Clinical Implications of Multiplex Pathogen Panels for the Diagnosis of Acute Viral Gastroenteritis

Abstract

Acute gastroenteritis remains a significant cause of morbidity and mortality both in high and low-resource settings. The development of nucleic acid based testing has demonstrated that viruses are a common, yet often undetected, cause of acute gastroenteritis. The development of multiplex pathogen PCR panels makes it possible to detect these viral pathogens with greater sensitivity and rapidity than with previous methods. At present, there is insufficient evidence to recommend the routine use of these panels for the average patient with acute gastroenteritis. However, there are specific scenarios and patient populations such as epidemiology/outbreak surveillance, antimicrobial stewardship, and the care of immunocompromised patients where these tests could be clinically useful today. Further research on the effect of these syndromic panels on provider antibiotic prescribing behavior and patient length of stay will be necessary in order to know their ultimate role in clinical practice.

S2k-Leitlinie Gastrointestinale Infektionen der Deutschen Gesellschaft für Gastroenterologie, Verdauungs- und Stoffwechselkrankheiten (DGVS)

“…Zusätzlich zu kulturellen Verfahren sind Nukleinsäure-basierte Nachweisverfahren in begründeten Situationen bei Immundefizienz zur simultanen Testung von derzeit 5 bis zu 24 enteropathogenen Erregern im Stuhl (sogenannte "Gastroenteritis-Panel") eine sinnvolle Ergänzung (siehe Empfehlung 1.7) [243,250,251]. Es liegen zahlreiche publizierte Daten vor, die eine hohe Sensitivität und Spezifizität der unterschiedlichen Testverfahren nachweisen.…”

“…14 unten), nachweisen [252,253]. Eine CMV-Diagnostik ist bisher jedoch in keinem der zugelassenen Multiplex-PCR Panels enthalten [243,251]. Obwohl diesbezüglich nur wenige Daten zur Verfügung stehen und eine geringe Evidenz für die Multiplex-Diagnostik bei Immunsupprimierten vorliegt, wird diese Diagnostik bereits für Organtransplantierte in der Leitlinie der Amerikanischen Gesellschaft für Transplantation empfohlen [240].…”

“…Obwohl diesbezüglich nur wenige Daten zur Verfügung stehen und eine geringe Evidenz für die Multiplex-Diagnostik bei Immunsupprimierten vorliegt, wird diese Diagnostik bereits für Organtransplantierte in der Leitlinie der Amerikanischen Gesellschaft für Transplantation empfohlen [240]. Insbesondere für die Therapieentscheidungen bei immunkompromittierten Patienten ist der Ausschluss einer Infektion von großer Bedeutung, weshalb eine Multiplex-PCR für diese Patienten als sinnvoll erachtet wird [240,250,251]. Der zeitnahe Erregernachweis durch Multiplex-Panel Diagnostik führte in einer Studie bei HIV Patienten zu einem besseren Antibiotika-Management [254].…”

Rotavirus infection in children: clinical and etiological structure and analysis of vaccine prophylaxis

“…Установленные нами закономерности позволяют полагать, что некоторые проблемы, связанные с вакцинопрофилактикой РВИ и улучшением эффекта существующих вакцин, могут быть решены с помощью мультиплексных панелей патогенов для диагностики острого вирусного гастроэнтерита, биосенсоров и новых вакцин, для профилактики РВИ [32][33][34][35].…”

Enhancing enteric pathogen detection: implementation and impact of multiplex PCR for improved diagnosis and surveillance

“…Recent advancements in molecular diagnostic technology with multiplexing capabilities have made possible syndromic nucleic acid amplification for the diagnosis of many causative agents, which may not be detected by conventional methods [ 11 – 21 ]. The application of these assays has significantly reduced the turnaround time of detection hence improving the value of an etiologic diagnosis with respect to the patients’ management [ 15 , 17 , 22 , 23 ].…”