Crystal Structure of the Hemoglobin Dodecamer from Lumbricus Erythrocruorin: Allosteric Core of Giant Annelid Respiratory Complexes

Strand, Kristen; Knapp, James E.; Bhyravbhatla, Balaji; Royer, William E.

doi:10.1016/j.jmb.2004.08.094

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“…3). The C1 hemoglobin from the deep sea hydrothermal vent tubeworm Riftia pachyptila is assembled from 24 subunits, each half of which forms a hemoglobin dodecamer structure that is very similar to the dodecamers observed in the L. terrestris erythrocruorin structure (26,27).…”

Section: Extracellular Annelid Allosteric Hemoglobinsmentioning

confidence: 86%

Allosteric Hemoglobin Assembly: Diversity and Similarity

Royer

Zhu

Gorr

et al. 2005

Journal of Biological Chemistry

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Section: Extracellular Annelid Allosteric Hemoglobinsmentioning

confidence: 86%

Allosteric Hemoglobin Assembly: Diversity and Similarity

Royer

Zhu

Gorr

et al. 2005

Journal of Biological Chemistry

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“…16 . A hemoglobina de L. terrestris tem, inclusive, sido testada como sangue artificial em função da sua natureza extracelular, do seu grande tamanho e da sua resistência à oxidação [17][18][19] . De fato, Hirsch e colaboradores 17 asseveraram que a hemoglobina de L. terrestris apresenta, em meio neutro, afinidade por oxigênio e cooperatividade semelhantes à hemoglobina humana.…”

Section: Introductionunclassified

Estudo espectroscópico do equilíbrio entre espécies hexacoordenada e pentacoordenada dos monômero d nativo e reconstituído da hemoglobina extracelular gigante de Glossoscolex paulistus em meio alcalino

Ribelatto¹,

Poli²,

Moreira³

et al. 2006

Quím. Nova

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Recebido em 18/3/05; aceito em 16/9/05; publicado na web em 14/3/06 SPECTROSCOPIC STUDY OF THE EQUILIBRIUM BETWEEN HEXACOORDINATED AND PENTACOORDINATED SPECIES OF THE NATIVE AND RECONSTITUTED d MONOMERS OF THE Glossoscolex paulistus GIANT EXTRACELLULAR HEMOGLOBIN IN ALKALINE MEDIUM. UV-Vis and fluorescence spectroscopic studies of native and reconstituted d monomers fromGlossoscolex paulistus were performed in alkaline pH. In addition to the presence of aquomet and hemichrome hexacoordinated species, a pentacoordinated species occurs. This latter species, which presents an imidazolate group of axial histidine as fifth ligand, is identified by the blue-shifted low-intensity Soret band and LMCT band. The pentacoordinated species must occur due to partial polypeptide unfolding.Keywords: extracellular hemoglobin; hexacoordinated; pentacoordinated. . Essa menor ação em relação ao sistema imunológico ocorre por se tratar de uma hemoglobina extracelular, ou seja, não se encontra dentro de uma célula sanguínea, não tendo, portanto, sua presença associada concomitantemente à ocorrência das membranas plasmáticas inerentes às células, que são estruturas que induzem respostas imunológicas. INTRODUÇÃOA estrutura da hemoglobina de G. paulistus apresenta 144 globinas e 36 cadeias polipeptídicas sem o grupo prostético heme, que são cruciais para sua integridade estrutural (cadeias "linkers") 21 , sendo que o arranjo da hemoglobina íntegra se dispõe espacialmente como 2 discos hexagonais sobrepostos, com as subunidades estabilizadoras, "linkers", na porção central desse arranjo oligomérico 21 . De fato, em estudos com a hemoglobina de L. terrestris é proposta uma distribuição assimétrica para essas cadeias "linkers", o que estaria associado ao grande momento de dipolo apresentado pelo arranjo supramolecular 6 . As 144 globinas estão organizadas como 12 dodecâmeros, sendo que cada dodecâmero consiste em um conjunto de três tetrâmeros. Cada tetrâmero, por sua vez, é constituído por três trímeros (cadeias monoméricas a, b, c unidas covalentemente através de ligações dissulfeto) e uma cadeia monomérica d 11,22 . No presente trabalho, o monômero d foi isolado, em pH 9,0, através de um método de separação cromatográfica baseado na filtração em gel, visando a caracterização das espécies presentes no equilíbrio em meio alcalino. É importante mencionar que o estudo de uma cadeia única pode ser altamente relevante para a compreensão da hemoglobina como um todo devido à maior simplicidade dessa abordagem, já que pode haver diferenciação de propriedades entre os grupos heme do tetrâmero. Ademais, em se tratando de um estudo de reconstituição, não seria trivial uma abordagem que envolvesse um arranjo que apresenta 144 hemes, pois seria extremamente complexo garantir que todas as 144 globinas foram reconstituídas.Deste modo, a proposta deste estudo é avaliar os equilíbrios químicos das espécies formadas na primeira esfera de coordenação do centro férrico do monômero d em função do pH, em meio alcalino, uma vez que o trabalho anterior 23 foi d...

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“…The globin chains of the extracellular giant hemoglobins, interestingly, have a few Cys residues in the molecule. Recently, Strand et al has been reported the crystal structure of the hemoglobin dodecamer from Lumbricus erythrocruorin (Strand et al ., 2004). The structure reveals inter-disulfide bridges between A1 and B2 and between B1 and B2, respectively.…”

Section: Purification and Characterization Of The O Mashikoi Giant Hmentioning

confidence: 99%

Purification, Characterization and Sequence Analyses of the Extracellular Giant Hemoglobin from Oligobrachia mashikoi

et al. 2005

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-We purified an extracellular hemoglobin with the molecular mass of ca. 440 kDa from the whole homogenates of Oligobrachia mashikoi (phylum Pogonophora) by a one-step gel-filtration. The preparation was pure to be crystallized. The P 50 values of the hemoglobin and the fresh blood prepared from O. mashikoi were about 0.82 Torr and 0.9 Torr, respectively, which were much lower than the P 50 value of human hemoglobin. However, the n values of the hemoglobin and the blood were about 1.2 and 1.1, respectively.Using the improved tricine SDS-PAGE, we could separate O. mashikoi hemoglobin into four kinds of the globin chains, A1, A2, B1 and B2, and succeeded for the first time in cloning and sequencing of the complete cDNA encoding B1 globin gene, in addition to A1, A2 and B2 globin genes in full length. We found that all globin genes have the extracellular signal sequences in each molecule and the distal His of the B1 globin chain is replaced to Gln. Finally, we constructed phylogenetic trees of the hemoglobins from Pogonophora, Vestimentifera and Annelida.

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Crystal Structure of the Hemoglobin Dodecamer from Lumbricus Erythrocruorin: Allosteric Core of Giant Annelid Respiratory Complexes

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Allosteric Hemoglobin Assembly: Diversity and Similarity

Allosteric Hemoglobin Assembly: Diversity and Similarity

Estudo espectroscópico do equilíbrio entre espécies hexacoordenada e pentacoordenada dos monômero d nativo e reconstituído da hemoglobina extracelular gigante de Glossoscolex paulistus em meio alcalino

Purification, Characterization and Sequence Analyses of the Extracellular Giant Hemoglobin from Oligobrachia mashikoi

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