Bacterial Acyl-CoA Mutase Specifically Catalyzes Coenzyme B12-dependent Isomerization of 2-Hydroxyisobutyryl-CoA and (S)-3-Hydroxybutyryl-CoA

Engineered and Native Coenzyme B12-dependent Isovaleryl-CoA/Pivalyl-CoA Mutase

“…Structure-based Redesign of IcmF-Our efforts at enhancing the catalytic activity of IcmF with isovaleryl-CoA as substrate were guided by sequence comparisons of IcmF with other acylCoA mutases (10,11) and by the crystal structures of IcmF (17) and MCM (16,22). Sequence comparisons revealed the presence of a putative acyl-CoA mutase annotated as MCM-like in which Leu and Asn substitute Phe-598 and Gln-742, respectively, in IcmF ( Fig.…”

“…In contrast to wild-type MCM, the double mutant bound the ICM substrates, n-butyryl-CoA and isobutyryl-CoA, but instead of catalyzing their isomerization, promoted inactivation via a suicidal internal electron transfer mechanism. Among the mutants characterized in this study, the F598I IcmF resembles HCM with Ile-598 and Gln-742 corresponding to Ile-90 and Gln-208 in HCM (11). Therefore, we examined the possibility that F598I IcmF exhibits HCM activity.…”

“…2A) (11)(12)(13)15), which can be located in the crystal structures of MCM (16) and CmIcmF (17) (Fig. 2B).…”

Éter típusú üzemanyag-adalékok mikrobiális bontása

“…A fehérje egy 55 kDa-os, hidroxiláz aktivitású (MdpJ), és egy 38 kDa-os oxidoreduktáz aktivitású alegységből (MdpK) épül fel. A 2-HIBA-t, a működéséhez kobalamint igénylő, 2-hidroxiizobutiril-KoA mutáz (Hcm) enzim (S)-3-hidroxibutiril-KoA-vá alakítja reverzibilis reakcióban, ami azután a központi anyagcsere-útvonalakon keresztül alakul tovább [124]. A két alegységes enzim egy nagyobb, szubsztrátkötő (HcmA), és egy kisebb kobalaminkötő alegységből (HcmB) áll, melyeket a hcmA, ill. a hcmB gének kódolnak.…”

“…A 2-HIBA metabolizmusa a PM1-ben nagy valószínűség szerint szintén az L108-nál leírtak szerint játszódik le. Erre utal, hogy az L108 Hcm alegységeit kódoló gének (hcmA és hcmB) nagymértékű azonosságot (>97%) mutatnak a PM1 homológjaival (mdpO/R), és a gének elrendeződése is megegyezik a két törzsben [118,124,136]. A teljes transzkriptom vizsgálata során az mdpO/R géneken kívül két másik gén indukcióját is kimutatták MTBEn nőtt sejtekben, melyek valószínűsíthetően szintén a 2-HIBA lebontási útvonalában vesznek részt: az acil-KoA szintetázét (2-HIBA-KoA ligáz) (mdpP) és a 3-hidroxibutirilKoA dehidrogenázét (mdpX) [134].…”