Circulating Tumor Cells, DNA, and mRNA: Potential for Clinical Utility in Patients With Melanoma

Xu, Melody J.; Dorsey, Jay F.; Amaravadi, Ravi K.; Karakousis, Giorgos C.; Simone, Charles B.; Xu, Xiaowei; Xu, Wei; Schuchter, Lynn M.; Kao, Gary D.

doi:10.1634/theoncologist.2015-0207

Cited by 20 publications

(18 citation statements)

References 97 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Cell-free DNA is released from both normal and tumour cells via a variety of mechanisms, including apoptosis and necrosis. ctDNA contains the same genetic alterations present in the source tumour (4)(5)(6). In particular, ctDNA with mutations in EGFR, KRAS, or BRAF is detected in cancer patients, and the detection of mutations in ctDNA is under investigation as a specific biomarker for the diagnosis and monitoring of patients with different cancer types (7)(8)(9)(10)(11).…”

mentioning

confidence: 99%

Circulating Tumour DNA for Monitoring Treatment Response to Anti-PD-1 Immunotherapy in Melanoma Patients

Ashida

Sakaizawa²,

Uhara³

et al. 2017

Acta Derm Venerol

View full text Add to dashboard Cite

Anti-programmed cell death-1 (anti-PD-1) antibody shows high therapeutic efficacy in patients with advanced melanoma. However, assessment of its therapeutic activity can be challenging because of tumour enlargement associated with intratumoural inflammation. Because circulating tumour DNA (ctDNA) correlates with tumour burden, we assessed the value of ctDNA levels as an indicator of tumour changes. Quantification of ctDNA (BRAFmutant or NRASmutant) levels by droplet digital PCR in 5 patients with BRAF or NRAS mutant melanoma during the treatment course showed dynamic changes corresponding to radiological and clinical alterations. In 3 cases in which the anti-PD-1 antibody was effective, ctDNA levels decreased within 2-4 weeks after treatment initiation. In 2 cases in which the anti-PD-1 antibody was ineffective, ctDNA levels did not decrease after treatment initiation. ctDNA could be a useful biomarker to predict early response to treatment in patients with advanced melanoma treated with anti-PD-1 immunotherapy.

show abstract

mentioning

confidence: 99%

Circulating Tumour DNA for Monitoring Treatment Response to Anti-PD-1 Immunotherapy in Melanoma Patients

Ashida

Sakaizawa²,

Uhara³

et al. 2017

Acta Derm Venerol

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…There is an accumulated evidence of numerous miRNA tested in prostate cancer tissue samples acting as tumour suppressors [ 195 , 196 ]. ERG is able to bind to miR-200b/a/429 assisting transcription in PC cells in tumour tissues [ 196 ].…”

Section: Cell-free Nucleic Acids In Cancer Managementmentioning

confidence: 99%

Cell-free nucleic acid patterns in disease prediction and monitoring—hype or hope?

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

Interest in the use of cell-free nucleic acids (CFNAs) as clinical non-invasive biomarker panels for prediction and prevention of multiple diseases has greatly increased over the last decade. Indeed, circulating CFNAs are attributable to many physiological and pathological processes such as imbalanced stress conditions, physical activities, extensive apoptosis of different origin, systemic hypoxic-ischemic events and tumour progression, amongst others. This article highlights the involvement of circulating CFNAs in local and systemic processes dealing with the question, whether specific patterns of CFNAs in blood, their detection, quantity and quality (such as their methylation status) might be instrumental to predict a disease development/progression and could be further utilised for accompanying diagnostics, targeted prevention, creation of individualised therapy algorithms, therapy monitoring and prognosis. Presented considerations conform with principles of 3P medicine and serve for improving individual outcomes and cost efficacy of medical services provided to the population.

show abstract

“…Coraz więcej doniesień wskazuje również na użyteczność profilowania RNA z krwi w genetyce klinicznej. W szczególności wskazuje się na wysoką, potencjalną użyteczność profilowania RNA w diagnostyce nowotworów [4][5][6][7] czy chorób autoimmunologicznych [8].…”

Section: Wprowadzenieunclassified

“…In addition, there is a growing number of reports indicating that the profiling of RNA derived from blood samples is a valuable technique in clinical genetics. In particular, RNA profiling is claimed to be potentially highly useful in the diagnosis of cancer [4][5][6][7] or autoimmune diseases [8].…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

