Biodonut

Abstract

ResumoO surgimento dos sequenciadores automáticos de DNA por volta dos anos 1990 fez com que a quantidade de sequências e informações a serem analisadas aumentasse exponencialmente. Sendo assim, os recursos computacionais são cada vez mais exigidos em diversas tarefas de armazenamento desses dados. Para atender essas e outras necessidades, surgiu a Bioinformática, que engloba diversas áreas como Ciência da Computação, Matemática, Estatística, e a Biologia Molecular. Neste trabalho, desenvolvemos um software denominado Biodonut, que consiste em manipular plasmídeos utilizando visualização 2D e 3D. Biodonut é um produto de software de plataforma web, open source para que os pesquisadores possam manipular plasmídeos in silico, visualizando em formato 2D e 3D e possibilitando uma análise diferenciada das áreas julgadas importantes. A base de dados utilizada no software é o GenBank, por ser mundialmente conhecida e respeitada. Uma comparação com dois importantes softwares da área foi efetuada e é apresentada neste trabalho. Os resultados apontam que usar Biodonut é vantajoso em relação os outros dois softwares.