Characteristics of the Karyotypes of three subfamilies of chironomids (Diptera, Chironomidae: Tanypodinae, Diamesinae, Prodiamesinae) of the world fauna

Petrova, N. A.; Zhirov, S. V.

doi:10.1134/s001387381402002x

Cited by 4 publications

(7 citation statements)

References 7 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Для цитогенетического анализа применяется быстрый метод приготовления давленых ацето-орсеиновых препаратов [Keyl, 1962;Michailova, 1989;Petrova, 1990Petrova, , 2013Kiknadze et al, 1991Kiknadze et al, , 1996. Параллельно с цитогенетическими препаратами необходимо готовить препарат внешней морфологии личинки, чтобы «связать» морфологию личинки с кариотипом и определить род и вид личинки.…”

Section: объекты цитотестированияunclassified

“…В современной таксономии Chironomidae успешно используются цитогенетические и морфологические особеннсти личинок [Michailova, 1989;Petrova, 1990;Kiknadze et al, 1991Kiknadze et al, , 1996Kiknadze et al, , 2016.…”

unclassified

“…Михаилова Интерфазные (политенные) хромосомы по размеру в 100 раз больше, чем обычные митотические, они являются результатом многократной репликации хромонем, которые не расходятся, а, благодаря полной соматической конъюгации материнского и отцовского гомологов, остаются в клетках слюнных желёз. Они характеризуются индивидуальной дисковой структурой и маркерами, специфичными для каждого вида [Michailova, 1989;Petrova, 1990;Kiknadze et al, 2016]. Цитогенетический анализ позволяет изучать как естественный, так и индуцированный мутагенез особи и популяции в целом.…”

unclassified

See 2 more Smart Citations

The use of salivary gland chromosomes of Chironomids (Diptera, Chironomidae) for assessing the pollution of aquatic ecosystems

Petrova

Michailova

2021

euroasentj

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Резюме. Обсуждается роль личинок хирономид в оценке степени загрязнения различных водных экосистем. Показано, что хирономиды чувствительны к любым загрязнениям окружающей среды, в том числе к загрязнениям тяжёлыми металлами, радионуклидами и др. В политенных хромосомах личинок хирономид появляются разнообразные структурные перестройки: наследственныe хромосомные аберрации и множество соматических аберраций. Особенно высока чувствительность маленькой хромосомы G, которая превращается в «помпоноподобную» хромосому -хороший биомаркер загрязнения тяжёлыми металлами. Предлагается использовать два индекса экологической оценки: соматический индекс для оценки реакции генома и цитогенетический индекс для оценки степени загрязнения водоёма. Как правило, аберрации локализуются на участках хромосом, богатых мобильными элементами или высоко повторяющимися последовательностями ДНК.Вместе со структурными аберрациями, тяжёлые металлы вызывают изменения в транскрипционной активности важных районов хромосом: ядрышка (ЯО) и колец Бальбиани (BR). В условиях стресса функциональная активность в этих районах снижается или полностью подавляется. Широкий спектр структурных и функциональных изменений в геноме хирономид также наблюдается в экспериментальных условиях после воздействия хрома (Cr), свинца (Рb), алюминия (Al) и других металлов. Рассматривается влияние радиационного загрязнения у ряда видов хирономид в Чернобыльской зоне. Появились новые хромосомные аберрации: инверсии, дупликации, добавочные хромосомы, увеличение контактов между теломерами разных хромосом. Значительно снижена транскрипционная активность ядрышка (ЯО) и BR. Все результаты, представленные в обзоре, демонстрируют надёжность цитогенетического подхода при анализе влияния факторов антропогенного загрязнения окружающей среды. Соматические аберрации и изменения транскрипционной активности важных участков хро-мосом могут быть успешно использованы в качестве биомаркеров для оценки состояния водных экосистем.

show abstract

Section: объекты цитотестированияunclassified

unclassified

See 1 more Smart Citation

The use of salivary gland chromosomes of Chironomids (Diptera, Chironomidae) for assessing the pollution of aquatic ecosystems