RNA isolation from bloodstains collected on FTA cards – application in clinical and forensic genetics

Skonieczna¹,

Styczyński²,

Krenska³

et al. 2016

amsik

View full text Add to dashboard Cite

StreszczenieCel pracy: W ostatnich latach coraz częściej zwraca się uwagę na przydatność analiz RNA w badaniach z zakresu genetyki klinicznej oraz sądowej. Znaczącym problemem podczas prac nad RNA jest jednak jego niska stabilność wynikająca z aktywności RNAz. Tym samym unaocznia się potrzeba doskonalenia metod odpowiedniego zabezpieczania materiału biologicznego do analiz RNA. Rozwiązania technologiczne w postaci kart FTA (Whatman) mogą być uży-teczne w kontekście zabezpieczania, transportu i przechowywania materiału biologicznego do badań RNA. Jednakże na ilość i jakość RNA uzyskiwanego z kart FTA mogą mieć wpływ różne warunki jego izolacji. Celem niniejszej pracy była analiza wydajności trzech metod izolacji RNA z krwi obwodowej zabezpieczonej na kartach FTA Classic Card (Whatman) oraz ocena stabilności RNA w plamach krwi zabezpieczonych na takich kartach. Materiał i metody: Badania przeprowadzono na plamach krwi zabezpieczonych na FTA Classic Card (Whatman) od 59 osób. RNA wyizolowano z wykorzystaniem High Pure RNA Isolation Kit (Roche Diagnostics), Universal RNA/ miRNA Purification (EURx) oraz TRIzol Reagent (Life Technologies). RNA poddano ocenie ilościowej, a następnie przeprowadzono odwrotną transkrypcję oraz PCR w czasie rzeczywistym. Wyniki: Przeprowadzone badania wskazują, że karty FTA Classic Card (Whatman) stanowią użyteczne podłoże do przechowywania w temperaturze pokojowej plam krwi do badań RNA. Ponadto wykazano, że metoda izolacji z wykorzystaniem odczynnika TRIzol Reagent (Life Technologies) charakteryzuje się najwyższą skutecznością i wydajnością w przypadku próbek przechowywanych do około 2 lat. Wnioski: Przeprowadzone badania wykazały, że karty FTA mogą stanowić użyteczne podłoże do badań RNA w genetyce klinicznej i sądowej.Słowa kluczowe: plamy krwi, RNA, degradacja RNA, ekspresja genów, karty FTA. AbstractAim of the study: In recent years, RNA analysis has been increasingly used in clinical and forensic genetics. Nevertheless, a major limitation of RNA-based applications is very low RNA stability in biological material, due to the RNAse activity. This highlights the need for improving the methods of RNA collection and storage. Technological approaches such as FTA Classic Cards (Whatman) could provide a solution for the problem of RNA degradation. However, differ- WprowadzenieProfilowanie DNA uzyskanego z materiału biologicznego w postaci krwi jest powszechnie wykorzystywane w genetyce sądowej do badań pokrewieństwa, indywidualizacji plam zabezpieczonych na miejscu zdarzeń kryminalnych, a także do identyfikacji ofiar katastrof czy wypadków. W ostatnich latach coraz częściej zwraca się również uwagę na przydatność analiz RNA w badaniach genetyczno--sądowych. Ostatnie doniesienia wskazują na uży-teczność mRNA w odróżnianiu m.in. krwi obwodowej od menstruacyjnej [1], co może mieć istotne znaczenie w ustalaniu szczegółów przebiegu przestępstwa [za 2]. Ponadto analiza ekspresji genów we krwi może być również informatywna w określaniu przyczyny zgonu, np. na skutek niedotlenienia, uduszenia czy ...

show abstract

Circulating Tumor Cells, DNA, and mRNA: Potential for Clinical Utility in Patients With Melanoma

Cited by 20 publications

References 97 publications

Circulating Tumour DNA for Monitoring Treatment Response to Anti-PD-1 Immunotherapy in Melanoma Patients

Circulating Tumour DNA for Monitoring Treatment Response to Anti-PD-1 Immunotherapy in Melanoma Patients

Cell-free nucleic acid patterns in disease prediction and monitoring—hype or hope?

RNA isolation from bloodstains collected on FTA cards – application in clinical and forensic genetics

Contact Info

Product

Resources

About