Analysis of a <i>Pst</i> I polymorphism of the human erythrocyte band 3 gene (EPB3)

Jenkins, Patricia B.; Gallagher, Patrick G.; Forget, Bernard G.

doi:10.1111/j.1365-2141.1993.tb03232.x

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“…En este sentido la población costarricense en general, se caracteriza por ser una mezcla trihíbrida, compuesta en su mayoría de genes de origen europeo, amerindio y en menor grado de origen africano de acuerdo a la zona de procedencia (Morera et al 2001(Morera et al , 2003. Con relación a las frecuencias alélicas, la población del Valle Central muestran una mayor proporción de individuos con el alelo 2 que los otros grupos étnicos estudiados; este resultado demuestra que habrá una mayor proporción de individuos heterocigotas y homocigotas para el alelo 2 en el Valle Central, como un reflejo a la mayor cantidad de individuos con una clara ancestría europea en esta región, ya que los resultados concuerdan con los obtenidos por Jenkins et al (1993) en poblaciones europeas. El Valle Central presenta la mayor densidad de individuos por km 2 de Costa Rica, favoreciendo con ello, una mayor presencia de cruces al azar dentro de la población; proporcionando así el aumento de individuos heterocigotas para ciertos alelos dentro de la población.…”

Section: Discussionunclassified

“…La amplificación del ADN y el análisis de restricción de PstI se hizo de acuerdo a Jenkins (1993), el cual permite la identificación de los alelos, el primero produce una banda de 1.375 kb; el segundo alelo produce dos bandas una de 0.975 kb y una de 0.4 kb.…”

Section: Materials Y Métodosunclassified

“…Se han descrito muchas mutaciones que incluyen codones de terminación prematura o codones de terminación que son el resultado de deleciones e inserciones que producen ARNm inestables o bandas 3 truncadas que no pueden plegarse correctamente en la membrana celular; otros tipos de mutaciones son sustituciones de un aminoácido en posiciones conservadas o deleciones dentro de una cadena de aminoácidos conservados (Maillet et al 1995). Muchas variantes se han descrito dentro del gen de la banda 3 entre ellas la Memphis (Yannoukakos et al 1991, Tuscaloosa ) y el polimorfismo Pst I (Jenkins et al 1993).…”

unclassified

“…Entre los exones 2 y 3 se halla una región de 1.5 kb en el extremo 5' del gen, esta región contiene un fragmento BamH1 de 1.1 kb que incluye el polimorfismo Pst 1 (Jenkins et al 1993). Estudios de este polimorfismo en grupos humanos muestran frecuencias alélicas para poblaciones de ancestría europea de 0.8 para el alelo 1 y 0.2 para el alelo 2, y para individuos de ancestría africana de 0.46 (alelo 1) y 0.54 (alelo 2) (Jenkins et al 1993).…”

unclassified

“…Estudios de este polimorfismo en grupos humanos muestran frecuencias alélicas para poblaciones de ancestría europea de 0.8 para el alelo 1 y 0.2 para el alelo 2, y para individuos de ancestría africana de 0.46 (alelo 1) y 0.54 (alelo 2) (Jenkins et al 1993).…”

unclassified

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Polimorfismo del gen de la banda 3 eritrocítica en grupos étnicos de Costa Rica

Chaves-Villalobos

Jiménez-Arce

Sandí-Díaz

2014

RBT

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fax (506) 223-1385. La proteína banda 3 eritrocítica (AE1) es una de las proteínas transmembrana mejor estudiada en las células de mamíferos, debido principalmente a su papel en el transporte de CO 2 de los tejidos a la sangre y a la descarga del CO 2 de la sangre a los pulmones, ayudando así a prevenir cambios en el pH del citosol (Berne et al. 1993), además por su abundancia en el eritrocito humano donde se presenta en 1.2 x 10 6 copias por eritrocito (Delaunay 1995).Su función es el intercambio aniónico cloruro / bicarbonato (AE1), presenta un peso molecular entre los 90 000 y 100 000 daltons (Jay et al. 1986) y se expresa principalmente en eritrocitos; no obstante se ha determinado la presencia de AE1 en otras células como las α-intercalares de los túbulos distales del riñón (Bruce et al. 1998) y en las neuronas (Marguerite et al. 1991).La proteína banda 3 esta conformada por 911 aminoácidos distribuidos en tres segmentos proteicos, el primero de ellos es un dominio transmembranal (posición 404-883) constituido por 14 segmentos responsables del intercambio cloruro-bicarbonato en la célula; los otros dos segmentos son dominios citoplasmáticos en los extremos amino y carboxilo terminales (posición 1-403 y 884-911, respectivamente), estos son sitios de anclaje de varias proteínas del citoesqueleto como la α-espectrina, β-espectrina, ankyrina, la hemoglobina y las proteínas denominadas banda 4.1 y 4.2 (Delaunay 1995). Por lo que mutaciones en dichos sitios se han asociado a trastornos del eritrocito, como esferocitosis hereditaria y ovalocitosis (Palek 1990).El gen AE1 fue mapeado en la región cromosómica 17q21-qter (Lux et al. 1989, Showe

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Section: Discussionunclassified

Section: Materials Y Métodosunclassified

unclassified

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Polimorfismo del gen de la banda 3 eritrocítica en grupos étnicos de Costa Rica

