“…d amino acids are used to stabilize a bturn. [14] The concept of linking the structure and biological activity of peptides was already shown by Kessler et al with integrin-binding RGD pentapeptides. [15,16] A d-Pro-l-Pro motif was used as a turn mimetic to give biologically active peptides a defined conformation.…”
In the early detection of rheumatoid arthritis (RA) synthetic filaggrin peptides serve as antigens for rheumatoid-specific autoantibodies (anti-citrullinated peptide antibody, ACPA) in ELISA tests. In this work we present a peptide that exhibits the binding epitope of ACPA in the form of a stable folding β-hairpin. The homogeneity of the peptide folding was confirmed by NMR spectroscopy and might lead to the first proposed structure of the antibody-bound conformation of the epitope.
“…d amino acids are used to stabilize a bturn. [14] The concept of linking the structure and biological activity of peptides was already shown by Kessler et al with integrin-binding RGD pentapeptides. [15,16] A d-Pro-l-Pro motif was used as a turn mimetic to give biologically active peptides a defined conformation.…”
In the early detection of rheumatoid arthritis (RA) synthetic filaggrin peptides serve as antigens for rheumatoid-specific autoantibodies (anti-citrullinated peptide antibody, ACPA) in ELISA tests. In this work we present a peptide that exhibits the binding epitope of ACPA in the form of a stable folding β-hairpin. The homogeneity of the peptide folding was confirmed by NMR spectroscopy and might lead to the first proposed structure of the antibody-bound conformation of the epitope.
“…The structures of cyclo(-L-Ala-L-Pro-DPhe-) 2 (Brown & Teller, 1976) and cyclo(-Gly-Pro-DPhe-) 2 (Brown & Yang, 1979) are further examples of this observation. This work was supported by Grant No.…”
Section: Equivalent the Average Bond Distances [N(i)-c(ia) = 1458(6mentioning
“…Die Verwendung einer d-Aminosäure stabilisiert eine b-Schleife. [14] Das Konzept, Struktur und biologische Aktivität in einem Peptid zu vereinigen, wurde bereits von Kessler et al anhand von Integrinbindenden RGD-Pentapeptiden vorgestellt. [15,16] Ein d-Prol-Pro-Strukturmotiv wurde als Schleifen-Mimetikum verwendet, um biologisch aktiven Peptiden eine definierte Konformation zu geben.…”
unclassified
“…[19] An diese jeweils drei hydrophoben oder aromatischen Aminosäuren des N-und C-Terminus schließen sich Glu 4 und das gegenüberliegende Lys 7 an. In vergleichbarer relativer Anordnung (Abbildung 1) befinden sich Glu 7 und Arg 14 Der verlangsamte bI'/bII'-Wechsel der Schleife in der starren Haarnadel-Struktur von 4 führt zur Austauschverbreiterung der Amidprotonen von Cit 10 und Gly 11 . Mit den Aminosäuren Ala (Peptid 9) und d-Ala (Peptid 10) an der Position von Gly 11 wird jeweils eine b-Schleifen-Struktur energetisch begünstigt, wobei d-Ala, wie eingangs erwähnt, eine bII'-Schleife bildet.…”
[3] Die Sequenz dieses als cfc1-cyc (1) bezeichneten Peptids ist in Abbildung 1 dargestellt. Die Spezifität dieser Tests liegt bei 89-98 %, während als Empfindlichkeit für eine etablierte RA in verschiedenen Studien Werte zwischen 41 und 87 % angegeben werden. [3][4][5][6] Inzwischen wurden zwei weitere Generationen der CCP-ELISA-Tests mit verschiedenen citrullinierten Peptiden als Targets entwickelt, welche die Empfindlichkeit der Tests erhçhen. [7][8][9] Es gilt als gesichert, dass Citrullin durch die Harnstofffunktion das für die Antikçrperbindung essenzielle Hapten trägt, weil Mutanten mit der isosteren Aminosäure Arginin nicht erkannt werden.[1, 2, 10] Über die Geometrie der Bindung konnte bisher nur spekuliert werden, da das Cyclopeptid 1 keine erkennbare Vorzugskonformation aufweist. Wenn bereits die Makrocyclisierung durch ein Disulfid zur Erhçhung der Antikçrperbindung führt, dann gilt es zu untersuchen, ob die weitere strukturelle Restriktion des Epitops zu einem weiteren Gewinn an Selektivität und Affinität führt.Peptidliganden werden von Proteinen oft in einer bSchleifen-Konformation ("b-turn") gebunden, was für antikçrperbindende Peptide ebenfalls zu erwarten ist.[
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