Cloning and expression profiling of testis-expressed microRNAs

Ro, Seungil; Park, Chanjae; Sanders, Kenton M.; McCarrey, John R.; Yan, Wei

doi:10.1016/j.ydbio.2007.09.009

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“…The roles of miRNAs in mammalian testis and spermatogenesis have been identified by the facts that a number of miRNAs are expressed preferentially in male germ cells (Ro et al 2007) and a suite of novel miRNAs are expressed in spermatozoa [35].…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

“…MiRNAs are short (∼22 nt in length) non-coding RNA molecules that bind specifically to mRNA molecules to posttranscriptional control of gene expression [52]. They regulate multiple intracellular processes, such as differentiation, growth, apoptosis [40,42] and the response to cellular stress. Alterations in miRNAs expression may occur following exposure to stress-generating agents.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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TBHP-induced oxidative stress alters microRNAs expression in mouse testis

Fatemi

Sanati

Shamsara

et al. 2014

J Assist Reprod Genet

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Purpose Reactive oxygen species (ROS) and oxidative stress is one of the main reasons of male infertility. MicroRNAs (miRNAs) regulate multiple intracellular processes. Alterations in miRNAs expression may occur in different conditions and diseases. In this study, the effect of oxidative stress induced by tertiary-butyl hydroperoxide (TBHP) on the expression of candidate miRNAs in mouse testis was investigated.Methods After determining median lethal dose (LD 50 ), TBHP was intraperitoneally (ip) injected at the dilution of 1:10 LD 50 into the adult male mice for 2weeks, and then testis tissues were removed in order to assay the ROS level. Total RNA was extracted and the expression of five miRNAs was quantified by reverse transcription-real time polymerase chain reaction (RT-qPCR).Results The flow cytometry analysis showed a significant increase in ROS level in testis. The expression of three out of five selected miRNAs, including miR-34a, miR-181b and miR-122a, showed some degrees of changes following exposure to oxidative stress. These miRNAs are involved in antioxidant responses, inflammation pathway and spermatogenesis arrest. Conclusions In conclusion, TBHP alters the miRNA expression profile of testis which might play a potential role in oxidative and antioxidative responses and spermatogenesis.

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Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

TBHP-induced oxidative stress alters microRNAs expression in mouse testis

Fatemi

Sanati

Shamsara

et al. 2014

J Assist Reprod Genet

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“…Prediction of microRNA targets in 39 UTRs was based on context scoring (Grimson et al 2007) performed with TargetScanMouse 5.0. We identified the most abundant microRNAs in various mouse tissues via a public microRNA expression database (Betel et al 2008) or literature (Sood et al 2006;Ro et al 2007). Overrepresentation of repressed genes in the target list was assessed with the hypergeometric test.…”

Section: Bioinformaticsmentioning

confidence: 99%

Tissue-specific disallowance of housekeeping genes: The other face of cell differentiation

Thorrez¹,

Laudadio²,

Deun³

et al. 2010

Genome Res.

175

202

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We report on a hitherto poorly characterized class of genes that are expressed in all tissues, except in one. Often, these genes have been classified as housekeeping genes, based on their nearly ubiquitous expression. However, the specific repression in one tissue defines a special class of “disallowed genes.” In this paper, we used the intersection-union test to screen for such genes in a multi-tissue panel of genome-wide mRNA expression data. We propose that disallowed genes need to be repressed in the specific target tissue to ensure correct tissue function. We provide mechanistic data of repression with two metabolic examples, exercise-induced inappropriate insulin release and interference with ketogenesis in liver. Developmentally, this repression is established during tissue maturation in the early postnatal period involving epigenetic changes in histone methylation. In addition, tissue-specific expression of microRNAs can further diminish these repressed mRNAs. Together, we provide a systematic analysis of tissue-specific repression of housekeeping genes, a phenomenon that has not been studied so far on a genome-wide basis and, when perturbed, can lead to human disease.

