ИДЕНТИФИКАЦИЯ НЕТИПИЧНОГО БАКТЕРИАЛЬНОГО ВИДА STREPTOCOCCUS INTERMEDIUS, ВЫЗВАВШЕГО АБСЦЕСС ГОЛОВНОГО МОЗГА, СЕКВЕНИРОВАНИЕМ ПО СЭНГЕРУ ГЕНА 16S РРНК ИЗ ДНК ОБРАЗЦА ГНОЯПредставлено описание клинического случая: наблюдали девочку в возрасте 14 лет 11 мес с абсцессом головного мозга, для которого не удалось установить возбудителя стандартными микробиологическими методами. До и в те-чение периода госпитализации у ребенка отсутствовала лихорадка, а многие антибиотики вызывали аллергические реакции, в связи с чем диагностика и терапия инфекции были затруднены. Пациентке были выполнены три опера-ции. Четырежды производили посев гноя из абсцесса, но ни разу не наблюдали роста культуры. Дважды проводи-ли ПЦР-анализ, но в обоих случаях результаты исследования были отрицательными. Тогда был амплифицирован и секвенирован по Сэнгеру ген 16S рРНК из образца ДНК, экстрагированной из гноя. С помощью программы BLAST была показана высокая гомология (99 %) определенной последовательности с последовательностью гена 16S рРНК бактерии Streptococcus intermedius (штамм ChDC B589, KF733728.1), для которой ранее была описана роль в раз-витии абсцессов головного мозга. Терапия ex juvantibus против этого микроорганизма, начатая еще до получения результатов секвенирования, привела к положительной динамике и купированию процесса у ребенка. Таким образом, в отдельных случаях секвенирование может являться практически единственным способом идентификации потенци-ального возбудителя.
IDENTIFICATION OF THE ATYPICAL BACTERIAL STRAIN STREPTOCOCCUS INTERMEDIUS THAT CAUSED BRAIN ABSCESS IN THE PATIENT USING SANGER SEQUENCING OF THE 16S RRNA GENE FROM THE DNA EXTRACTED FROM A PUS SAMPLEIn this article we present a clinical case of brain abscess in a girl aged 14 years and 11 months caused by a pathogen that could not be identified by routine microbiological testing. Before admission and during her stay in the hospital, the teenager did not have fever. Diagnosis and treatment were impeded by allergic responses to a wide range of antibiotics. The patient underwent three surgical interventions. Pus culture was performed 4 times, showing no growth. A PCR assay was run twice, but both times the results came out negative. Therefore, a decision was made to amplify and Sanger-sequence the 16S rRNA gene from the DNA extracted from patient's pus. BLAST showed a 99 % homology of the obtained nucleotide sequence to the sequence of the 16S rRNA gene of Streptococcus intermedius (strain ChDC B589, KF733728.1) which had been previously shown to play a role in brain abscess development. Treatment ex juvantibus against the pathogen was started before sequencing results were available. The patient responded positively, the symptoms were alleviated and the condition improved. Thus, we conclude that in some cases sequencing may be the only diagnostic technique capable of identifying the pathogen.