CORRELAZIONE TRA VARIANTI ALLELICHE DEI GENI blaOXA-51-SIMILI E CLONALITÀ IN ACINETOBACTER BAUMANNII

Abstract

Esprimendo il valore in log10 abbiamo ottenuto una media di 5.16 con sd 0.26 e cv pari a 5.0. L'analisi statistica è stata effettuata anche per i risultati raggruppati in base al sistema analitico utilizzato. Conclusioni. I primi risultati hanno consentito di effettuare una valutazione positiva dello stato dell'arte. Particolarmente utile si è dimostrato l'utilizzo di standard internazionali che permettono di confrontare i risultati esprimendoli in UI/ml. L'esperienza fatta evidenzia che anche nel settore della Biologia Molecolare i programmi VEQ sono necessari al fine di una standardizzazione e al miglioramento della qualità dei risultati. Introduzione. I determinanti di resistenza antibiotica di classe C attivi sui beta-lattamici costituiscono un problema di grande rilevanza per il trattamento delle infezioni nosocomiali. La loro sovrapproduzione infatti è spesso associata a multiresistenza, e la problematica è ulteriormente complicata se alla sovrapproduzione enzimatica è associata anche una ridotta permeabilità di membrana al farmaco. 133Metodi. In questo lavoro è stato analizzato un isolato clinico multiresistente appartenente alla specie Enterobacter, che mostrava un fenotipo di sovrapproduzione di ampC rilevato con metodiche standard. La identificazione a livello di specie è stata effettuata tramite test biochimici, sequenziamento del DNA ribosomiale 16S e del gene hsp60. Il determinante di resistenza è stato amplificato tramite PCR, ed il frammento così ottenuto è stato sottoposto a sequenziamento su doppio filamento. Risultati. I risultati di identificazione di specie, effettuata sia con tecniche biochimiche che molecolari, hanno fornito risultati non univoci, ma che comunque hanno portato alla identificazione dell' isolato come appartenente al genere Enterobacter. Il sequenziamento dell'amplificato ottenuto con i primers specifici per i determinanti di resistenza di classe C del gruppo ACT/MIR, ha portato all' individuazione di una nuova variante allelica di blaACT-1, chiamata blaACT-2. blaACT-2 differisce da blaACT-1 per 4 nucleotidi mentre, a livello aminoacidico, essa differisce da ACT-1 per 1 aminoacido. blaACT-2 è stata depositata nel database EMBL con l' accession number AM076977. Conclusioni. Il gene blaACT-2 è stato amplificato da un ceppo clinico appartenente al genere Enterobacter. Le analisi biochimiche e molecolari portano alla conclusione che l' isolato è strettamente legato alle specie sakazakii, cloacae ed amnigenus anche se, come per altri casi riportati in letteratura, l' identificazione univoca a livello di specie più risolutiva non è possibile. Determinanti del gruppo ACT/MIR sono stati descritti in ceppi clinici solo sporadicamente e comunque, come si evince dalla letteratura, questa è la prima descrizione in Italia. Introduzione. Stipiti di Acinetobacter baumannii multiresistenti costituiscono un grave problema nelle infezioni nosocomiali. In tutto il mondo sono state descritte epidemie ospedaliere dovute a tale microrganismo che è divenuto endemico in alcune aree geografiche. La c...