Este estudo teve como objetivo compreender a dinâmica socioambiental sobre a morbidade da malária em Manaus. Para isso, utilizou-se da fundamentação teórica-metodológica do ritmo climático e do Sistema Ambiental Urbano (S.A.U.). Foram analisados os dados das variáveis climáticas e hidrológicas obtidas no INMET e Porto de Manaus, dados socioeconômicos e ambientais urbanos obtidos na IMPLURB e os dados referentes aos casos confirmados de malária foram obtidos no SIVEPMALÁRIA. Os dados foram tratados com técnicas estatísticas descritivas, regressão múltipla e o método das medianas para identificação da vulnerabilidade socioambiental da morbidade da Malária em Manaus. Os resultados mostraram que a ocorrência da malária apresenta padrão bimodal em Manaus, sendo que a precipitação pluvial mensal e as cotas fluviais influenciaram na epidemiologia da doença e apresentaram maior poder de explicação entre as variáveis. A análise rítmica demonstrou que os dias consecutivos com elevadas temperaturas do ar, com pouca ou nenhuma nebulosidade e pequenos volumes diários de precipitação pluvial se relacionam positivamente ao desenvolvimento do vetor. O risco e a vulnerabilidade socioambiental predominaram em bairros com saneamento ambiental precário, maior distância dos postos de saúde, baixa renda e taxa de alfabetização. Os resultados apresentados podem contribuir para a (re) formulação de políticas públicas visando a melhoria das condições socioambientais e do controle epidemiológico da doença.