Associations between genetic variants of the insulin-like growth factor I (IGF-I) gene and growth traits in European sea bass (Dicentrarchus labrax, L.)

Gökçek, Emel Özcan; Işık, Raziye

doi:10.1007/s10695-020-00779-8

Cited by 14 publications

(5 citation statements)

References 39 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Screening the molecular markers closely related to growth traits for direct breeding can avoid the limitations of inaccurate environmental and phenotypic measurement and improve the success rate of breeding [ 34 ]. igf2 is a candidate gene for the selection of growth traits [ 2 , 8 ]. Some SNPs associated with growth-related traits have been screened and detected in IGF2 of pigs and cattle [ 33 , 35 , 36 ].…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

“…In mammals, IGF2 is an evolutionarily conserved peptide hormone with structural homology to proinsulin [ 6 ]. As an important protein hormone in the growth hormone (GH)/IGF axis, Igf2 can transport GH, promote glucose transport into muscle, and regulate the proliferation, differentiation, and survival of cells in fish and mammals [ 3 , 7 , 8 ].…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…Few studies have reported the association between SNPs and growth traits in fish. For instance, in European seabass ( Dicentrarchus labrax L.), two SNPs from igf1 are associated with body weight and total length (TL) [ 8 ]. In Atlantic salmon ( Salmo salar ), two SNP loci in igf1 are associated with body weight [ 20 ].…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

See 2 more Smart Citations

Molecular Cloning, Screening of Single Nucleotide Polymorphisms, and Analysis of Growth-Associated Traits of igf2 in Spotted Sea Bass (Lateolabrax maculatus)

Fan

Wang

Zhao

et al. 2023

Animals

View full text Add to dashboard Cite

The insulin-like growth factor 2 gene (igf2) is thought to be a key factor that could regulate animal growth. In fish, few researchers have reported on the single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in igf2 and their association with growth traits. We screened the SNPs of igf2 from the spotted sea bass (Lateolabrax maculatus) by Sanger sequencing and made an association between these SNPs with growth traits. The full-length complementary (c) DNA of igf2 was 1045 bp, including an open reading frame of 648 bp. The amino acid sequence of Igf2 contained a signal peptide, an IGF domain, and an IGF2_C domain. Multiple sequence alignment showed that the IGF domain and IGF2_C domain were conserved in vertebrates. The genome sequence of igf2 had a length of 6227 bp. Fourteen SNPs (13 in the introns and one in one of the exons) were found in the genome sequence of igf2. Four SNPs located in the intron were significantly associated with growth traits (p < 0.05). These results demonstrated that these SNPs could be candidate molecular markers for breeding programs in L. maculatus.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

Molecular Cloning, Screening of Single Nucleotide Polymorphisms, and Analysis of Growth-Associated Traits of igf2 in Spotted Sea Bass (Lateolabrax maculatus)

Fan

Wang

Zhao

et al. 2023

Animals

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…On account of the low selection pressure for the promoter and intronic regions, the polymorphism sites in those two regions were more frequent than in the exonic regions [43,44]. Regardless, in non-coding regions, SNPs were involved in influencing phenotypic variation and regulating gene expression [45][46][47].…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Functional Characterization of the Almstn2 Gene and Its Association with Growth Traits in the Yellowfin Seabream Acanthopagrus latus (Hottuyn, 1782)

Guo,

Chen

et al. 2023

Genes

View full text Add to dashboard Cite

Myostatin (mstn), also known as GDF8, is a growth and differentiation factor of the transforming growth factor-β (TGF-β) superfamily and plays a key inhibitory effect in the regulation of skeletal muscle development and growth in vertebrates. In the present study, to comprehend the role of the mstn2 gene of the yellowfin seabream Acanthopagrus latus (Almstn2b), the genomic sequence of Almstn2b is 2359 bp, which encodes 360 amino acids and is composed of three exons and two introns, was obtained. Two typical regions, a TGF-β propeptide and TGF-β domain, constitute Almstn2b. The topology indicated that Almstn2 was grouped together with other Perciformes, such as the gilthead seabream Sparus aurata. Moreover, Almstn2b was mainly expressed in the brain, fins, and spleen. Furthermore, five SNPs, one in the exons and four in the introns, were identified in the Almstn2b gene. The allele and genotype frequencies of SNP-Almstn2b +1885 A/G were significantly related to the total weight, interorbital distance, stem length, tail length, caudal length, caudal height, body length, and total length (p < 0.05). The allele and genotype frequencies of SNP-Almstn2b +1888 A/G were significantly related to the weight, interorbital distance, long head behind the eyes, body height, tail length, caudal length, and body length. Additionally, the relationship between the SNP-Almstn2b +1915 A/G locus and weight and long head behind the eyes was significant (p < 0.05). Furthermore, the other two SNPs were not significantly associated with any traits. Thus, the SNPs identified in this study could be utilized as candidate SNPs for breeding and marker-assisted selection in A. latus.

