Development of multiplex PCRs for evolutionary and forensic applications of 37 human Y chromosome SNPs

Onofri, Valerio; Alessandrini, Federica; Turchi, Chiara; Pesaresi, Mauro; Buscemi, Loredana; Tagliabracci, Adriano

doi:10.1016/j.forsciint.2005.03.014

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“…DYS389b was obtained by subtracting DYS389I from DYS389II. Basal haplogroups (hgs) were assigned by typing the seven SNPs (R-M173, J-M172, I-M170, E-M35, K-M9, P-M45 and F-M89) implemented in the MY1 Multiplex PCR by Onofri et al (2006). Subsequently, we explored Y-chromosome variability by using 28 SNPs.…”

Section: Y-chromosome Genotypingmentioning

confidence: 99%

Traces of medieval migrations in a socially stratified population from Northern Italy. Evidence from uniparental markers and deep-rooted pedigrees

et al. 2014

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Section: Y-chromosome Genotypingmentioning

confidence: 99%

Traces of medieval migrations in a socially stratified population from Northern Italy. Evidence from uniparental markers and deep-rooted pedigrees

et al. 2014

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“…Se han diseñado múltiplex a nivel mundial, como el 28 y-snp del grupo de Van Oven [43]. También, se han diseñado múltiplex a nivel continental, como el 37-plex a nivel Europeo [44] o el análisis de 24 y-snp para asignar los principales haplogrupos y subhaplogrupos detectados en Suramérica [45]. No obstante, resulta evidente que el análisis de 530 snp mediante el empleo de las nuevas plataformas de genotipado permite una asignación mucho más precisa tanto a nivel de haplogrupos como de subhaplogrupos [46].…”

Section: Cromosoma Yunclassified

Revisión sobre los marcadores del origen biogeográfico y su aplicación en la investigación forense

Popa¹,

Pardo²,

López-Parra³

2017

Colomb. forense

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Cómo citar este artículo: Popa DM, Arroyo-Pardo E, López-Parra AM. Revisión sobre los marcadores del origen biogeográfico y su aplicación en la investigación forense. Colomb Forense. 2016;4(1):15-26. doi: http://dx.doi.org/10. 16925/cf.v4i1.1958 Resumen. Propósito: actualmente, los marcadores que determinan el origen biogeográfico están teniendo mucho auge, especialmente en el ámbito forense. Estos marcadores permiten analizar el adn de un individuo y determinar su origen biogeográfico. Estos análisis se llevan a cabo con frecuencia a través de snp (Single Nucleotide Polymorphisms), pero más recientemente también a través de InDels. Debido a este auge, la finalidad de la revisión es recopilar información sobre los marcadores que actualmente se están utilizando, su diferente rendimiento y su problemática, así como las posibles soluciones. Periodo que se abarcó, origen y tipos de publicaciones: el periodo abarcado para el análisis es del año 2006 al 2016, con artículos recopilados de PubMed y Web of Science, sin ninguna preferencia en cuanto al origen. Punto de vista: aunque se han empleado para diferentes poblaciones y con diferentes marcadores, muestran resultados similares. Los artículos versan desde los tipos de marcadores seleccionados para el análisis, como marcadores autosómicos o de linaje, hasta comparaciones entre marcadores de la misma categoría, como los snp y los InDels entre los autosómicos. Se han seleccionado así para poder obtener una visión comparativa de los más eficaces para la detección del origen biogeográfico. Conclusiones: se ha comprobado que los más marcadores eficaces son los aim-snp autosómicos, en cuanto a diferenciación entre grupos poblacionales, y los aim-InDels, de forma suplementaria en los casos de mezcla poblacional.Palabras clave: InDels, origen biogeográfico, snp, str.

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“…For human identity testing, Ballantyne and co-authors (2012) purposefully selected rapidly mutating Y STRs to increase the differentiation for male relatives. Y-chromosomal DNA is of course also home to many SNP locations that have been shown to be ancestry informative and can be applied to kinship testing (Onofri et al 2006). Y-chromosome haplotypes are generally not informative if other family members in the paternal lineage have to be considered as putative fathers.…”

Section: Autosomal Markersmentioning

confidence: 99%

Forensic DNA Analysis

Prinz¹,

Lessig²

2014

Handbook of Forensic Medicine

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Development of multiplex PCRs for evolutionary and forensic applications of 37 human Y chromosome SNPs

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Traces of medieval migrations in a socially stratified population from Northern Italy. Evidence from uniparental markers and deep-rooted pedigrees

Traces of medieval migrations in a socially stratified population from Northern Italy. Evidence from uniparental markers and deep-rooted pedigrees

Revisión sobre los marcadores del origen biogeográfico y su aplicación en la investigación forense

Forensic DNA Analysis

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