Öz Kaplumbağaların vücut morfolojilerinin kökeni sürüngen evriminin en önemli gizemlerinden birini oluşturmaktadır. Günümüze kadar yapılan çeşitli moleküler çalışmalar, kaplumbağaların Tuatara, kertenkele ve yılanların dâhil olduğu Lepidosauria grubunun dışında yer aldığı ve timsah ile kuşların bulunduğu Archosauria grubuna kardeş grup olduğunu ortaya koymuştur. Araştırıcılar kaplumbağaların atası olarak günümüzden 228 milyon yıl öncesine ait olan Eorhynchochelys sinensis isimli yeni bir tür tanımlamışlardır. Modern kaplumbağların günümüzde yaşayan en eski grubu olarak bilinen Güneydoğu Asya orijinli olan Trionychidae familyasına giren kaplumbağalar gece aktif olan etçil tatlı su kaplumbağalarıdır. Karapas ve plastronlarında epidermis orjinli plaklar olmamasına rağmen bu bölgelerin üstü ince bir deri ile örtülüdür. Bu grubun bilinen en eski fosil kaydı (yaklaşık 100-140 MYÖ) Santanachelys gaffneyi'dir. Trionychidae üyeleri Asya kıtasının Kretase jeolojik döneminin başlangıcından günümüze kadar gelen, yüksek oranda morfolojik çeşitlilik gösteren canlılardır.