SUMMARY:The relationship between fish larvae and their zooplanktonic prey has not been fully explored for late-stage larvae of coral-reef fish in lagoonal environments. However, compared to most temperate taxa, these larvae are characterized by strong sensory and swimming abilities, which may influence their feeding behaviour in the water column. The present study aims to determine the relative importance of the water column and zooplankton variables for the structure of pre-settlement larval fish assemblages within a single season in three bays of the coral reef lagoon of New Caledonia, southwest Pacific. The structure of larval assemblages was found to be explained better by water column variables in two out of the three bays examined. Zooplankton variables only played a role in one bay out of the three, probably due to the lower variability in the water column variables. Moreover, the relationship between total larval fish abundance and zooplankton density was not significant in any of the three bays. These results suggest that the relationship between late-stage coral-reef fish larvae and their prey: 1) is difficult to detect at small spatial and temporal scales, 2) is probably complex and non-linear, 3) depends on environmental conditions, and 4) probably varies between fish taxa.Keywords: late-stage coral-reef fish larvae, zooplanktonic prey, water column properties, bays, spatial and temporal scale. -La relación entre las larvas de peces y sus presas zooplanctónicas sigue siendo poco estudiada para las larvas en últimas fases de desarrollo de peces coralinos en ambientes lagunares. Además estas larvas se caracterizan por tener grandes habilidades natatorias y sensoriales respecto a la mayoría de peces en mares templados, habilidades que pueden influenciar su comportamiento alimenticio en la columna de agua. El presente estudio tiene como objetivo determinar la importancia relativa de las variables de la columna de agua y del zooplancton sobre la estructura de las larvas de peces próximas al asentamiento durante una única estación y en tres bahías de la laguna coralina de Nueva-Caledonia en el Pacífico sur. La estructura de los grupos de larvas de peces se explica mejor por las variables de la columna de agua en dos de las tres bahías estudiadas, pero las variables zooplanctónicas desempeñan un papel importante en la tercera bahía, seguramente debido a la mayor variabilidad de las condiciones de la columna de agua. La relación entre la abundancia total de las larvas de peces y la densidad total del zooplancton no fue significativa en ninguna de las tres bahías. Estos resultados sugieren que la relación entre las larvas de peces coralinos en última fase de desarrollo y sus presas es 1) difícilmente detectable a tan pequeña escala espacial y temporal, 2) probablemente compleja y no lineal, 3) variable según las condiciones medioambientales y 4) probablemente variable según los taxones.Palabras clave: larvas de peces coralinos en última fase de desarrollo, presas zooplanctónicas, propiedades de la columna de ...