Cerebrospinal fluid microRNAs as diagnostic biomarkers in brain tumors

Kopková, Alena; Šána, Jiří; Fadrus, Pavel; Slabý, Ondřej

doi:10.1515/cclm-2017-0958

Cited by 36 publications

(35 citation statements)

References 39 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…The CSF contains cells, extracellular vesicles (EVs), and biomolecules such as proteins, nucleic acids, and metabolites. These biomolecules can be either associated with the cells or EVs 3, 4 or circulate freely within the fluid 8. Among these components, the microRNAs (miRNAs) have been attracting increasing attention in recent years 8, 9.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

A Comprehensive Study of Vesicular and Non-Vesicular miRNAs from a Volume of Cerebrospinal Fluid Compatible with Clinical Practice

Prieto-Fernández¹,

Aransay²,

Royo³

et al. 2019

Theranostics

View full text Add to dashboard Cite

Cerebrospinal fluid (CSF) microRNAs (miRNAs) have emerged as potential biomarkers for minimally invasive diagnosis of central nervous system malignancies. However, despite significant advances in recent years, this field still suffers from poor data reproducibility. This is especially true in cases of infants, considered a new subject group. Implementing efficient methods to study miRNAs from clinically realistic CSF volumes is necessary for the identification of new biomarkers. Methods : We compared six protocols for characterizing miRNAs, using 200-µL CSF from infants (aged 0-7). Four of the methods employed extracellular vesicle (EV) enrichment step and the other two obtained the miRNAs directly from cleared CSF. The efficiency of each method was assessed using real-time PCR and small RNA sequencing. We also determined the distribution of miRNAs among different CSF shuttles, using size-exclusion chromatography. Results : We identified 281 CSF miRNAs from infants. We demonstrated that the miRNAs could be efficiently detected using only 200 µL of biofluid in case of at least two of the six methods. In the exosomal fraction, we found 12 miRNAs that might be involved in neurodevelopment. Conclusion : The Norgen and Invitrogen protocols appear suitable for the analysis of a large number of miRNAs using small CSF samples.

show abstract

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

A Comprehensive Study of Vesicular and Non-Vesicular miRNAs from a Volume of Cerebrospinal Fluid Compatible with Clinical Practice

Prieto-Fernández¹,

Aransay²,

Royo³

et al. 2019

Theranostics

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Exogenous RNA, however, can interfere-via nonspecific hybridization or amplification-with the results of circulating miRNA quantification [30]. To increase miRNA extraction yield, pure glycogen can be used as an RNA carrier; it does not affect the quantification results [31,32].…”

Section: Circulating Micrornas: Origin and Meth-ods Of Detectionmentioning

confidence: 99%

Cell-free microRNAs as Non-invasive Diagnostic and Prognostic Biomarkers in Pancreatic Cancer

Gabło

Procházka

Kala

et al. 2020

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Pancreatic cancer (PaC) is one of the most lethal cancers, with an increasing global incidence rate. Unfavorable prognosis largely results from associated difficulties in early diagnosis and the absence of prognostic and predictive biomarkers that would enable an individualized therapeutic approach. In fact, PaC prognosis has not improved for years, even though much efforts and resources have been devoted to PaC research, and the multimodal management of PaC patients has been used in clinical practice. It is thus imperative to develop optimal biomarkers, which would increase diagnostic precision and improve the post-diagnostic management of PaC patients. Current trends in biomarker research envisage the unique opportunity of cell-free microRNAs (miRNAs) present in circulation to become a convenient, non-invasive tool for accurate diagnosis, prognosis and prediction of response to treatment. This review analyzes studies focused on cell-free miRNAs in PaC. The studies provide solid evidence that miRNAs are detectable in serum, blood plasma, saliva, urine, and stool, and that they present easy-to-acquire biomarkers with strong diagnostic, prognostic and predictive potential.

show abstract

“…Stejně jako u jiných typů nádorů se "tekuté bio psie" a jejich analýza zdají být slibným dia gnostickým přístupem. V případě mozkových nádorů je pozornost, především z důvodu existence hematoencefalické bariéry, zaměřena na mozkomíšní mok a jeho možné dia gnostické využití [4]. Vhodnými molekulami s potenciálem sloužit jako málo invazivní, dostatečně senzitivní a specifické bio markery se v tomto ohledu jeví být krátké nekódující RNA, především pak mikroRNA (miRNA), jejichž deregulované hladiny byly detekovány u řady nádorových onemocnění a jsou asociovány s bio logickými procesy zapojenými do maligní transformace.…”

Section: úVodunclassified

“…CSF je nejčastěji zpracováván při 500 g, 10 min, za laboratorní teploty. Navzdory tomu, že se miRNA zdají být stabilní v širokém rozmezí teplot, měly by být alikvoty skladovány při −80 °C [4].…”

Section: Metodické Přístupy Analýzy Mirna V Csfunclassified

MicroRNAs in Cerebrospinal Fluid as Biomarkers in Brain Tumor Patients

Kopková¹,

Šána²,

Večeřa³

et al. 2019

Klin Onkol

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Východiska: Ačkoli nádory centrální nervové soustavy (CNS) nepatří mezi nejčastější nádorová onemocnění, jejich incidence v posledních letech stále roste. Naneštěstí se tato skupina vyznačuje velmi špatnou prognózou. Výběr správné terapie záleží na včasné a přesné dia gnóze. Dia gnostické postupy v případě nádorů mozku jsou však často limitovány jejich lokalizací a značnou heterogenitou nádoru. Proto je věnováno velké úsilí hledání nových dia gnostických přístupů a bio markerů, které by byly dostatečně robustní, senzitivní a specifické, a jejichž analýza by ve vztahu k pacientovi eliminovala nutnost bio psie. Mozkomíšní mok (cerebrospinal fluid-CSF) přichází do přímého kontaktu s CNS a představuje proto vhodný bio logický materiál, který by mohl prostřednictvím bio markerů reflektovat její aktuální stav. Vhodnými molekulami se v tomto případě zdají být mikroRNA (miRNA), krátké nekódující RNA, které byly již několikrát detekovány v CSF a jejichž deregulované hladiny jsou asociované s různými typy nádorů CNS. Cíl: Bohužel metodické přístupy používané pro analýzy miRNA v CSF nebyly prozatím dostatečně standardizovány. Z těchto důvodů se v předkládaném přehledovém článku snažíme shrnout a zhodnotit doposud používané metodické přístupy k analýze miRNA z CSF s cílem nalézt ty nejvhodnější. Dále zde sumarizujeme výsledky studií popisující miRNA, které by mohly v budoucnu představovat bio markery různých nádorových onemocnění CNS.

show abstract

Cerebrospinal fluid microRNAs as diagnostic biomarkers in brain tumors

Cited by 36 publications

References 39 publications

A Comprehensive Study of Vesicular and Non-Vesicular miRNAs from a Volume of Cerebrospinal Fluid Compatible with Clinical Practice

A Comprehensive Study of Vesicular and Non-Vesicular miRNAs from a Volume of Cerebrospinal Fluid Compatible with Clinical Practice

Cell-free microRNAs as Non-invasive Diagnostic and Prognostic Biomarkers in Pancreatic Cancer

MicroRNAs in Cerebrospinal Fluid as Biomarkers in Brain Tumor Patients

Contact Info

Product

Resources

About