AgradecimentosAgradeço em especial a Professora Doutora Silvana Giuliatti pela orientação, compreensão, confiança, amizade, paciência, direcionamento e sabedoria.Aos meus pais Sirley Carmem Ferreira da Silva Torrieri e Silvio Torrieri, pelo amor incondicional, compreensão e incentivo.Ao meu irmão Raul Torrieri e sua esposa Patrícia Ruy, pelo incentivo e amizade.À minha avó Maria das Dores Costa Val, pelo amor, carinho e incentivo.À Priscilla, pela amizade, carinho, companheirismo e paciência.Aos amigos que fiz durante o período em que estive desenvolvendo meu trabalho, pelos momentos divididos juntos, pelas risadas, apoio e pela amizade que será para a vida toda.Aos colegas de laboratório Elvira R. Tamarozzi, Evandro Semighini Fabiano Santos, Iuliana Rodrigues, Maria Gabriela Rodrigues e Thaís C. Arns pelo companheirismo, apoio, amizade e pelas longas discussões filosóficas.À secretária do programa de Pós-Graduação em Genética, Susie Nalon, pela disponibilidade, suporte técnico e acadêmico.Aos membros da banca pelas contribuições, críticas e sugestões.Ao programa de Pós-graduação em Genética em especial ao então coordenador Dr.Ademilson Espencer Racci Soares.À USP e a Faculdade de Medicina, Ribeirão Preto pela oportunidade da realização do meu curso de Mestrado.Aos órgãos de fomento CAPES e FAEPA pelo apoio financeiro durante o desenvolvimento do projeto "A dúvida é o principio da sabedoria."
Aristóteles
ResumoAs Mucopolissacaridoses (MPS) são um grupo de doenças de armazenamento lisossômico causadas por deficiência de enzimas que catalisam a degradação gradual das glicosaminoglicanas (GAGs). GAGs (anteriormente chamadas de mucopolissacarídeos) são produtos de degradação das proteoglicanas que existem na matriz extracelular e tem efeito proteolítico. A classificação das MPS é baseada na deficiência enzimática específica.A MPS IVA é causada por mutações no gene que codifica a enzima GALNS (Nacetilgalactosamina-6-sulfatase), a qual desempenha um papel crucial na degradação do sulfato de queratano e condroitina-6-sulfatase. As mutações na enzima se resumem em três categorias: interrupção do sítio ativo, alterações no núcleo hidrofóbico e exposição da superfície, onde mutações missense na estrutura podem afetar gravemente a atividade da proteína GALNS, alterando seu núcleo hidrofóbico ou modificando seu enovelamento (folding). Com a falta de tratamentos efetivos, sendo em sua maioria paliativos, e tendo como base a estrutura já resolvida da GLANS selvagem, este trabalho teve como objetivo modelar 3 variantes da enzima GALNs, sendo uma mutação no sítio ativo, uma no núcleo hidrofóbico e uma na superfície. Foi usado o software MODELLER 9.12 para a modelagem comparativa, os softwares Prochek, PROSA II, ERRATv2, Verify3d, ProQ para a avaliação dos modelos, o software NAND 2.10, para simulação de dinâmica molecular e o software Chimera 1.10.1 para cálculo de superfícies eletrostáticas e hidrofobicidade da superfície.Os modelos apresentaram bons resultados segundo os softwares de avaliação e análise visual. Apresentaram p...