneumonic cases of sheep and goats and their antimicrobial sensitivity profiles in Borana and Arsi zones, Ethiopia

Girma

Getachew

Beyene

et al. 2023

Sci Rep

View full text Add to dashboard Cite

Respiratory diseases caused by Mannheimia haemolytica (M. haemolytica) and Pasteurella multocida (P. multocida) have been known to result in a considerable loss due to mortality and reduced production. This study aimed at isolation and identification of M. haemolytica and P. multocida associated with pneumonic pasteurellosis in sheep and goats using bacteriological and molecular techniques. Identification of serotypes of M. haemolytica and P. multocida was done using indirect haemagglutination test. The in vitro antimicrobial sensitivity profiles of the M. haemolytica were tested using standard disk diffusion method. A total of 52 and 78 nasal swabs were collected from pneumonic cases for bacterial isolation and identification in Borana and Arsi zone, respectively. Four hundred sera samples were collected for identification of serotypes. The results showed that 17 of 52 (32.69%; 95% CI 20.33, 47.11) nasal swabs collected from pneumonic animals in Borana yielded positive results for Pasteurella/Mannheimia species, 13 (25.00%; 95% CI 14.03, 38.95) of which were M. haemolytica. None of the samples yielded P. multocida. Twenty-three of 78 (29.49%; 95% CI 19.69, 40.89) nasal swabs collected at Arsi from pneumonic animals yielded positive results for M. haemolytica (17) and P. multocida (6). Secondary biochemical characterization revealed that 14 of the 17 isolates conform to M. haemolytica whereas none of the 6 isolates suspected to be P. mutocida were confirmed. Eleven (84.62%) isolates from Borana and 4 (28.57%) from Arsi were confirmed to be M. haemolytica using PCR targeting the Rpt2 genes. Assay for M. haemolytica serotype A1 revealed all belong to A1. None of the isolates with cultural and morphological features of P. multocida gave positive results by molecular assay. Serological assay identified three serotypes of M. haemolytica namely A1, A2 and A7 almost in all of the samples whereas P. multocida serotype A was detected in 78.75% of the samples. The M. haemolytica isolates tested for susceptibility to antibiotics showed resistance against Bacitracin (83.33%) and Penicillin (50.00%) while they were found susceptible to Gentamycin (100%), Chloramphenicol (100%) and Sulfamethoxazole (100%) and Tetracycline (83.33%). In conclusion, the results of the present study revealed the association of M. haemolytica with pneumonic pasteurellosis in sheep and goats and can be of use in vaccine development in Ethiopia. Nevertheless, further investigations and continuous monitoring of antimicrobial resistance and appropriate selection and prudent use of antimicrobials in livestock sector are required.

show abstract

Meta-Analysis of qPCR for Bovine Respiratory Disease Based on MIQE Guidelines

Marsh

Quinn

2022

Front. Mol. Biosci.

View full text Add to dashboard Cite

Qualitative and quantitative PCR-based tests are widely used in both diagnostics and research to assess the prevalence of disease-causing pathogens in veterinary medicine. The efficacy of these tests, usually measured in terms of sensitivity and specificity, is critical in confirming or excluding a clinical diagnosis. We undertook a meta-analysis to assess the inherent value of published PCR diagnostic approaches used to confirm and quantify bacteria and viruses associated with bovine respiratory disease (BRD) in cattle. This review followed the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guidelines. A thorough search of nine electronic databases (Web of Science, EBSCOhost, Cambridge journals online, ProQuest, PubMed, Sage journals online, ScienceDirect, Wiley online library and MEDLINE) was undertaken to find studies that had reported on the use of PCR and/or qPCR for the detection and/or quantification of BRD associated organisms. All studies meeting the inclusion criteria for reporting quantitative PCR for identification of BRD associated microorganisms were included in the analysis. Studies were then assessed on the applications of the Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiment (MIQE) and PCR primer/probe sequences were extracted and tested for in silico specificity using a high level of stringency. Fourteen full-text articles were included in this study. Of these, 79% of the analysed articles did not report the application of the MIQE guidelines in their study. High stringency in silico testing of 144 previously published PCR primer/probe sequences found many to have questionable specificity. This review identified a high occurrence of primer/probe sequences with a variable in silico specificity such that this may have implications for the accuracy of reporting. Although this analysis was only applied to one specific disease state, identification of animals suspected to be suffering from bovine respiratory disease, there appears to be more broadly a need for veterinary diagnostic studies to adopt international best practice for reporting of quantitative PCR diagnostic data to be both accurate and comparable between studies and methodologies.

show abstract

Development of the method for identification and genotyping of the bacteria Pasteurella multocida and Mannheimia haemolytica on the basis of the pcr and phylogenetic analysis of bacterial cultures isolated from cattle

Cited by 3 publications

References 8 publications

DETECTION AND QUANTITATIVE ASSESSMENT OF VIRAL AND BACTERIAL PATHOGENS IN BOVINE RESPIRATORY DISEASES BY REAL-TIME-qPCR

DETECTION AND QUANTITATIVE ASSESSMENT OF VIRAL AND BACTERIAL PATHOGENS IN BOVINE RESPIRATORY DISEASES BY REAL-TIME-qPCR

Identification of serotypes of Mannheimia haemolytica and Pasteurella multocida from pneumonic cases of sheep and goats and their antimicrobial sensitivity profiles in Borana and Arsi zones, Ethiopia

Meta-Analysis of qPCR for Bovine Respiratory Disease Based on MIQE Guidelines

Contact Info

Product

Resources

About