Petrova

Michailova

2021

euroasentj

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Chironomids in general have smaller genome size (100–200 Mb) compared to the average of dipterans and insects ( 19 , 20 ). On the contrary, most chironomid species have additional chromosomes (chironomids: 2 n = 6–16, mosquitoes: 2 n = 6, flies : 2 n = 6–8) ( 21 , 22 ). Several lineages even show large diversity in chromosome numbers within a single genus ( 22 ).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…On the contrary, most chironomid species have additional chromosomes (chironomids: 2 n = 6–16, mosquitoes: 2 n = 6, flies : 2 n = 6–8) ( 21 , 22 ). Several lineages even show large diversity in chromosome numbers within a single genus ( 22 ). These observations may imply a potential mechanism where chironomids genomes may have evolved through chromosomal rearrangements rather than genome enlargement and have utilized these additional genome resources for the environmental adaptations discussed above.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

High quality genome assembly of the anhydrobiotic midge provides insights on a single chromosome-based emergence of extreme desiccation tolerance

Yoshida

Shaikhutdinov

Козлова

et al. 2022

NAR Genomics and Bioinformatics

View full text Add to dashboard Cite

Non-biting midges (Chironomidae) are known to inhabit a wide range of environments, and certain species can tolerate extreme conditions, where the rest of insects cannot survive. In particular, the sleeping chironomid Polypedilum vanderplanki is known for the remarkable ability of its larvae to withstand almost complete desiccation by entering a state called anhydrobiosis. Chromosome numbers in chironomids are higher than in other dipterans and this extra genomic resource might facilitate rapid adaptation to novel environments. We used improved sequencing strategies to assemble a chromosome-level genome sequence for P. vanderplanki for deep comparative analysis of genomic location of genes associated with desiccation tolerance. Using whole genome-based cross-species and intra-species analysis, we provide evidence for the unique functional specialization of Chromosome 4 through extensive acquisition of novel genes. In contrast to other insect genomes, in the sleeping chironomid a uniquely high degree of subfunctionalization in paralogous anhydrobiosis genes occurs in this chromosome, as well as pseudogenization in a highly duplicated gene family. Our findings suggest that the Chromosome 4 in Polypedilum is a site of high genetic turnover, allowing it to act as a ‘sandbox’ for evolutionary experiments, thus facilitating the rapid adaptation of midges to harsh environments.

show abstract

Diptera and Drosophila Karyotype Databases: A Useful Dataset to Guide Evolutionary and Genomic Studies

2022

View full text Add to dashboard Cite

Karyotypes and chromosome data have been widely used in many subfields of biology over the last century. Unfortunately, this data is largely scattered among hundreds of articles, books, and theses, many of which are only available behind paywalls. This creates a barrier to new researchers wishing to use this data, especially those from smaller institutions or in countries lacking institutional access to much of the scientific literature. We solved this problem by building two datasets for true flies (Order: Diptera and one specific to Drosophila), These datasets are available via a public interactive database that allows users to explore, visualize and download all data. The Diptera karyotype databases currently contain a total of 3,474 karyotype records from 538 publications. Synthesizing this data, we show several groups are of particular interest for future investigations by whole genome sequencing.

show abstract

Characteristics of the Karyotypes of three subfamilies of chironomids (Diptera, Chironomidae: Tanypodinae, Diamesinae, Prodiamesinae) of the world fauna

Cited by 4 publications

References 7 publications

The use of salivary gland chromosomes of Chironomids (Diptera, Chironomidae) for assessing the pollution of aquatic ecosystems

The use of salivary gland chromosomes of Chironomids (Diptera, Chironomidae) for assessing the pollution of aquatic ecosystems

High quality genome assembly of the anhydrobiotic midge provides insights on a single chromosome-based emergence of extreme desiccation tolerance

Diptera and Drosophila Karyotype Databases: A Useful Dataset to Guide Evolutionary and Genomic Studies

Contact Info

Product

Resources

About