Citrus somatic hybrid: an alternative system to study rapid structural and epigenetic reorganization in allotetraploid genomes

Genetic and Epigenetic Changes in Somatic Hybrid Introgression Lines Between Wheat and Tall Wheatgrass

“…It has been successfully exploited in bread wheat to transfer chromosomal segments from a number of related species Xiang et al 2003Xiang et al , 2004Cheng et al 2004;Zhou and Xia 2005;Xia 2009). More importantly, asymmetric somatic hybridization offers smaller alien chromatin introgression, thereby overcoming a significant problem in wheat sexual hybrids where the Ph1 gene prevents homeologous recombination (Griffiths et al 2006).Newly synthesized allopolyploids have provided an opportunity to explore the nature of the genetic and epigenetic changes triggered by polyploidization (Song et al 1995;Comai et al 2000;Ozkan et al 2001;Shaked et al 2001;Madlung et al 2002;Han et al 2003;Ma et al 2004;Wang et al 2004a;Salmon et al 2005;Tate et al 2006;Bassene et al 2010;Xu et al 2014), although a few allopolyploids were not accompanied with such changes (Liu et al 2001). Experimental results indicate that the majority of events are highly reproducible (Bento et al 2010).…”

“…Newly synthesized allopolyploids have provided an opportunity to explore the nature of the genetic and epigenetic changes triggered by polyploidization (Song et al 1995;Comai et al 2000;Ozkan et al 2001;Shaked et al 2001;Madlung et al 2002;Han et al 2003;Ma et al 2004;Wang et al 2004a;Salmon et al 2005;Tate et al 2006;Bassene et al 2010;Xu et al 2014), although a few allopolyploids were not accompanied with such changes (Liu et al 2001). Experimental results indicate that the majority of events are highly reproducible (Bento et al 2010).…”

Identificación de caracteres fisiológicos y moleculares para la tolerancia a estreses abióticos en portainjertos de cítricos tetraploides.

“…En cítricos se han detectado variaciones a nivel subcromosómico en diferentes HS (Olivares-Fuster, 1998;Froelicher, 1999;Guo et al, 2007;Xu et al, 2014), aunque los estudios que las describen son muy escasos. Generalmente los análisis genéticos de HS se han realizado con un número muy reducido de marcadores moleculares, suficientes para constatar que los HS adicionan los genomas de los dos parentales, pero que resultan insuficientes para identificar este tipo de cambios (Oberwalder et al, 1998;Guo y Deng, 1999).…”

“…No obstante, los estudios que analizan el proceso de generación de variabilidad mediante hibridación somática realizados en las últimas décadas, gran parte de los cuales han sido llevados a cabo en cítricos, revelan que la expresión de los caracteres de los híbridos puede no ser aditiva. En éstos casos, el fenotipo del híbrido no es necesariamente la suma del efecto de los alelos parentales reunidos, ya que se ha observado que la alopoliploidización genera modificaciones en la expresión génica, cambios epigenéticos y fenotípicos (Bassene et al, 2009;Bassene et al, 2010;Dambier et al, 2011;Xu et al, 2014;) y se ha discutido en qué medida se deben a la interespecificidad de los genomas parentales reunidos, cuya interacción de novo afecta profundamente a la expresión génica (Hegarty et al, 2009), o a la ganancia de ploidía (Dambier et al, 2011).…”

“…Este fenómeno, que ha sido englobado bajo el término de shock genómico (Song et al, 1995), es de naturaleza dinámica y estocástica y se compone de procesos variados como son la eliminación de fragmentos del genoma a nivel sub-cromosómico o cromosómico y su intercambio, modificaciones en la metilación, regulaciones en la represión/expresión de genes o activación de elementos transponibles, entre otros (Chen, 2007;Xu et al, 2014). Estos cambios afectan a la expresión génica, bien mediante la alteración de la secuencia o bien debido a cambios en la regulación epigenética (Comai, 2005), proporcionando al genoma plasticidad y mejorando así la capacidad de los híbridos para su adaptación al ambiente (Chen, 2007).…”