Detection of PER-1 Type Extended Spectrum Beta Lactamase in the Acinetobacter baumannii Species Isolated from Blood Cultures and Investigation of Clonal Relationship

Abstract

Bu çalışmada hastanemizde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen Acinetobacter baumannii izolatlarında seftazidime dirençli suşlarda PER-1 tipi genişlemiş spektrumlu beta laktamaz (ESBL) geninin varlığının polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile, PER-1 geni taşıyan A. baumannii izolatları arasındaki genotipik ilişki random amplifiye polimorfik DNA (RAPD) PZR ve pulse-field jel elektroforezi (PFGE) moleküler yöntemleri ile saptanmış ve bu suşlarda çeşitli antibiyotiklere direnç araştırılmıştır. G Ge er re eç ç v ve e Y Yö ön n-t te em ml le er r: : Toplam 100 adet A. baumannii suşunun identifikasyonu konvansiyonel yöntemler ve Phoenix 100BD Otomatize Sistemi (Becton Dickinson Diagnostic Systems, Sparks) kullanılarak yapılmıştır. İzolatların seftazidime direnci E test yöntemi ile belirlenmiş ve seftazidime dirençli suşlarda PZR yöntemi ile PER-1 geninin varlığı araştırılmıştır. PER-1 geni taşıyan A. baumannii izolatlarının genotipik ilişkisi, RAPD-PZR ve PFGE moleküler yöntemleri ile çalışılmış ve bantlar arasındaki benzerlikler "dice smilarity coefficients"'e göre hesaplanmıştır. Suşların kolistine duyarlılıkları E test yöntemi ile diğer antibiyotiklere duyarlılıkları ise Klinik ve Laboratuar Standartları Enstitüsü önerileri doğrultusunda Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiştir. B Bu ul lg gu ul la ar r: : 100 A. baumannii suşunun 78'i seftazidime dirençli bulunmuştur. Bu suşların 18'inde (%23) PER-1 geni saptanmıştır. PER-1 pozitif tüm suşlar klonal olarak ilişkili bulunmuştur. A. baumannii suşlarında amikasine %67, imipeneme %71, tetrasikline ve trimetoprim/sülfametoksazole %83, siprofloksasine %85, sefepime %87, piperasilin-tazobaktama %99 ve seftriaksona %100 oranında direnç saptanmıştır. Kolistine ise direnç saptanmamıştır. S So on nu uç ç: : Sonuç olarak, yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen A. baumannii suşlarında PER-1 pozitifliği oranı (%23) düşük olmasına karşılık, suşların çoğunun seftazidime dirençli olması, bu suşlarda farklı direnç genlerinin varlığını göstermektedir. PER-1 varlığı saptanan suşların RAPD ve PFGE yöntemleri ile klonal ilişkileri değerlendirildiğinde, farklı kliniklerde klonal ilişkili suşların saptanması, hastaların zaman zaman aynı servislerde yatmasına ve servisler arası yayılıma bağlı olabileceği düşünülmüştür. A An na ah ht ta ar r K Ke el li im me el le er r: : Acinetobacter baumannii; beta-laktamaz PER-1 A AB BS ST TR RA AC CT T O Ob bj je ec ct ti iv ve e: : In this study, the presence of PER-1 type extended spectrum beta lactamases (ESBL) was investigated in ceftazidime-resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from bloodstream infections by polymerase chain reaction (PCR), and the clonal relation of the isolates was investigated by random amplified polymorphic DNA (RAPD) PCR and pulse-field gel electrophoresis (PFGE) in all PER-1 producing A. baumannii strains. M Ma at te er ri ia al l a an nd d M Me et th ho od ds s: : The isolates were identified as A. baumannii by conventional methods and Phoenix 100BD automated system (Bec...