Defective interfering viruses and their potential as antiviral agents

Abstract

Defective interfering (DI) virus is simply defined as a spontaneously generated virus mutant from which a critical portion of the virus genome has been deleted. At least one essential gene of the virus is deleted, either in its entirety, or sufficiently to make it non-functional. The resulting DI genome is then defective for replication in the absence of the product(s) of the deleted gene(s), and its replication requires the presence of the complete functional virus genome to provide the missing functions. In addition to being defective DI virus suppresses production of the helper virus in co-infected cells, and this process of interference can readily be observed in cultured cells. In some cases, DI virus has been observed to attenuate disease in virus-infected animals. In this article, we review the properties of DI virus, potential mechanisms of interference and progress in using DI virus (in particular that derived from influenza A virus) as a novel type of antiviral agent.

Error threshold in RNA quasispecies models with complementation

“…Due to complementation, both genomes can be replicated by both replicases, with differential interactions probabilities between master and mutant genomes with the whole pool of replicases (parametrized with γ) synthesized from both genome classes. Then, we analyzed a different model considering a particular case of complementation in which DIPs (see the review [32]) replicate faster due to their shortened genomes. Moreover, we can also incorporate into this model differential binding affinities for the unique, wild-type replicase.…”

“…DIPs are mutant viruses that lack most of the viral genome and cannot complete the infectious cycle by themselves [30,31] (see also [32] for a review). However, they can be replicated and encapsidated by the proteins translated from a helper virus coinfecting the same cell.…”

Les exosomes

“…Par exemple, les cellules infectées par le virus de l'hépatite B (VHB) sécrètent de larges quantités de particules non infectieuses, dont la protéine virale antigène de surface (HBsAg), mais sont dépourvues de capside et de génome viral [1]. Par ailleurs, des virus défec-tifs interférents, composés de génomes viraux tronqués, sont produits dans un large spectre d'infections comme la grippe et certaines infections par flavivirus [2,3]. Ces génomes tronqués, générés probablement à la suite d'erreurs de la polymérase virale ou par digestion nucléotidique partielle, sont aussi efficacement encapsidés et sécrétés que le génome viral entier [3].…”

“…Par ailleurs, des virus défec-tifs interférents, composés de génomes viraux tronqués, sont produits dans un large spectre d'infections comme la grippe et certaines infections par flavivirus [2,3]. Ces génomes tronqués, générés probablement à la suite d'erreurs de la polymérase virale ou par digestion nucléotidique partielle, sont aussi efficacement encapsidés et sécrétés que le génome viral entier [3]. Les particules du virus de l'hépatite C (VHC) sont particulièrement hétérogènes en termes de taille, de densité, de composition et d'infectivité [4].…”

“…Par exemple, les particules HBsAg sont capables -comme E2 du VHC -d'inhiber la production d'IFN par les pDC [15]. Par ailleurs, les virus défectifs interférents bloquent la réplication des virus infectieux, notamment en réquisitionnant la polymé-rase virale et d'autres facteurs pour leur propre réplication [3]. En outre, des particules rétrovirales non infectieuses contenant des génomes mutants générés par l'action de déoxycytidines déaminases -facteurs de restriction comme par exemple APOBEC3 -ont la capacité d'induire une réponse neutralisante, ce qui contribue au contrôle de la charge virale in vivo [16].…”