Comparative genomic hybridisation array and DNA sequencing to direct treatment of metastatic breast cancer: a multicentre, prospective trial (SAFIR01/UNICANCER)

L’invention de la médecine personnalisée

“…De plus, pour se limiter au cas de la France, des essais cliniques qui répondent au schéma opératoire impliquant une stratification des malades fondée sur le profil moléculaire de la tumeur primitive, ou des métastases, sont, soit en cours, soit arrivés à leur terme. Il s'agit par exemple, des essais SAFIR01 et MOSCATO, à l'Institut Gustave Roussy, SHIVA à l'Institut Curie ou PRO-FILER au Centre Léon Bérard [30,34,35]. L'approche choisie consiste à utiliser des méthodes moléculaires à haut débit incluant le CGH array 2 et le séquençage d'une série de gènes « actionnables » ou de l'exome (partie du génome constitué par les exons) à partir de la tumeur primitive ou de métastases, afin d'identifier les altérations moléculaires susceptibles d'être ciblées par des médicaments existants [34,35].…”

“…Il s'agit par exemple, des essais SAFIR01 et MOSCATO, à l'Institut Gustave Roussy, SHIVA à l'Institut Curie ou PRO-FILER au Centre Léon Bérard [30,34,35]. L'approche choisie consiste à utiliser des méthodes moléculaires à haut débit incluant le CGH array 2 et le séquençage d'une série de gènes « actionnables » ou de l'exome (partie du génome constitué par les exons) à partir de la tumeur primitive ou de métastases, afin d'identifier les altérations moléculaires susceptibles d'être ciblées par des médicaments existants [34,35]. D'autres types d'essais cliniques ont pour but d'aller au-delà de la logique de la stratification (essai clinique SAFIR02).…”

“…Lorsque Xavier Bichat (1771-1802) écrivit dans son ouvrage d'Anatomie générale « Ouvrez quelques cadavres, vous verrez aussitôt DÉBAT FORUM la capacité d'un algorithme bioinformatique à identifier les bonnes cibles pour une prise en charge « vraiment » personnalisée -certains acteurs dans ce domaine n'hésitent pas ainsi, à distinguer la médecine stratifiée et la médecine personnalisée [30,34,35]. Sous l'impulsion de cette médecine moléculaire, de nouvelles stratégies de recherche clinique sont aussi en train de voir le jour, comme les essais cliniques ayant pour but d'évaluer l'effet d'un médicament ciblé sur une mutation « actionnable » sans tenir compte des caractéristiques histologiques de la tumeur (basket trials) [36].…”

De l’exome à l’avatar : vers une « oncologie de précision » ?

“…On se retrouvera donc de plus en plus dans la situation où, après analyse de l'ADN de la tumeur, plusieurs possibilités de traitement sont ouvertes. Par ailleurs, l'expérience à ce jour indique que le taux de succès est faible, seuls 10 à 20 % des interventions suggérées par la génomique s'avérant efficaces [2,3]. Il devient donc très important d'avoir des indications complémentaires pour faire le meilleur choix, et le passage par un test sur un avatar portant la tumeur du patient est indubitablement une option intéressante, d'autant que les études rapportées dans cette chronique montrent toutes une bonne cohérence entre efficacité sur l'avatar et réponse chez le patient [5][6][7][8].…”

“…Mais il faut reconnaître que, pour le moment, cette approche séduisante n'a pas encore fait la preuve de son utilité clinique, à savoir la démonstration d'une amélio-ration statistiquement significative de l'évolution des patients. À cet égard, la récente publication des résultats de l'essai français SAFIR01 [2] a fait l'effet d'une douche froide [1]. Dans cet essai clinique multicentrique, qui avait inclus plus de 400 patientes atteintes de cancer du sein métastatique, une douzaine de gènes ont pu être analysés chez 300 d'entre elles, une altération pathogène a été trouvée chez près de 200, mais, au final, une thérapie personnalisée n'a pu être proposée que pour 55 malades (et effectivement réalisée chez 43).…”