2014
DOI: 10.1093/gbe/evu249
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Comparative Genomics of the Campylobacter lari Group

Abstract: The Campylobacter lari group is a phylogenetic clade within the epsilon subdivision of the Proteobacteria and is part of the thermotolerant Campylobacter spp., a division within the genus that includes the human pathogen Campylobacter jejuni. The C. lari group is currently composed of five species (C. lari, Campylobacter insulaenigrae, Campylobacter volucris, Campylobacter subantarcticus, and Campylobacter peloridis), as well as a group of strains termed the urease-positive thermophilic Campylobacter (UPTC) an… Show more

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“…Para aumentar la eficiencia en el aislamiento y la detección de Campylobacter en alimentos y/o muestras ambientales, las metodologías han empleado una variedad de medios de enriquecimiento adicionados con antibióticos para disminuir la flora microbiana presente en la muestra y promover el crecimiento y aislamiento de Campylobacter cuando están presentes en cantidades bajas (Man, 2011;Kaakoush et al, 2015). Tomando en cuenta la movilidad de las campilobacterias, los protocolos de filtración por membrana han demostrado ser eficientes en la recuperación de las campilobacterias provenientes de muestras clínicas, ambientales y de alimentos ( Lastovica & Le Roux, 2000;Quiñones et al, 2007;Speegle et al, 2009;Miller et al, 2014;Miller et al, 2017).…”
Section: A Limited Number Of Published Reports Examinedunclassified
“…Para aumentar la eficiencia en el aislamiento y la detección de Campylobacter en alimentos y/o muestras ambientales, las metodologías han empleado una variedad de medios de enriquecimiento adicionados con antibióticos para disminuir la flora microbiana presente en la muestra y promover el crecimiento y aislamiento de Campylobacter cuando están presentes en cantidades bajas (Man, 2011;Kaakoush et al, 2015). Tomando en cuenta la movilidad de las campilobacterias, los protocolos de filtración por membrana han demostrado ser eficientes en la recuperación de las campilobacterias provenientes de muestras clínicas, ambientales y de alimentos ( Lastovica & Le Roux, 2000;Quiñones et al, 2007;Speegle et al, 2009;Miller et al, 2014;Miller et al, 2017).…”
Section: A Limited Number Of Published Reports Examinedunclassified
“…Sequencing was performed using a Pacific Biosciences (PacBio, Menlo Park, CA) RS II platform with 20-kb SMRTbell libraries as described previously (17). Briefly, SMRTbell libraries were prepared from 10 μg of bacterial genomic DNA with G-tube (Covaris, Woburn, MA) fragmentation using the described PacBio procedure (18) but with 1× AMPure cleanup and DNA repair after 10-kb size selection using BluePippin.…”
Section: Announcementmentioning
confidence: 99%
“…Protein-, rRNA- and tRNA-coding genes were identified as described previously (4). The genome contains 1,786 putative protein-coding genes, 63 pseudogenes, and 2 sets of rRNA genes.…”
Section: Genome Announcementmentioning
confidence: 99%