ChemInform Abstract: NEW DERIVATIVES OF 6‐AZAURACIL

Alekseeva, I. V.; Shalamai, A. S.; Shalamai, V. S.; Chernetskii, V. P.

doi:10.1002/chin.197629261

Cited by 2 publications

(2 citation statements)

References 0 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…The synthesis of the novel nucleoside a‐fdC ( 3 ) is depicted in Scheme . The synthesis was started with bromo pyruvic acid ( 4 ), which we first converted into the semicarbazone 5 , followed by conversion into the acid chloride, subsequent cyclization, and hydrolysis to give hydroxymethylated 6‐aza‐uracil ( 6 ) . Vorbrüggen nucleosidation with Hoffers’ chlorosugar subsequently provided the nucleoside 7 as a mixture of the α‐ and β‐anomers, which could be separated by recrystallization.…”

Section: Figurementioning

confidence: 99%

Analysis of an Active Deformylation Mechanism of 5‐Formyl‐deoxycytidine (fdC) in Stem Cells

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

The removal of 5‐methyl‐deoxycytidine (mdC) from promoter elements is associated with reactivation of the silenced corresponding genes. It takes place through an active demethylation process involving the oxidation of mdC to 5‐hydroxymethyl‐deoxycytidine (hmdC) and further on to 5‐formyl‐deoxycytidine (fdC) and 5‐carboxy‐deoxycytidine (cadC) with the help of α‐ketoglutarate‐dependent Tet oxygenases. The next step can occur through the action of a glycosylase (TDG), which cleaves fdC out of the genome for replacement by dC. A second pathway is proposed to involve C−C bond cleavage that converts fdC directly into dC. A 6‐aza‐5‐formyl‐deoxycytidine (a‐fdC) probe molecule was synthesized and fed to various somatic cell lines and induced mouse embryonic stem cells, together with a 2′‐fluorinated fdC analogue (F‐fdC). While deformylation of F‐fdC was clearly observed in vivo, it did not occur with a‐fdC, thus suggesting that the C−C bond‐cleaving deformylation is initiated by nucleophilic activation.

show abstract

Section: Figurementioning

confidence: 99%

Analysis of an Active Deformylation Mechanism of 5‐Formyl‐deoxycytidine (fdC) in Stem Cells

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Der Ausgangsstoff der Synthese war Brombrenztraubensäure 4 , die zunächst in Semicarbazon 5 umgewandelt wurde. Nach anschließender Umwandlung in dessen Säurechlorid, Zyklisierung und Hydrolyse, wurde hydroxymethyliertes 6‐Aza‐Uracil 6 erhalten . Vorbrüggen‐Nukleosidierung mit dem Hoffer'schen Chlorzucker lieferte Nukleosid 7 als Mischung aus α‐ und β‐Anomeren, die durch Umkristallisation getrennt werden konnten.…”

Section: Figureunclassified

Analyse des aktiven Deformylierungsmechanismus von 5‐Formyl‐2′‐Desoxycytidin in Stammzellen

et al. 2020

View full text Add to dashboard Cite

5‐Methyl‐2′‐Desoxycytidin (mdC) wird als fünfte Base des genetischen Systems betrachtet, dessen Anwesenheit zur Unterdrückung der Expression korrespondierender Gene beiträgt. Die Entfernung der Modifikation und Reaktivierung der unterdrückten Gene ist durch einen noch nicht vollständig aufgeklärten aktiven Demethylierungsmechanismus möglich. Dieser setzt die Oxidationsreaktionen von mdC zum 5‐Hydroxymethyl‐2′‐Desoxycytidin (hmdC) und weiter zum 5‐Formyl‐2′‐Desoxycytidin (fdC) und 5‐Carboxy‐2′‐Desoxycytidin (cadC) voraus, die durch α‐Ketoglutarat‐abhängige Tet‐Oxygenasen katalysiert werden. Die Entfernung von mdC geschieht auf den Oxidationsstufen des fdC und cadC. Neben dem Eingreifen bestimmter Glykosylasen (TDG) beschreibt ein zweiter Weg eine C‐C‐Bindungsspaltung, die fdC direkt in dC umwandelt. Während der TDG‐induzierte Reparaturmechanismus gut charakterisiert ist, existieren zum Mechanismus durch C‐C‐Bindungsbruch noch sehr wenige Informationen. Hier führen wir ein neuartiges 6‐Aza‐5‐Formyl‐2′‐Desoxycytidin‐Testmolekül (a‐fdC) ein, das verschiedenen somatischen Zelllinien und induzierten mESCs zusammen mit einem 2′‐fluorierten fdC‐Analogon (F‐fdC) gefüttert wurde. Während die Deformylierung von F‐fdC in vivo eindeutig beobachtet werden konnte, wurde sie für a‐fdC hingegen nicht beobachtet, was vermuten lässt, dass die Deformylierung über C‐C‐Bindungsbruch nach vorhergehender nukleophiler Aktivierung erfolgt.

show abstract

ChemInform Abstract: NEW DERIVATIVES OF 6‐AZAURACIL

Cited by 2 publications

References 0 publications

Analysis of an Active Deformylation Mechanism of 5‐Formyl‐deoxycytidine (fdC) in Stem Cells

Analysis of an Active Deformylation Mechanism of 5‐Formyl‐deoxycytidine (fdC) in Stem Cells

Analyse des aktiven Deformylierungsmechanismus von 5‐Formyl‐2′‐Desoxycytidin in Stammzellen

Contact Info

Product

Resources

About