Cowcod (Sebastes levis) is a member of a northeastern Pacific Ocean species flock that experienced extensive fishery exploitation. Factors that could produce structure in cowcod include a major biogeographic boundary within cowcod's geographical distribution; severe declines in abundance, potentially, resulting in reductions in effective population size and divergence owing to genetic drift; and dependence on patchily distributed habitat. We examine the following two questions: (i) is there subdivision present and, if so, is it concordant with the two marine biogeographic regions separated by Point Conception, and (ii) have cowcod experienced loss of genetic variation owing to population size reduction? Coarse-scale genetic and otolith analyses indicated regional structure across Point Conception. However, analysis of 24 microsatellite DNA loci revealed as many as three cryptic, divergent lineages (F CT = 0.194) that meet south of Point Conception. The two southern lineages had higher growth rate than the northerly distributed lineage. In general, cowcod is the least genetically diverse of ϳ10 rockfishes surveyed with the same markers, but the recent substantial declines in abundance were not reflected by recent genetic bottleneck analyses.Résumé : Sebastes levis fait partie d'un groupe d'espèces du nord-est de l'Océan Pacifique ayant fait l'objet d'une vaste exploitation. Les facteurs qui peuvent être cause de structure pour ce poisson comprennent la présence d'une importante limite biogéographique à l'intérieur de son aire de répartition, des baisses drastiques de son abondance découlant éventuellement de diminutions de la taille effective de la population et d'une divergence causée par une dérive génétique, ainsi que du recours à des habitats dont la distribution est parcellaire. Nous nous sommes intéressés aux deux questions suivantes : (i) existe-t-il une subdivision et, le cas échéant, concorde-t-elle avec les deux régions biogéographiques marines séparées par la pointe Conception, et (ii) la variation génétique de S. levis a-t-elle diminué en raison d'une diminution de la taille de sa population? Des analyses génétiques à grande échelle et d'otolites de S. levis indiquent la présence d'une structure régionale de part et d'autre de la pointe Conception. Cependant, l'analyse de 24 microsatellites d'ADN révèle jusqu'à trois lignées cryptiques divergentes (F CT = 0,194) se rencontrant au sud de la pointe Conception. Les deux lignées plus au sud présentent un taux de croissance plus élevé que la lignée de répartition plus nordique. En général, des quelques 10 espèces de sébastes étudiées à l'aide des mêmes marqueurs, S. levis est la moins diversifiée sur le plan génétique, bien que des analyses visant à déterminer la présence de goulots d'étranglement génétiques récents ne reflètent pas les baisses d'abondance récentes. [Traduit par la Rédaction]