O uso da biomassa de microalgas na produção de biocombustíveis e extração de compostos bioativos é uma área de pesquisa que tem recebido muita atenção nos últimos anos. Objetivou-se com esse estudo realizar a extração do óleo e produção de biodiesel via saponificação direta a partir da microalga Scenedesmus quadricauda (Turpin) Brébisson, 1835 (Chlorophyta: Scenedesmaceae) e posterior identificação dos compostos bioativos presentes na fração insaponificável do processo. O cultivo de S. quadricauda foi realizado num raceway (13.000 L) usando extrato de biocomposto hortifrutis enriquecido com nitrato e fosfato como meio de cultura. Foram utilizados dois métodos para extração dos ésteres metílicos de ácidos graxos (Saponificação e transesterificação). Os ácidos graxos foram extraídos utilizando hexano. O material proveniente da esterificação dos ácidos graxos obtidos via saponificação e hidrólise foi submetido a etapas de lavagem com água destilada para remoção de resquícios de solvente e catalisador. A amostra resultante foi rotaevaporada e o biodiesel obtido. Análises foram realizadas na fração insaponificável identificando a presença de compostos bioativos (carotenoides) em grande quantidade (4.050 µg/g) como rota biotecnológica de aproveitamento de biomassa residual do processo de extração e produção do biodiesel. A fração insaponificável obtida no presente estudo apresentou alto índice de antioxidantes sendo eficiente na constituição de aditivos em biodiesel na adição de 1,25% ampliando a capacidade oxidativa do biocombustível. O biodiesel obtido via saponificação não apresenta viabilidade para sua utilização puro em motores devido a sua alta viscosidade e índice de oxidação pouco estabilizado, no entanto, apresenta viabilidade para sua inserção em blendas de biocombustível.