Composition of the Gut Microbiome and the Risk of Bacterial Infections in Patients with Hematopoietic Stem Cell Transplantation

Abstract

Инфекционные осложнения являются одной из ведущих причин смертности у пациентов после трансплантации гемопоэтических стволовых клеток. Возможности в области выделения микроорганизмов методом секвенирования ДНК позволяют провести идентификацию микроорганизмов кожи, слизистых, и в первую очередь кишечника, для их филогенетического описания и оценки взаимодействия с организмом хозяина. В настоящем исследовании нами был изучен состав микробиома кишечника 70 пациентов после аллогенной или аутологичной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток и получены данные о повышении риска возникновения у пациентов в посттрансплантационной цитопении таких инфекционных осложнений, как сепсис, фебрильная нейтропения, возбудителя при росте представленности грамотрицательных бактерий типа Proteobacteria. Infectious complications are one of the leading causes of mortality in patients after hematopoietic stem cell transplantation. Opportunities in the field of isolating microorganisms using DNA sequencing make it possible to identify microorganisms of the skin, mucous, and, first of all, the intestin, for their phylogenetic description and assessment of interaction with the host organism. In the present study, we studied the composition of the gut microbiota of 70 patients after allogeneic or autologous hematopoietic stem cell transplantation and obtained data on an increased risk of infectious complications such as sepsis, febrile neutropenia and bloodstream infection in patients with post- transplant cytopenia, with an increase in the prevalence of gram-negative bacteria of the Proteobacteria type.