Development of a SCAR marker linked to fungal pathogenicity of rice blast fungus Magnaporthe Oryzae

Quốc, Nguyễn Bảo; Trang, Ho Thi Thu; Phuong, Nguyen Doan Nguyen; Châu, Nguyễn Ngọc; Jantasuriyarat, Chatchawan

doi:10.1007/s10123-020-00150-0

Cited by 5 publications

(2 citation statements)

References 25 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Order By: Relevance

“…SCAR marker is usually a dominant molecular marker developed from RAPD, SRAP, and SSR markers (Yang et al 2019;Quoc et al 2021); its purpose is to amplify the single site corresponding to the original marker fragment, showing the presence or absence of the amplified product, which has the advantages of rapid, simple, and high intuitive results. The design of specific primers plays an important role in transforming the RAPD, SRAP, or SSR markers into SCAR markers (Sun et al 2010).…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Development of the specific molecular markers of the thin-blade strain (HR-5) in Pyropia haitanensis

2021

View full text Add to dashboard Cite

In order to establish a method for germplasm identification of the thin-blade strain (HR-5) of Pyropia haitanensis, the specific molecular markers of the conchocelis and blades of HR-5 were developed by using the techniques of insertion/deletion (InDel) and sequence-characterized amplified regions (SCAR). Results showed that a specific band was amplified by InDel-3 primer-pair (F: GGG GAT GGC AGT TTTAC; R: GAA TCT TCA TTT CGT GGT G), and a specific band was amplified by SCAR-170 primer-pair (F: GAC GCC GAG TCG TAG TGC; R: CCG TTG TTA GTG TGA TGG ) in conchocelis DNA of the HR-5 strain, which was significantly different from those in other four control strains of P. haitanensis and also present in the gametophytic blades of the HR-5 strain cultured in the laboratory. When those primer-pairs were applied to discriminate HR-5 blades from the other cultivars in the Pyropia sea area, the InDel-3 and SCAR-170 markers showed the same results. In addition, genetic analysis of the above specific markers showed that the InDel-3 marker was inherited from its female parent, while the SCAR-170 marker of HR-5 was inherited from its male parent. These results indicated that the specific bands amplified by InDel-3 and SCAR-170 primer-pairs could be considered as the specific markers of HR-5 strain and could be used for its germplasm identification.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Development of the specific molecular markers of the thin-blade strain (HR-5) in Pyropia haitanensis

2021

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Thí nghiệm chủng bệnh trên các giống lúa được thực hiện bằng mẫu nấm phân lập M. oryzae LBT2 theo quy trình như sau: Các giống lúa được trồng thành cây con 14 ngày tuổi, mẫu nấm M. oryzae LBT2 được nuôi cấy trên môi trường oatmeal agar và kích thích bào tử nảy mầm dưới đèn Blacklight tạo UV trong thời gian 2-3 ngày ở 25 o C. Tiếp theo, bào tử nấm M. oryzae LBT2 được pha loãng ở mật số 1×10 5 -5×10 5 bào tử/mL và trộn với dung dịch Tween20 0,1%, sau đó phun sương huyền phù bào tử này lên lá lúa 14 ngày tuổi. Các bào tử của chủng nấm LBT2 này có tỉ lệ nảy mầm và hình thành giác bám xâm nhiễm đạt hiệu quả sau 8 giờ trên bề mặt nhân tạo và lá lúa, chủng này có khả năng phá vỡ tính kháng của các giống lúa có khả năng kháng như IR50404 (Quoc et al, 2021). Do đó, việc xác định sự thay đổi tích lũy biểu hiện của osa-miR162a trong nghiên cứu được đánh giá ở các thời điểm 24, 48 và 72 giờ sau lây nhiễm.…”

Section: Phương Pháp Nghiên Cứuunclassified

Đánh giá biểu hiện của phân tử Microrna Osa-mir162a trên các giống lúa chống chịu và mẫn cảm với nấm gây bệnh đạo ôn - Magnaporthe oryzae

Nguyễn Bằng,

Nguyễn,

Nguyễn

et al. 2023

CTU J. Sci.

View full text Add to dashboard Cite

Nấm Magnaporthe oryzae được xem là tác nhân chính gây bệnh đạo ôn trên lúa và gây thiệt hại rất lớn về năng suất ở các vùng trồng lúa. Gần đây vai trò của microRNAs được mô tả là có liên quan đến khả năng chống chịu của cây trồng với các tác nhân gây hại. Trong nghiên cứu này, sự biểu hiện của osa-miR162a trên các giống lúa thuộc nhóm mẫn cảm và chống chịu với nấm M. oryzae trồng phổ biến tại Việt Nam được phân tích bằng kỹ thuật Real-time qRT-PCR. Mặc dù có sự đa dạng trong biểu hiện của osa-miR162a trên các giống lúa ở các thời điểm sau lây nhiễm (hpi) khác nhau, sự biểu hiện tăng của osa-miR162a trên các giống lúa chống chịu bệnh đạo ôn ở thời điểm 48 và 72 hpi thể hiện sự khác biệt có ý nghĩa thống kê so với các giống lúa mẫn cảm. Kết quả nghiên cứu chỉ ra rằng phân tử microRNA osa-miR162a hứa hẹn là một chỉ thị phân tử tiềm năng trong việc phân biệt tính kháng với nấm M. oryzae của các giống lúa trồng tại Việt Nam hiện nay.

show abstract

Development of sequence-characterized amplified region (SCAR) markers for accurate and differential identification of multienzyme-producing and non-enzymatic Aspergillus strains of industrial importance

Ashwini

Bhavani²,

Deepa

et al. 2022

Arch Microbiol

View full text Add to dashboard Cite

Development of a SCAR marker linked to fungal pathogenicity of rice blast fungus Magnaporthe Oryzae

Cited by 5 publications

References 25 publications

Development of the specific molecular markers of the thin-blade strain (HR-5) in Pyropia haitanensis

Development of the specific molecular markers of the thin-blade strain (HR-5) in Pyropia haitanensis

Đánh giá biểu hiện của phân tử Microrna Osa-mir162a trên các giống lúa chống chịu và mẫn cảm với nấm gây bệnh đạo ôn - Magnaporthe oryzae

Development of sequence-characterized amplified region (SCAR) markers for accurate and differential identification of multienzyme-producing and non-enzymatic Aspergillus strains of industrial importance

Contact Info

Product

Resources

About