show abstract

“…В 5´UTR-области гена IGF-I обнаружена связь (р < 0,05) между SNP g.46749C > T и массой тела, общей длиной, а также между SNP g.46672A > G и общей длиной (р < 0,05). Особи с генотипами GG (локус IGF-II-NdeI) имели более высокие значения массы тела и общей длины (р < 0,05), чем рыбы с генотипом TG (102,103). В целом, результаты исследований подчеркивают важность системы IGF в опосредованном влиянии на рост и развитие рыб и показывают возможность использования генов IGF-I и IGF-II в качестве генетических маркеров при разведении объектов аквакультуры.…”

Section: ассоциации полиморфизмов генов Igf-i и Igf-ii с показателями...unclassified

CANDIDATE GENES PROMISING FOR MARKER-ASSISTED SELECTION IN AQUACULTURE (review)

Pisarenko

2023

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

Современная аквакультура относится к стремительно развивающимся отраслям мирового производства, дает полноценную пищевую продукцию, которая служит источником животного белка и содержит незаменимые аминокислоты, жиры, витамины, минеральные вещества и ферменты. Это направление важно для решения проблемы продовольственной безопасности. В России товарное рыбоводство по объему пока что существенно уступает промышленному. Перспективный подход в научном сопровождении товарной аквакультуры -поиск полиморфных локусов в генахкандидатах и выявление достоверных ассоциаций между различными генотипами и показателями продуктивности для последующей маркерной селекции (marker-assisted selection, MAS) объектов товарной аквакультуры. Целью представленного обзора стало обобщение и анализ публикаций, касающихся однонуклеотидных замен (single nucleotide polymorphism, SNP) в генах, влияющих на размер и показатели массы у рыб. Масса тела относится к экономически важным признакам, по которым ведется отбор в рыбоводческих хозяйствах. Она зависит от роста скелетных мышц, поэтому гены, влияющие на рост и развитие мышечной ткани, рассматриваются в качестве потенциальных генов-кандидатов. К наиболее важным из них относятся гены миостатина (MSTN), инсулиноподобных факторов роста I и II (IGF-I, IGF -II), гормона роста (GH) и рецептора гормона роста (GHR) (X.Y. Dai с соавт., 2015; D.L. Li с соавт., 2014). При оценке влияния генов-кандидатов на определенный признак сначала исследуются полиморфизмы в этих генах, а затем проводится статистическая оценка взаимосвязи между специфическими аллелями/генотипами и фенотипической экспрессией интересующего признака. Если обнаружены достоверные ассоциации, это считается доказательством того, что ген либо непосредственно участвует в генетическом контроле признака, либо функциональный полиморфизм расположен достаточно близко к маркеру и два локуса находятся в неравновесном сцеплении (M. Lynch и B. Walsh, 1997; D.L. Yowe и R.J. Epping, 1995). Миостатин играет важную роль в ингибировании роста и развития мышц. У большинства млекопитающих потеря или инактивация миостатина (MSTN/) обусловливает увеличение размера и числа миоволокон, что приводит к наращиванию мышечной массы (A. Clop с соавт., 2006; L. Grobet с соавт., 1997; D.S. Mosher с соавт., 2007; S. Rao с соавт., 2016). Гены инсулиноподобных факторов роста I и II кодируют соответствующие полипептидные гормоны, которые имеют молекулярную структуру, сходную с проинсулином, и играют важную роль в регуляции процессов роста, развития и дифференцировки клеток и тканей у позвоночных (J.I. Jones с соавт., 1995; M. Codina с соавт., 2008). Инсулиноподобные факторы роста I и II -важнейшие эндокринные посредники действия соматотропного гормона, они синтезируются в печени и скелетных мышцах, а также в других тканях (W.J. Tao и E.G. Boulding, 2003; K.M. Reindl с соавт., 2011). Гормон роста, или соматотропин, -это полипептидный гормон, который синтезируется в соматотропных клетках гипофиза и играет важную роль в регуляции соматического роста рыб (J.I. Johnsson и B.T. Björ...

show abstract

Associations between genetic variants of the insulin-like growth factor I (IGF-I) gene and growth traits in European sea bass (Dicentrarchus labrax, L.)

Cited by 14 publications

References 39 publications

Molecular Cloning, Screening of Single Nucleotide Polymorphisms, and Analysis of Growth-Associated Traits of igf2 in Spotted Sea Bass (Lateolabrax maculatus)

Molecular Cloning, Screening of Single Nucleotide Polymorphisms, and Analysis of Growth-Associated Traits of igf2 in Spotted Sea Bass (Lateolabrax maculatus)

Functional Characterization of the Almstn2 Gene and Its Association with Growth Traits in the Yellowfin Seabream Acanthopagrus latus (Hottuyn, 1782)

CANDIDATE GENES PROMISING FOR MARKER-ASSISTED SELECTION IN AQUACULTURE (review)

Contact Info

Product

Resources

About