Chaves-Villalobos

Jiménez-Arce

Sandí-Díaz

2014

RBT

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A variant of the EPB3 gene of the anti‐Lepore type in hereditary spherocytosis

et al. 1997

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Summary.The EPB3 gene encodes band 3 (anion exchanger 1) of the red cell membrane. A subset of hereditary spherocytosis (HS) is associated with EPB3 gene mutations and band 3 deficiency. We report a large Italian family in which 10 of the 27 members investigated displayed an autosomal dominant HS. SDS-PAGE revealed a reduction in band 3 in the patients. Screening of the Pst I polymorphic site confirmed the linkage of HS with the EPB3 gene. Analysis of complementary and genomic DNA showed a large additional segment. Nucleotide sequencing disclosed an in-frame duplication of 69 nucleotides (nt) including a triplet of intronic origin and a genuine exonic duplication of 66 nt. Two CCTGC sequences occurred close to one another, one near the intron 12 acceptor splice site (nt ¹7 to ¹3), and the other within exon 13 (nt 1494-1498). We assumed that the abnormal allele arose from an unequal recombination event of the anti-Lepore type between the two CCTGC sequences.At the level of the mutated protein, termed band 3 Milano, the additional segment (Gln plus duplication of residues 478-499) corresponded to the last part of the third transmembrane domain (TM3), the entire second outer loop and part of TM4 as it is currently defined in hydropathy analysis. After deglycosylation of band 3, only the normal band was detected, supporting the view that band 3 Milano is probably not incorporated into the membrane.Keywords: erythrocyte membrane, band 3 protein, hereditary spherocytosis, congenital haemolytic anaemia, DNA duplication.The gene (EPB3) encoding red cell band 3 (anion exchanger 1) maps to 17q21-qter and contains 20 exons (Sahr et al, 1994;Schofield et al, 1994). The size of band 3 mRNA is 4 . 9 kb.Band 3 is the most abundant protein (1 200 000 monomers per cell) of the erythrocyte membrane and plays a key role in maintaining the membrane integrity (Tanner, 1993). The N-terminal cytoplasmic domain (403 amino acids) (Tanner et al, 1988;Lux et al, 1989) anchors the cytoskeleton to the membrane integral domain through interactions with ankyrin and protein 4.2. The transmembrane domain consists of 14 membrane-spanning segments (TM 1-14) connected by inner and outer loops (IL and OL respectively) (Lux et al, 1989).Hereditary spherocytosis (HS), a common haemolytic disorder characterized by a wide heterogeneity at the clinical, biochemical and genetic level , has been related to abnormalities of band 3 as well as those of other red cell membrane proteins such as ankyrin, spectrin and protein 4.2 (Lux & Palek, 1995). HS due to band 3 deficiency has an autosomal dominant mode of transmission and is characterized by mild to moderate anaemia. In most cases the reduction of band 3 amounts to 20-40% and is associated with a secondary decrease in protein 4.2. Several band 3 mutations have recently been detected in HS (Alloisio et al, 1993(Alloisio et al, , 1996Jarolim et al, 1994a Jarolim et al, , b, 1995Maillet et al, 1995;Miraglia del Giudice et al, 1995;Eber et al, 1996;Jenkins et al, 1996). We describe a large HS family in which ...

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Autosomal Dominant Distal Renal Tubular Acidosis Is Associated in Three Families with Heterozygosity for the R589H Mutation in the AE1 (Band 3) Cl−/HCO3−Exchanger

Jarolím¹,

Shayakul²,

Prabakaran³

et al. 1998

Journal of Biological Chemistry

173

138

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Distal renal tubular acidosis (dRTA) is characterized by defective urinary acidification by the distal nephron. Cl ؊ /HCO 3؊ exchange mediated by the AE1 anion exchanger in the basolateral membrane of type A intercalated cells is thought to be an essential component of lumenal H ؉ secretion by collecting duct intercalated cells. We evaluated the AE1 gene as a possible candidate gene for familial dRTA. We found in three unrelated families with autosomal dominant dRTA that all clinically affected individuals were heterozygous for a single missense mutation encoding the mutant AE1 polypeptide R589H. Patient red cells showed ϳ20% reduction in sulfate influx of normal 4,4-diisothiocyanostilbene-2,2-disulfonic acid sensitivity and pH dependence. Recombinant kidney AE1 R589H expressed in Xenopus oocytes showed 20 -50% reduction in Cl ؊ /Cl ؊ and Cl ؊ /HCO 3 ؊ exchange, but did not display a dominant negative phenotype for anion transport when coexpressed with wildtype AE1. One apparently unaffected individual for whom acid-loading data were unavailable also was heterozygous for the mutation. Thus, in contrast to previously described heterozygous loss-of-function mutations in AE1 associated with red cell abnormalities and apparently normal renal acidification, the heterozygous hypomorphic AE1 mutation R589H is associated with dominant dRTA and normal red cells.

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Analysis of a Pst I polymorphism of the human erythrocyte band 3 gene (EPB3)

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Polimorfismo del gen de la banda 3 eritrocítica en grupos étnicos de Costa Rica

Polimorfismo del gen de la banda 3 eritrocítica en grupos étnicos de Costa Rica

A variant of the EPB3 gene of the anti‐Lepore type in hereditary spherocytosis

Autosomal Dominant Distal Renal Tubular Acidosis Is Associated in Three Families with Heterozygosity for the R589H Mutation in the AE1 (Band 3) Cl−/HCO3−Exchanger

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