Introducción. El control de enfermedades en diversos cultivos se hace en su mayoría por métodos de origen químico, los cuales para productores con cultivos de pequeña escala comercial resultan muy costos y por ende poco asequibles. El control biológico es una alternativa que puede ayudar en cuanto a la reducción de gastos y sostenibilidad ambiental, a su vez se hace uso de elementos propios o extraídos del mismo cultivo, como en este caso la cascara del cacao que se desperdicia normalmente. Objetivo. El objetivo de este estudio fue evaluar la fracción sana de mazorca y rendimiento después de la aplicación de dos tratamientos uno biológico y otro de síntesis química. Materiales y métodos. Este estudio se realizó en Santo Domingo, Antioquía (COL), en una finca de un pequeño productor de cacao, donde se seleccionaron 17 árboles en 3 lotes, se aplicó un control biológico correspondiente a un lixiviado combinado con el hongo Trichoderma spp., asperjado al árbol (n=6). Un tratamiento de síntesis química, inductor de resistencia (K 3 PO 3 ) inyectado en el tronco del árbol (n=5) y un control sin aplicación (n=6). Luego de la aplicación, se contaron las mazorcas sanas y enfermas y se registró el peso húmedo de las semillas durante un periodo de 2 meses en cada uno de los tratamientos. Resultados y conclusiones. No se encontró diferencia significativa en las fracciones de mazorcas sanas y el rendimiento, aun así, el control biológico mostró una mejora con relación al control, lo cual indica su potencial como una alternativa de bajo costo para plantaciones de pequeña escala.