Caracterização estrutural e funcional das HSP70 no genoma do feijão comum (Phaseolus vulgaris): Uma análise in silico

Abstract

O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é a leguminosa mais importante em todo o mundo, com produção global estimada em 26,8 milhões de toneladas métricas em 2016, além de ser cultivado por suas vagens verdes, bem como por suas sementes secas. As plantas, de uma maneira geral, respondem a estresses ambientais com uma série de mecanismos de adaptação fisiológica e molecular. As proteínas de choque térmico (HSPs) são proteínas protetoras contra uma ampla gama de condições de estresse bióticos e abióticos e são proteínas altamente conservadas que ocorrem em todos os organismos na natureza. Foi demonstrado pela primeira vez que as HSP70 eram induzidas por altas temperaturas, mas nos últimos anos elas foram consideradas como proteínas responsivas ao estresse geral, que são induzidas por muitas condições de estresse abiótico. Outros estudos verificaram que as HSP70s são altamente expressas sob condições de calor, frio e estresse por seca. Sendo assim, o aumento da tolerância devido à alta expressão de HSP70s foi demonstrado em algumas espécies de plantas. Diversas ferramentas computacionais têm sido utilizadas para uma ampla análise do genoma in silico têm sido utilizadas para identificação de novas proteínas e genes. Embora as tecnologias ômicas tenham se tornado significativamente populares, são poucos os estudos sobre identificação e caracterização da HSP70 em Phaseolus vulgaris. Portanto, o objetivo do presente estudo foi realizar uma caracterização estrutural e identificação das HSP70 em Phaseolus vulgaris utilizando métodos computacionais de genoma amplo, sendo elas: análise fenética, análise de potencial alergênico e modelagem tridimensional das sequências.