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“…Jusqu'à présent, le nombre de miARN identifiés dans le testicule est évalué à 141. Parmi ceux-ci, 35 % sont préférentiellement exprimés dans le testicule tandis que 5 % y sont exclusivement présents [10]. Récemment, le décryptage de l'ensemble des miARN exprimés dans les cellules germinales à l'aide de techniques de séquençage à grande échelle a permis d'identifier de nouveaux miARN spécifiquement exprimés dans le testicule prépubère [11].…”

Section: Revuesunclassified

Petits ARN non codants et spermatogenèse

Romero

Nef

2012

Med Sci (Paris)

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> La production continue de spermatozoïdes est un processus biologique strictement régulé, tant au niveau transcriptionnel que post-transcriptionnel. Récemment, les petits ARN non codants ont été identifiés dans la lignée germinale mâle et dans les cellules somatiques testiculaires et se sont avérés essentiels à la fertilité masculine. Cette revue décrit nos connaissances dans le domaine de la biogenèse des petits ARN non codants et de leurs fonctions au cours de la spermatogenèse. Ces données, bien que parcellaires, soulignent le rôle crucial de ces ARN dans la régulation fine de l'expression des gènes essentiels à la fonction testiculaire. < Ces schémas d'expressions complexes, qui se déroulent au sein d'un même lignage cellulaire, impliquent ainsi l'existence de régulations transcriptionnelles ou traductionnelles permettant l'enchaînement approprié d'événements cellulaires majeurs tels que la recombinaison homologue, la condensation nucléaire ou la formation du flagelle. Dans ce contexte, un nouvel échelon de régulations post-transcriptionnelles a été récemment identifié, en l'objet des petits ARN non codants. Le but de cette revue est non seulement de décrire les différentes classes de petits ARN non codants présents dans les cellules germinales et somatiques du testicule, mais également de détailler leur mode d'action et leur impact sur la spermatogenèse et la fonction testiculaire en général. Classification et description des petits ARN non codantsLes ARN non codants, comme leur nom l'indique, sont des transcrits qui ne codent pas pour une protéine. La famille des ARN non codants comprend historiquement les ARN de transfert (ARNt), les ARN ribosomiques (ARNr), les petits ARN nucléaires (snRNA pour small nuclear RNA) et les petits ARN nucléolaires (snoRNA pour small nucleolar RNA), chacune de ces catégories s'avérant essentielle au processus de traduction dans toutes les cellules d'un organisme donné. La famille des ARN non codants s'est agrandie depuis une quinzaine d'années avec l'identification progressive de nouvelles classes d'ARN non codants de taille inférieure à 40 nucléotides, telles que les microARN (miARN), les ARN interagissant avec la protéine PIWI (P-element induced wimpy testis piARN pour PIWI-interacting RNA) et les petits ARN interférents endogènes (endo-siARN). Ces petits ARN non codants, qui font l'objet de cette revue, remplissent de multiples fonctions dont celles de l'inhibition post-transcriptionnelle des gènes et de la répression des rétrotransposons. Ils modulent des processus La spermatogenèse est le processus biologique par lequel des cellules souches diploïdes, les spermatogonies, se différencient en gamètes haploïdes, les spermatozoïdes. Ce processus complexe est divisé en trois phases. Au cours de la 1 re phase, dite mitotique, les spermatogonies se renouvellent et prolifèrent activement avant leur entrée dans la 2 e phase de méiose. Cette seconde phase permet le brassage aléatoire de l'information génétique (processus de recombinaison) dans les spermatocytes, ce qui produit de...

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Cloning and expression profiling of testis-expressed microRNAs

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TBHP-induced oxidative stress alters microRNAs expression in mouse testis

TBHP-induced oxidative stress alters microRNAs expression in mouse testis

Tissue-specific disallowance of housekeeping genes: The other face of cell differentiation

Petits ARN non codants et spermatogenèse

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