El orden Plecoptera representa uno de los grupos de insectos más relevantes en bioindicación en Colombia. En los últimos años su conocimiento ha aumentado ampliamente; no obstante, en algunas zonas de la región andina, los estudios taxonómicos y ecológicos son aún incipientes. Dada la importancia de los plecópteros en quebradas de alta montaña, se evaluó la relación entre la presencia y abundancia de ninfas del género Anacroneuria con variables fisicoquímicas y bacteriológicas en tres microcuencas andinas asociadas con el río Combeima (Tolima, Colombia): Las Perlas, La Plata y Cay. Se realizaron seis colectas diurnas con red Surber en diferentes sustratos (arena, grava-guijarro, roca y hojarasca), durante un ciclo hidrológico (2016-2017; épocas de altas lluvias, bajas lluvias y transiciones). Se registraron 750 organismos, de los cuales, por morfometría tradicional se determinaron dos morfoespecies de Anacroneuria (Asp1 y Asp2). Se encontró correlación negativa entre la abundancia de Asp1 con el fósforo (rs= -0,5266) en la quebrada Las Perlas; conductividad eléctrica (rs= -0,4725) en la quebrada La Plata y nitratos (rs= -0,4821) en la quebrada Cay, mientras que la Asp2 la presentó en DQO (rs= -0,5634) y correlación positiva con temperatura (rs= 0,6750), pH (rs= 0,7079, nitratos (rs= 0,5569) y fosfatos (rs= 0,6511) en la quebrada Las Perlas.